RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	MTMR7	Q9Y216	660 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	MED23	Q9ULK4	1368 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	ATRN	O75882	1429 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	CAMTA2	O94983	1202 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	TYRO3	Q06418	890 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	TFCP2	Q12800	502 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	ITPK1	Q13572	414 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	MTMR3	Q13615	1198 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	HLF	Q16534	295 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	RILPL2	Q969X0	211 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	HAUS7	Q99871	368 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	IL25	Q9H293	177 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	TNFRSF10B	O14763	440 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	PDE8A	O60658	829 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	BMP4	P12644	408 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	CTSW	P56202	376 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	CUL4A	Q13619	759 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	C16orf46	Q6P387	395 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	RGS22	Q8NE09	1264 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	ACD	Q96AP0	544 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	SIL1	Q9H173	461 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	BRD7	Q9NPI1	651 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247		H3BRB1	525 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	NECTIN1	Q15223	517 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	PODN	Q7Z5L7	613 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	MAP4K1	Q92918	833 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	COL26A1	Q96A83	441 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	IFT43	Q96FT9	208 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	C8orf37	Q96NL8	207 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC30A3	Q99726	388 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	MARK1	Q9P0L2	795 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	USP21	Q9UK80	565 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	PALD1	Q9ULE6	856 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	USP20	Q9Y2K6	914 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	NHS	Q6T4R5	1651 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	SPEF2	Q9C093	1822 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	KCNQ2	O43526	872 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	ICMT	O60725	284 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	NTSR2	O95665	410 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	IDH3A	P50213	366 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	LRRC24	Q50LG9	513 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM89A	Q96GI7	184 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	TTC14	Q96N46	770 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	6.65	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	KLF15	Q9UIH9	416 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		6.65	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.35

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