RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477144.1

HOXB-AS3-209, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 743 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PLIN4Q96Q06 1357 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FKBP1CQ5VVH2 108 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SENP2Q9HC62 589 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MYH1P12882 1939 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 H7C1D1 291 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SMARCA1P28370 1054 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 GABPAQ06546 454 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CST9Q5W186 159 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TMTC3Q6ZXV5 915 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PHKBQ93100 1093 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 WBP1LQ9NX94 342 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SHTN1A0MZ66 631 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ECE1P42892 770 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TNNI2P48788 182 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KRT40Q6A162 431 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CYP4F22Q6NT55 531 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MICALL2Q8IY33 904 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TRPM4Q8TD43 1214 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CAPNS2Q96L46 248 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PRDM10Q9NQV6 1147 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SPDYE2BA6NHP3 402 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CELF2O95319 508 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TTLL1O95922 423 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SPDYE6P0CI01 402 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LBX1P52954 281 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 GUCY1B3Q02153 619 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 GRM4Q14833 912 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NKX2-3Q8TAU0 364 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KCNG4Q8TDN1 519 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TMEM47Q9BQJ4 181 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZNF408Q9H9D4 720 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TLL2Q9Y6L7 1015 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 YEATS4O95619 227 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CALML3P27482 149 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FOSBP53539 338 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TNFAIP1Q13829 316 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RCSD1Q6JBY9 416 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NBPF11Q86T75 865 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SLC44A5Q8NCS7 719 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CABP5Q9NP86 173 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SH3GLB2Q9NR46 395 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 IL17RBQ9NRM6 502 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PGAP2Q9UHJ9 254 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CEP131Q9UPN4 1083 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 THSD7BQ9C0I4 1608 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ATRNL1Q5VV63 1379 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SMIM22K7EJ46 135 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NMT2O60551 498 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MMP1P03956 469 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ASPRV1Q53RT3 343 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 GALNT17Q6IS24 598 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SAMD7Q7Z3H4 446 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FAM83AQ86UY5 434 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CCDC148Q8NFR7 591 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FAM151AQ8WW52 585 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 BEGAINQ9BUH8 593 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KANSL2Q9H9L4 492 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 POLR3EQ9NVU0 708 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MTMR4Q9NYA4 1195 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RTEL1Q9NZ71 1219 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RCOR1Q9UKL0 485 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 V9GY48 417 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 hCG_1984214I3L0E3 225 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 EGFRP00533 1210 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP15.87■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NOVP48745 357 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TCP10Q12799 353 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NFIAQ12857 509 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 STK38Q15208 465 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RILPL1Q5EBL4 403 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CCDC183Q5T5S1 534 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MYSM1Q5VVJ2 828 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TMEM179Q6ZVK1 233 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CCDC82Q8N4S0 544 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms