RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488711.1

EHD1-210, Transcript of EH domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene EHD1, Length 648 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1-210ENST00000488711 PLEKHH3Q7Z736 793 aa24.34■■□□□ 1.49
EHD1-210ENST00000488711 GCC1Q96CN9 775 aa24.34■■□□□ 1.49
EHD1-210ENST00000488711 TMX2Q9Y320 296 aa24.34■■□□□ 1.49
EHD1-210ENST00000488711 APPP05067 770 aa24.33■■□□□ 1.49
EHD1-210ENST00000488711 EEF2P13639 858 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
EHD1-210ENST00000488711 WDR78Q5VTH9 848 aa24.33■■□□□ 1.49
EHD1-210ENST00000488711 GIMAP6Q6P9H5 292 aa24.33■■□□□ 1.49
EHD1-210ENST00000488711 SOCS4Q8WXH5 440 aa24.33■■□□□ 1.49
EHD1-210ENST00000488711 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP24.33■■□□□ 1.49
EHD1-210ENST00000488711 VCPKMTQ9H867 229 aa24.33■■□□□ 1.49
EHD1-210ENST00000488711 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
EHD1-210ENST00000488711 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
EHD1-210ENST00000488711 TDO2P48775 406 aa24.32■■□□□ 1.48
EHD1-210ENST00000488711 CCNA1P78396 465 aa24.32■■□□□ 1.48
EHD1-210ENST00000488711 COG2Q14746 738 aa24.32■■□□□ 1.48
EHD1-210ENST00000488711 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
EHD1-210ENST00000488711 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa24.32■■□□□ 1.48
EHD1-210ENST00000488711 MORN1Q5T089 497 aa24.32■■□□□ 1.48
EHD1-210ENST00000488711 USP6NLQ92738 828 aa24.32■■□□□ 1.48
EHD1-210ENST00000488711 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP24.32■■□□□ 1.48
EHD1-210ENST00000488711 GNAT2P19087 354 aa24.31■■□□□ 1.48
EHD1-210ENST00000488711 RASA1P20936 1047 aa24.31■■□□□ 1.48
EHD1-210ENST00000488711 CCL14Q16627 93 aa24.31■■□□□ 1.48
EHD1-210ENST00000488711 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
EHD1-210ENST00000488711 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa24.31■■□□□ 1.48
EHD1-210ENST00000488711 IFNL3Q8IZI9 196 aa24.31■■□□□ 1.48
EHD1-210ENST00000488711 SH2D4AQ9H788 454 aa24.31■■□□□ 1.48
EHD1-210ENST00000488711 RLFQ13129 1914 aa24.31■■□□□ 1.48
EHD1-210ENST00000488711 ROBO3Q96MS0 1386 aa24.3■■□□□ 1.48
EHD1-210ENST00000488711 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
EHD1-210ENST00000488711 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
EHD1-210ENST00000488711 TFRCP02786 760 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
EHD1-210ENST00000488711 RGS2P41220 211 aa24.3■■□□□ 1.48
EHD1-210ENST00000488711 PDE1AP54750 535 aa24.3■■□□□ 1.48
EHD1-210ENST00000488711 EXOC6Q8TAG9 804 aa24.3■■□□□ 1.48
EHD1-210ENST00000488711 LPAR1Q92633 364 aa24.3■■□□□ 1.48
EHD1-210ENST00000488711 KANSL2Q9H9L4 492 aa24.3■■□□□ 1.48
EHD1-210ENST00000488711 MKNK2Q9HBH9 465 aa24.3■■□□□ 1.48
EHD1-210ENST00000488711 PRDM1O75626 825 aa24.29■■□□□ 1.48
EHD1-210ENST00000488711 FLOT1O75955 427 aa24.29■■□□□ 1.48
EHD1-210ENST00000488711 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
EHD1-210ENST00000488711 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa24.29■■□□□ 1.48
EHD1-210ENST00000488711 LNPKQ9C0E8 428 aa24.29■■□□□ 1.48
EHD1-210ENST00000488711 HOXC10Q9NYD6 342 aa24.29■■□□□ 1.48
EHD1-210ENST00000488711 STAP2Q9UGK3 403 aa24.29■■□□□ 1.48
EHD1-210ENST00000488711 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
EHD1-210ENST00000488711 RPTORQ8N122 1335 aa24.29■■□□□ 1.48
EHD1-210ENST00000488711 A0A0G2JMZ2 1700 aa24.28■■□□□ 1.48
EHD1-210ENST00000488711 RAD21O60216 631 aa24.28■■□□□ 1.48
