RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492283.1

RBMS1-215, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, human

TSL 5

Gene RBMS1, Length 606 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBMS1-215	ENST00000492283	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	SMC5	Q8IY18	1101 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	APPBP2	Q92624	585 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	EHD4	Q9H223	541 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	PLCD1	P51178	756 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	LHX8	Q68G74	356 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	EVI5L	Q96CN4	794 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	MYH7	P12883	1935 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	USP17L12	C9JPN9	530 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	USP17L21	D6R901	530 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	GH2	P01242	217 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	CHGB	P05060	677 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	GNAT2	P19087	354 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	13.8	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	SHH	Q15465	462 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	DOCK1	Q14185	1865 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	C19orf81	C9J6K1	198 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	HMGCS2	P54868	508 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	NUCB1	Q02818	461 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	TREML2	Q5T2D2	321 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	USP38	Q8NB14	1042 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	RILPL2	Q969X0	211 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	WDR18	Q9BV38	432 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	DNAJC18	Q9H819	358 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	SWAP70	Q9UH65	585 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	PNMA3	Q9UL41	463 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	USP17L10	C9JJH3	530 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	GPAA1	O43292	621 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	CYP2D6	P10635	497 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	TDO2	P48775	406 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	OSBP2	Q969R2	916 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	FEZ1	Q99689	392 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBMS1-215	ENST00000492283	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	CYP2B6	P20813	491 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	BACE1	P56817	501 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	MTMR2	Q13614	643 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	C12orf60	Q5U649	245 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	SHMT1	P34896	483 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	JAG1	P78504	1218 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	CTR9	Q6PD62	1173 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	CCDC17	Q96LX7	622 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283		M0R2C6	588 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	CDK8	P49336	464 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	USP14	P54578	494 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	GABPA	Q06546	454 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	NAPB	Q9H115	298 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBMS1-215	ENST00000492283	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		13.75	□□□□□ -0.21

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