RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486964.5

POLR1A-208, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 1,427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-208ENST00000486964 DDAH1O94760 285 aa11.06□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 CALM1P0DP23 149 aa11.06□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 CALM2P0DP24 149 aa11.06□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 CALM3P0DP25 149 aa11.06□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 SHMT1P34896 483 aa11.06□□□□□ -0.64
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POLR1A-208ENST00000486964 ZNF75DP51815 510 aa11.06□□□□□ -0.64
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POLR1A-208ENST00000486964 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa11.06□□□□□ -0.64
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POLR1A-208ENST00000486964 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 JDP2Q8WYK2 163 aa11.06□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 MYL10Q9BUA6 226 aa11.06□□□□□ -0.64
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POLR1A-208ENST00000486964 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 PGAP2Q9UHJ9 254 aa11.06□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa11.05□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 KINO60870 393 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
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POLR1A-208ENST00000486964 RXRAP19793 462 aa11.05□□□□□ -0.64
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POLR1A-208ENST00000486964 PICALMQ13492 652 aa11.05□□□□□ -0.64
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POLR1A-208ENST00000486964 SPDYE2Q495Y8 402 aa11.05□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 TATDN1Q6P1N9 297 aa11.05□□□□□ -0.64
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POLR1A-208ENST00000486964 MICU3Q86XE3 530 aa11.05□□□□□ -0.64
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POLR1A-208ENST00000486964 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa11.05□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 DPF2Q92785 391 aa11.05□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 TRIM5Q9C035 493 aa11.05□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 KCNF1Q9H3M0 494 aa11.05□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 DNAJC18Q9H819 358 aa11.05□□□□□ -0.64
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POLR1A-208ENST00000486964 SERPINB13Q9UIV8 391 aa11.05□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 HDAC9Q9UKV0 1011 aa11.05□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa11.05□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 PSME4Q14997 1843 aa11.05□□□□□ -0.64
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POLR1A-208ENST00000486964 SMTNL1A8MU46 457 aa11.04□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 CPLX1O14810 134 aa11.04□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 DLGAP5Q15398 846 aa11.04□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa11.04□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 LUZP1Q86V48 1076 aa11.04□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa11.04□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM47Q9BQJ4 181 aa11.04□□□□□ -0.64
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POLR1A-208ENST00000486964 RCOR1Q9UKL0 485 aa11.04□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa11.04□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 FOCADQ5VW36 1801 aa11.03□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 GRIN3BO60391 1043 aa11.03□□□□□ -0.64
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POLR1A-208ENST00000486964 TSPY8P0CW00 308 aa11.03□□□□□ -0.64
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POLR1A-208ENST00000486964 MAP3K10Q02779 954 aa11.03□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 RASSF7Q02833 373 aa11.03□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 CAMK4Q16566 473 aa11.03□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 TMTC3Q6ZXV5 915 aa11.03□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa11.03□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 CEP57L1Q8IYX8 460 aa11.03□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 OGFOD1Q8N543 542 aa11.03□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 SPC24Q8NBT2 197 aa11.03□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 FAM151AQ8WW52 585 aa11.03□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 CCDC17Q96LX7 622 aa11.03□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 MTMR4Q9NYA4 1195 aa11.03□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 CLIP2Q9UDT6 1046 aa11.03□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 PYCARDQ9ULZ3 195 aa11.03□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 CNTNAP1P78357 1384 aa11.03□□□□□ -0.64
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POLR1A-208ENST00000486964 CTIFO43310 598 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.64
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POLR1A-208ENST00000486964 NR1I2O75469 434 aa11.02□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 HLA-DOAP06340 250 aa11.02□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 AKR1B1P15121 316 aa11.02□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP11.02□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 PTGS1P23219 599 aa11.02□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 GSDMDP57764 484 aa11.02□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 TPM4P67936 248 aa11.02□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 FAM160A1Q05DH4 1040 aa11.02□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 GRM4Q14833 912 aa11.02□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 PKN1Q16512 942 aa11.02□□□□□ -0.64
POLR1A-208ENST00000486964 TPRNQ4KMQ1 711 aa11.02□□□□□ -0.64
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