RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482015.5

UPP1-211, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene UPP1, Length 861 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-211ENST00000482015 APPP05067 770 aa22.5■■□□□ 1.19
UPP1-211ENST00000482015 ATP2B2Q01814 1243 aa22.5■■□□□ 1.19
UPP1-211ENST00000482015 COG2Q14746 738 aa22.5■■□□□ 1.19
UPP1-211ENST00000482015 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
UPP1-211ENST00000482015 SOCS4Q8WXH5 440 aa22.5■■□□□ 1.19
UPP1-211ENST00000482015 TRIB2Q92519 343 aa22.5■■□□□ 1.19
UPP1-211ENST00000482015 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
UPP1-211ENST00000482015 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
UPP1-211ENST00000482015 EEF2P13639 858 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
UPP1-211ENST00000482015 GNAT2P19087 354 aa22.49■■□□□ 1.19
UPP1-211ENST00000482015 CCNA1P78396 465 aa22.49■■□□□ 1.19
UPP1-211ENST00000482015 MORN1Q5T089 497 aa22.49■■□□□ 1.19
UPP1-211ENST00000482015 WDR78Q5VTH9 848 aa22.49■■□□□ 1.19
UPP1-211ENST00000482015 USP6NLQ92738 828 aa22.49■■□□□ 1.19
UPP1-211ENST00000482015 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
UPP1-211ENST00000482015 TFRCP02786 760 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
UPP1-211ENST00000482015 TDO2P48775 406 aa22.48■■□□□ 1.19
UPP1-211ENST00000482015 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa22.48■■□□□ 1.19
UPP1-211ENST00000482015 LPAR1Q92633 364 aa22.48■■□□□ 1.19
UPP1-211ENST00000482015 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP22.48■■□□□ 1.19
UPP1-211ENST00000482015 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP22.48■■□□□ 1.19
UPP1-211ENST00000482015 SH2D4AQ9H788 454 aa22.48■■□□□ 1.19
UPP1-211ENST00000482015 VCPKMTQ9H867 229 aa22.48■■□□□ 1.19
UPP1-211ENST00000482015 KANSL2Q9H9L4 492 aa22.48■■□□□ 1.19
UPP1-211ENST00000482015 HOXC10Q9NYD6 342 aa22.48■■□□□ 1.19
UPP1-211ENST00000482015 PLXNB2O15031 1838 aa22.47■■□□□ 1.19
UPP1-211ENST00000482015 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
UPP1-211ENST00000482015 RASA1P20936 1047 aa22.47■■□□□ 1.19
UPP1-211ENST00000482015 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.47■■□□□ 1.19
UPP1-211ENST00000482015 IFNL3Q8IZI9 196 aa22.47■■□□□ 1.19
UPP1-211ENST00000482015 MKNK2Q9HBH9 465 aa22.47■■□□□ 1.19
UPP1-211ENST00000482015 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
UPP1-211ENST00000482015 RGS2P41220 211 aa22.46■■□□□ 1.19
UPP1-211ENST00000482015 PDE1AP54750 535 aa22.46■■□□□ 1.19
UPP1-211ENST00000482015 CCL14Q16627 93 aa22.46■■□□□ 1.19
UPP1-211ENST00000482015 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
UPP1-211ENST00000482015 STAP2Q9UGK3 403 aa22.46■■□□□ 1.19
UPP1-211ENST00000482015 RPTORQ8N122 1335 aa22.46■■□□□ 1.19
UPP1-211ENST00000482015 FLOT1O75955 427 aa22.45■■□□□ 1.18
UPP1-211ENST00000482015 DSG3P32926 999 aa22.45■■□□□ 1.18
UPP1-211ENST00000482015 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
UPP1-211ENST00000482015 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.45■■□□□ 1.18
UPP1-211ENST00000482015 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa22.45■■□□□ 1.18
UPP1-211ENST00000482015 ROBO3Q96MS0 1386 aa22.45■■□□□ 1.18
UPP1-211ENST00000482015 WDR46O15213 610 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
UPP1-211ENST00000482015 RAD21O60216 631 aa22.44■■□□□ 1.18
UPP1-211ENST00000482015 PRDM1O75626 825 aa22.44■■□□□ 1.18
