RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 SFRP5Q5T4F7 317 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 RNF141Q8WVD5 230 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 VWCEQ96DN2 955 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 TRIM55Q9BYV6 548 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 ST7Q9NRC1 585 aa5.06□□□□□ -1.6
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RABGGTB-211ENST00000489450 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC12A7Q9Y666 1083 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 C9IYK1 514 aa5.05□□□□□ -1.6
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RABGGTB-211ENST00000489450 ITIH2P19823 946 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 CYP7A1P22680 504 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 PMS1P54277 932 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 OXCT1P55809 520 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 RAB33AQ14088 237 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 Q96M66 194 aa5.05□□□□□ -1.6
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RABGGTB-211ENST00000489450 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 LEMD3Q9Y2U8 911 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 CYP26A1O43174 497 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 TP53P04637 393 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 LRP8Q14114 963 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 GNPTABQ3T906 1256 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 LCE3BQ5TA77 95 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 VHLLQ6RSH7 139 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 NBPF11Q86T75 865 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 KLHL6Q8WZ60 621 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 DHRS1Q96LJ7 313 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 ASPNQ9BXN1 380 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 LNPKQ9C0E8 428 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 PIM2Q9P1W9 311 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 CECR2Q9BXF3 1484 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 GNAT3A8MTJ3 354 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 DDAH1O94760 285 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 GJB6O95452 261 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 CEACAM5P06731 702 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 KIR3DL1P43629 444 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 RNF4P78317 190 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC7A5Q01650 507 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 TNK2Q07912 1038 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 FXNQ16595 210 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 DDR2Q16832 855 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 NBPF6Q5VWK0 638 aa5.03□□□□□ -1.6
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RABGGTB-211ENST00000489450 KIAA1211LQ6NV74 962 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 C22orf34Q6ZV56 151 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC51AQ86UW1 340 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM178BQ8IXR5 827 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 MFSD4AQ8N468 514 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 DTWD2Q8NBA8 298 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 COX4I2Q96KJ9 171 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 NBPF4Q96M43 638 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 FBXL18Q96ME1 805 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 PLAGL2Q9UPG8 496 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-211ENST00000489450 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
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RABGGTB-211ENST00000489450 FOSL1P15407 271 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 SERINC3Q13530 473 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 NKPD1Q17RQ9 610 aa5.02□□□□□ -1.61
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RABGGTB-211ENST00000489450 CDKAL1Q5VV42 579 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 SPACA3Q8IXA5 215 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 OSBPL2Q9H1P3 480 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 CCDC85CA6NKD9 419 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
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RABGGTB-211ENST00000489450 CBFA2T2O43439 604 aa5.01□□□□□ -1.61
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RABGGTB-211ENST00000489450 BBS9Q3SYG4 887 aa5.01□□□□□ -1.61
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RABGGTB-211ENST00000489450 DPH6Q7L8W6 267 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 TMC3Q7Z5M5 1100 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 HAUS7Q99871 368 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 PRDM14Q9GZV8 571 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 MKNK2Q9HBH9 465 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 SIRPGQ9P1W8 387 aa5.01□□□□□ -1.61
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