EHD1-210ENST00000488711 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
EHD1-210ENST00000488711 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
EHD1-210ENST00000488711 DSG3P32926 999 aa24.28■■□□□ 1.48
EHD1-210ENST00000488711 MAP2K5Q13163 448 aa24.28■■□□□ 1.48
EHD1-210ENST00000488711 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa24.28■■□□□ 1.48
EHD1-210ENST00000488711 ATG4CQ96DT6 458 aa24.28■■□□□ 1.48
EHD1-210ENST00000488711 APBA2Q99767 749 aa24.28■■□□□ 1.48
EHD1-210ENST00000488711 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
EHD1-210ENST00000488711 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa24.28■■□□□ 1.48
EHD1-210ENST00000488711 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
EHD1-210ENST00000488711 WDR46O15213 610 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
EHD1-210ENST00000488711 PTPREP23469 700 aa24.27■■□□□ 1.48
EHD1-210ENST00000488711 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa24.27■■□□□ 1.48
EHD1-210ENST00000488711 IGHDP01880 384 aa24.26■■□□□ 1.47
EHD1-210ENST00000488711 DPF3Q92784 378 aa24.26■■□□□ 1.47
EHD1-210ENST00000488711 SPATC1LQ9H0A9 340 aa24.26■■□□□ 1.47
EHD1-210ENST00000488711 FBXO28Q9NVF7 368 aa24.26■■□□□ 1.47
EHD1-210ENST00000488711 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa24.26■■□□□ 1.47
EHD1-210ENST00000488711 PARP14Q460N5 1801 aa24.26■■□□□ 1.47
EHD1-210ENST00000488711 SLC15A5A6NIM6 579 aa24.25■■□□□ 1.47
EHD1-210ENST00000488711 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
EHD1-210ENST00000488711 AAMPQ13685 434 aa24.25■■□□□ 1.47
EHD1-210ENST00000488711 PLS1Q14651 629 aa24.25■■□□□ 1.47
EHD1-210ENST00000488711 SMC5Q8IY18 1101 aa24.25■■□□□ 1.47
EHD1-210ENST00000488711 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
EHD1-210ENST00000488711 EVI5LQ96CN4 794 aa24.25■■□□□ 1.47
EHD1-210ENST00000488711 NACAP1Q9BZK3 213 aa24.25■■□□□ 1.47
EHD1-210ENST00000488711 NAPBQ9H115 298 aa24.25■■□□□ 1.47
EHD1-210ENST00000488711 GOPCQ9HD26 462 aa24.25■■□□□ 1.47
EHD1-210ENST00000488711 FLRT1Q9NZU1 646 aa24.25■■□□□ 1.47
EHD1-210ENST00000488711 H0YGN5 161 aa24.24■■□□□ 1.47
EHD1-210ENST00000488711 FOXP2O15409 715 aa24.24■■□□□ 1.47
EHD1-210ENST00000488711 GRB14Q14449 540 aa24.24■■□□□ 1.47
EHD1-210ENST00000488711 FAM83BQ5T0W9 1011 aa24.24■■□□□ 1.47
EHD1-210ENST00000488711 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
EHD1-210ENST00000488711 NPLOC4Q8TAT6 608 aa24.24■■□□□ 1.47
EHD1-210ENST00000488711 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
EHD1-210ENST00000488711 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
EHD1-210ENST00000488711 ERCC3P19447 782 aa24.23■■□□□ 1.47
EHD1-210ENST00000488711 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
EHD1-210ENST00000488711 PPARAQ07869 468 aa24.23■■□□□ 1.47
EHD1-210ENST00000488711 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
EHD1-210ENST00000488711 MB21D1Q8N884 522 aa24.23■■□□□ 1.47
EHD1-210ENST00000488711 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
EHD1-210ENST00000488711 NYAP2Q9P242 653 aa24.23■■□□□ 1.47
EHD1-210ENST00000488711 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa24.22■■□□□ 1.47
EHD1-210ENST00000488711 VPS53Q5VIR6 699 aa24.22■■□□□ 1.47
EHD1-210ENST00000488711 HTATIP2Q9BUP3 242 aa24.22■■□□□ 1.47
EHD1-210ENST00000488711 CLIP2Q9UDT6 1046 aa24.22■■□□□ 1.47
EHD1-210ENST00000488711 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
EHD1-210ENST00000488711 TMEM132BQ14DG7 1078 aa24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms