RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477440.6

ARHGEF3-208, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 3

Gene ARHGEF3, Length 587 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-208ENST00000477440 CENPFP49454 3210 aa30.13■■■□□ 2.41
ARHGEF3-208ENST00000477440 ARHGEF6Q15052 776 aa30.13■■■□□ 2.41
ARHGEF3-208ENST00000477440 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa30.13■■■□□ 2.41
ARHGEF3-208ENST00000477440 SPICE1Q8N0Z3 855 aa30.13■■■□□ 2.41
ARHGEF3-208ENST00000477440 HPS5Q9UPZ3 1129 aa30.13■■■□□ 2.41
ARHGEF3-208ENST00000477440 PTPN22Q9Y2R2 807 aa30.13■■■□□ 2.41
ARHGEF3-208ENST00000477440 RAD50Q92878 1312 aa30.13■■■□□ 2.41
ARHGEF3-208ENST00000477440 PEX10O60683 326 aa30.12■■■□□ 2.41
ARHGEF3-208ENST00000477440 TSPY3P0CV98 308 aa30.12■■■□□ 2.41
ARHGEF3-208ENST00000477440 TSPY8P0CW00 308 aa30.12■■■□□ 2.41
ARHGEF3-208ENST00000477440 TFAP4Q01664 338 aa30.12■■■□□ 2.41
ARHGEF3-208ENST00000477440 NEDD1Q8NHV4 660 aa30.12■■■□□ 2.41
ARHGEF3-208ENST00000477440 CEP95Q96GE4 821 aa30.12■■■□□ 2.41
ARHGEF3-208ENST00000477440 NBPF3Q9H094 633 aa30.12■■■□□ 2.41
ARHGEF3-208ENST00000477440 POTEEQ6S8J3 1075 aa30.11■■■□□ 2.41
ARHGEF3-208ENST00000477440 LPAR1Q92633 364 aa30.11■■■□□ 2.41
ARHGEF3-208ENST00000477440 DSCC1Q9BVC3 393 aa30.11■■■□□ 2.41
ARHGEF3-208ENST00000477440 TXNRD2Q9NNW7 524 aa30.11■■■□□ 2.41
ARHGEF3-208ENST00000477440 NYAP2Q9P242 653 aa30.11■■■□□ 2.41
ARHGEF3-208ENST00000477440 A0A0G2JMZ2 1700 aa30.1■■■□□ 2.41
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ARHGEF3-208ENST00000477440 MORF4L1Q9UBU8 362 aa30.1■■■□□ 2.41
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ARHGEF3-208ENST00000477440 FCGRTP55899 365 aa30.09■■■□□ 2.41
ARHGEF3-208ENST00000477440 TBC1D10CQ8IV04 446 aa30.09■■■□□ 2.41
ARHGEF3-208ENST00000477440 RUFY2Q8WXA3 655 aa30.09■■■□□ 2.41
ARHGEF3-208ENST00000477440 TANGO6Q9C0B7 1094 aa30.09■■■□□ 2.41
ARHGEF3-208ENST00000477440 MTMR4Q9NYA4 1195 aa30.09■■■□□ 2.41
ARHGEF3-208ENST00000477440 TSPY2A6NKD2 308 aa30.08■■■□□ 2.41
ARHGEF3-208ENST00000477440 GNRH1P01148 92 aa30.08■■■□□ 2.41
ARHGEF3-208ENST00000477440 PAGR1Q9BTK6 254 aa30.08■■■□□ 2.41
ARHGEF3-208ENST00000477440 GOPCQ9HD26 462 aa30.08■■■□□ 2.41
ARHGEF3-208ENST00000477440 TOMM22Q9NS69 142 aa30.08■■■□□ 2.41
ARHGEF3-208ENST00000477440 RBPJLQ9UBG7 517 aa30.08■■■□□ 2.41
ARHGEF3-208ENST00000477440 CLIP2Q9UDT6 1046 aa30.08■■■□□ 2.41
ARHGEF3-208ENST00000477440 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa30.08■■■□□ 2.41
ARHGEF3-208ENST00000477440 CCDC85CA6NKD9 419 aa30.07■■■□□ 2.4
ARHGEF3-208ENST00000477440 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
ARHGEF3-208ENST00000477440 WDR46O15213 610 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
ARHGEF3-208ENST00000477440 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
ARHGEF3-208ENST00000477440 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
ARHGEF3-208ENST00000477440 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
ARHGEF3-208ENST00000477440 SRRDQ9UH36 339 aa30.07■■■□□ 2.4
ARHGEF3-208ENST00000477440 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
ARHGEF3-208ENST00000477440 RAD21O60216 631 aa30.06■■■□□ 2.4
ARHGEF3-208ENST00000477440 BMP2KLQ5H9B9 411 aa30.06■■■□□ 2.4
ARHGEF3-208ENST00000477440 AKNAD1Q5T1N1 836 aa30.06■■■□□ 2.4
ARHGEF3-208ENST00000477440 ZNF213O14771 459 aa30.05■■■□□ 2.4
ARHGEF3-208ENST00000477440 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
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ARHGEF3-208ENST00000477440 NMT2O60551 498 aa30.05■■■□□ 2.4
ARHGEF3-208ENST00000477440 TTLL1O95922 423 aa30.05■■■□□ 2.4
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ARHGEF3-208ENST00000477440 PLXNB2O15031 1838 aa30.05■■■□□ 2.4
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ARHGEF3-208ENST00000477440 MYPNQ86TC9 1320 aa30.04■■■□□ 2.4
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ARHGEF3-208ENST00000477440 ERVK-9P63128 1117 aa30.04■■■□□ 2.4
ARHGEF3-208ENST00000477440 ERVK-24P63145 666 aa30.04■■■□□ 2.4
ARHGEF3-208ENST00000477440 LBX2Q6XYB7 198 aa30.04■■■□□ 2.4
ARHGEF3-208ENST00000477440 MFSD6Q6ZSS7 791 aa30.04■■■□□ 2.4
ARHGEF3-208ENST00000477440 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa30.04■■■□□ 2.4
ARHGEF3-208ENST00000477440 NKX2-3Q8TAU0 364 aa30.04■■■□□ 2.4
ARHGEF3-208ENST00000477440 MKL1Q969V6 931 aa30.04■■■□□ 2.4
ARHGEF3-208ENST00000477440 F5H6K3 240 aa30.03■■■□□ 2.4
ARHGEF3-208ENST00000477440 NDUFB10O96000 172 aa30.03■■■□□ 2.4
ARHGEF3-208ENST00000477440 HOXD10P28358 340 aa30.03■■■□□ 2.4
ARHGEF3-208ENST00000477440 PTH1RQ03431 593 aa30.03■■■□□ 2.4
ARHGEF3-208ENST00000477440 PRKCZQ05513 592 aa30.03■■■□□ 2.4
ARHGEF3-208ENST00000477440 KLRC3Q07444 240 aa30.03■■■□□ 2.4
ARHGEF3-208ENST00000477440 COG2Q14746 738 aa30.03■■■□□ 2.4
ARHGEF3-208ENST00000477440 Q3C1V9 767 aa30.03■■■□□ 2.4
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ARHGEF3-208ENST00000477440 GABRQQ9UN88 632 aa30.03■■■□□ 2.4
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ARHGEF3-208ENST00000477440 FLOT1O75955 427 aa30.02■■■□□ 2.4
ARHGEF3-208ENST00000477440 PRMT2P55345 433 aa30.02■■■□□ 2.4
ARHGEF3-208ENST00000477440 ERICH6BQ5W0A0 696 aa30.02■■■□□ 2.4
ARHGEF3-208ENST00000477440 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
ARHGEF3-208ENST00000477440 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
ARHGEF3-208ENST00000477440 PPP4R2Q9NY27 417 aa30.02■■■□□ 2.4
ARHGEF3-208ENST00000477440 BTBD7Q9P203 1132 aa30.02■■■□□ 2.4
ARHGEF3-208ENST00000477440 CTNNA3Q9UI47 895 aa30.02■■■□□ 2.4
ARHGEF3-208ENST00000477440 PCP11498 1178 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
ARHGEF3-208ENST00000477440 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
ARHGEF3-208ENST00000477440 FBXO28Q9NVF7 368 aa30.01■■■□□ 2.39
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ARHGEF3-208ENST00000477440 DSG3P32926 999 aa30■■■□□ 2.39
ARHGEF3-208ENST00000477440 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
ARHGEF3-208ENST00000477440 ATG4CQ96DT6 458 aa30■■■□□ 2.39
ARHGEF3-208ENST00000477440 PORCNQ9H237 461 aa30■■■□□ 2.39
ARHGEF3-208ENST00000477440 HOXC10Q9NYD6 342 aa30■■■□□ 2.39
ARHGEF3-208ENST00000477440 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa30■■■□□ 2.39
ARHGEF3-208ENST00000477440 COA7Q96BR5 231 aa29.99■■■□□ 2.39
ARHGEF3-208ENST00000477440 FLT3LGP49771 235 aa29.98■■■□□ 2.39
ARHGEF3-208ENST00000477440 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa29.98■■■□□ 2.39
ARHGEF3-208ENST00000477440 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa29.98■■■□□ 2.39
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