UPP1-211ENST00000482015 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
UPP1-211ENST00000482015 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
UPP1-211ENST00000482015 PTPREP23469 700 aa22.44■■□□□ 1.18
UPP1-211ENST00000482015 MAP2K5Q13163 448 aa22.44■■□□□ 1.18
UPP1-211ENST00000482015 AAMPQ13685 434 aa22.44■■□□□ 1.18
UPP1-211ENST00000482015 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.44■■□□□ 1.18
UPP1-211ENST00000482015 DPF3Q92784 378 aa22.44■■□□□ 1.18
UPP1-211ENST00000482015 ATG4CQ96DT6 458 aa22.44■■□□□ 1.18
UPP1-211ENST00000482015 APBA2Q99767 749 aa22.44■■□□□ 1.18
UPP1-211ENST00000482015 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
UPP1-211ENST00000482015 LNPKQ9C0E8 428 aa22.44■■□□□ 1.18
UPP1-211ENST00000482015 MYH8P13535 1937 aa22.43■■□□□ 1.18
UPP1-211ENST00000482015 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa22.43■■□□□ 1.18
UPP1-211ENST00000482015 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.43■■□□□ 1.18
UPP1-211ENST00000482015 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
UPP1-211ENST00000482015 EVI5LQ96CN4 794 aa22.43■■□□□ 1.18
UPP1-211ENST00000482015 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.43■■□□□ 1.18
UPP1-211ENST00000482015 SPATC1LQ9H0A9 340 aa22.43■■□□□ 1.18
UPP1-211ENST00000482015 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
UPP1-211ENST00000482015 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa22.43■■□□□ 1.18
UPP1-211ENST00000482015 SLC15A5A6NIM6 579 aa22.42■■□□□ 1.18
UPP1-211ENST00000482015 IGHDP01880 384 aa22.42■■□□□ 1.18
UPP1-211ENST00000482015 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
UPP1-211ENST00000482015 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
UPP1-211ENST00000482015 NAPBQ9H115 298 aa22.42■■□□□ 1.18
UPP1-211ENST00000482015 GOPCQ9HD26 462 aa22.42■■□□□ 1.18
UPP1-211ENST00000482015 FBXO28Q9NVF7 368 aa22.42■■□□□ 1.18
UPP1-211ENST00000482015 H0YGN5 161 aa22.41■■□□□ 1.18
UPP1-211ENST00000482015 GRB14Q14449 540 aa22.41■■□□□ 1.18
UPP1-211ENST00000482015 PLS1Q14651 629 aa22.41■■□□□ 1.18
UPP1-211ENST00000482015 SMC5Q8IY18 1101 aa22.41■■□□□ 1.18
UPP1-211ENST00000482015 MB21D1Q8N884 522 aa22.41■■□□□ 1.18
UPP1-211ENST00000482015 FLRT1Q9NZU1 646 aa22.41■■□□□ 1.18
UPP1-211ENST00000482015 FOXP2O15409 715 aa22.4■■□□□ 1.18
UPP1-211ENST00000482015 CAPN2P17655 700 aa22.4■■□□□ 1.18
UPP1-211ENST00000482015 ERCC3P19447 782 aa22.4■■□□□ 1.18
UPP1-211ENST00000482015 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.4■■□□□ 1.18
UPP1-211ENST00000482015 NPLOC4Q8TAT6 608 aa22.4■■□□□ 1.18
UPP1-211ENST00000482015 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
UPP1-211ENST00000482015 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
UPP1-211ENST00000482015 HTATIP2Q9BUP3 242 aa22.4■■□□□ 1.18
UPP1-211ENST00000482015 ZNF287Q9HBT7 754 aa22.4■■□□□ 1.18
UPP1-211ENST00000482015 NYAP2Q9P242 653 aa22.4■■□□□ 1.18
UPP1-211ENST00000482015 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.39■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 PPARAQ07869 468 aa22.39■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.39■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 RLFQ13129 1914 aa22.38■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 HOXC6P09630 235 aa22.38■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 TMEM132BQ14DG7 1078 aa22.38■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 VPS53Q5VIR6 699 aa22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms