RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474409.1

CNN3-205, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 3

Gene CNN3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-205ENST00000474409 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 NYAP2Q9P242 653 aa9.75□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 CLIP2Q9UDT6 1046 aa9.75□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 NID2Q14112 1375 aa9.75□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 MYH7BA7E2Y1 1941 aa9.74□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 USP17L5A8MUK1 530 aa9.74□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 TOMM70O94826 608 aa9.74□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 CALM1P0DP23 149 aa9.74□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 CALM2P0DP24 149 aa9.74□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 CALM3P0DP25 149 aa9.74□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 RXRAP19793 462 aa9.74□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 JAG1P78504 1218 aa9.74□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 MAP3K11Q16584 847 aa9.74□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 ME3Q16798 604 aa9.74□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 RTN1Q16799 776 aa9.74□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 CCDC96Q2M329 555 aa9.74□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa9.74□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 TMX3Q96JJ7 454 aa9.74□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 ELP3Q9H9T3 547 aa9.74□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 GOPCQ9HD26 462 aa9.74□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 BRPF3Q9ULD4 1205 aa9.74□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 TPCN1Q9ULQ1 816 aa9.74□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa9.74□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 TRIM75PA6NK02 468 aa9.73□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 UBE2Q2LH0YL09 131 aa9.73□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 PTPRAP18433 802 aa9.73□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 ECE1P42892 770 aa9.73□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 NOVP48745 357 aa9.73□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 RCAN1P53805 252 aa9.73□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 EVCP57679 992 aa9.73□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 CCT2P78371 535 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 MTMR2Q13614 643 aa9.73□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 CCDC83Q8IWF9 413 aa9.73□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 ANKS1AQ92625 1134 aa9.73□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 GTF3C6Q969F1 213 aa9.73□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 CHMP4CQ96CF2 233 aa9.73□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 OTUD5Q96G74 571 aa9.73□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 CLMNQ96JQ2 1002 aa9.73□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa9.73□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 PASKQ96RG2 1323 aa9.73□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 LCTP09848 1927 aa9.72□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa9.72□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 THSD7BQ9C0I4 1608 aa9.72□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 CPLX1O14810 134 aa9.72□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 PFKFB2O60825 505 aa9.72□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 PDHBP11177 359 aa9.72□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 KIF5BP33176 963 aa9.72□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 USP14P54578 494 aa9.72□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 SCRN1Q12765 414 aa9.72□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 FSTL1Q12841 308 aa9.72□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 GRM4Q14833 912 aa9.72□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 SLFN13Q68D06 897 aa9.72□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 RASGRP2Q7LDG7 609 aa9.72□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 ERO1BQ86YB8 467 aa9.72□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 NECAB1Q8N987 351 aa9.72□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 ZNF280CQ8ND82 737 aa9.72□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa9.72□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 ACER1Q8TDN7 264 aa9.72□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 OPTNQ96CV9 577 aa9.72□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 TMX2Q9Y320 296 aa9.72□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 ZHX2Q9Y6X8 837 aa9.72□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
CNN3-205ENST00000474409 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa9.71□□□□□ -0.86
CNN3-205ENST00000474409 A0A1W2PRG0 241 aa9.71□□□□□ -0.86
CNN3-205ENST00000474409 SPDYE5A6NIY4 337 aa9.71□□□□□ -0.86
CNN3-205ENST00000474409 UNCXA6NJT0 531 aa9.71□□□□□ -0.86
CNN3-205ENST00000474409 USP17L10C9JJH3 530 aa9.71□□□□□ -0.86
CNN3-205ENST00000474409 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
CNN3-205ENST00000474409 CDKL5O76039 1030 aa9.71□□□□□ -0.86
CNN3-205ENST00000474409 NDUFB10O96000 172 aa9.71□□□□□ -0.86
CNN3-205ENST00000474409 SLC1A4P43007 532 aa9.71□□□□□ -0.86
CNN3-205ENST00000474409 HUNKP57058 714 aa9.71□□□□□ -0.86
CNN3-205ENST00000474409 PPATQ06203 517 aa9.71□□□□□ -0.86
CNN3-205ENST00000474409 TROAPQ12815 778 aa9.71□□□□□ -0.86
CNN3-205ENST00000474409 SPP2Q13103 211 aa9.71□□□□□ -0.86
CNN3-205ENST00000474409 PPIL2Q13356 520 aa9.71□□□□□ -0.86
CNN3-205ENST00000474409 ASPRV1Q53RT3 343 aa9.71□□□□□ -0.86
CNN3-205ENST00000474409 SPICE1Q8N0Z3 855 aa9.71□□□□□ -0.86
CNN3-205ENST00000474409 DCAF4Q8WV16 495 aa9.71□□□□□ -0.86
CNN3-205ENST00000474409 MKL1Q969V6 931 aa9.71□□□□□ -0.86
CNN3-205ENST00000474409 WDR18Q9BV38 432 aa9.71□□□□□ -0.86
CNN3-205ENST00000474409 VCPKMTQ9H867 229 aa9.71□□□□□ -0.86
CNN3-205ENST00000474409 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
CNN3-205ENST00000474409 TMOD4Q9NZQ9 345 aa9.71□□□□□ -0.86
CNN3-205ENST00000474409 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
CNN3-205ENST00000474409 HPS5Q9UPZ3 1129 aa9.71□□□□□ -0.86
CNN3-205ENST00000474409 MCM3APO60318 1980 aa9.71□□□□□ -0.86
CNN3-205ENST00000474409 DOCK3Q8IZD9 2030 aa9.7□□□□□ -0.86
CNN3-205ENST00000474409 C19orf81C9J6K1 198 aa9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms