RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473460.1

GINS1-202, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene GINS1, Length 541 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-202ENST00000473460 ANKRD33BA6NCL7 494 aa6.37□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 B8ZZF3 427 aa6.37□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 NUAK1O60285 661 aa6.37□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 LTKP29376 864 aa6.37□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 DAB2P98082 770 aa6.37□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 TEKQ02763 1124 aa6.37□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 SHISA4Q96DD7 197 aa6.37□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.37□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 SLC6A17Q9H1V8 727 aa6.37□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 PARP2Q9UGN5 583 aa6.37□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 ZNF281Q9Y2X9 895 aa6.37□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 USP31Q70CQ4 1352 aa6.36□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 DNAJA2O60884 412 aa6.36□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 EFEMP2O95967 443 aa6.36□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 YARSP54577 528 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 ZNF605Q86T29 641 aa6.36□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 OXR1Q8N573 874 aa6.36□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 GATAD2BQ8WXI9 593 aa6.36□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 VWCEQ96DN2 955 aa6.36□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 RHOVQ96L33 236 aa6.36□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 C20orf173Q96LM9 149 aa6.36□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 KREMEN1Q96MU8 473 aa6.36□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 G6PC3Q9BUM1 346 aa6.36□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa6.36□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 GCM1Q9NP62 436 aa6.36□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 REV1Q9UBZ9 1251 aa6.36□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 NOTOA8MTQ0 251 aa6.35□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa6.35□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 PEX10O60683 326 aa6.35□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 F13A1P00488 732 aa6.35□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 PF4P02776 101 aa6.35□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 GALK1P51570 392 aa6.35□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 DLG4P78352 724 aa6.35□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 LMNB2Q03252 620 aa6.35□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 ERICH6Q7L0X2 663 aa6.35□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 PSPNO60542 156 aa6.34□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 HOXA5P20719 270 aa6.34□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 LINC01599Q8WXQ3 324 aa6.34□□□□□ -1.39
GINS1-202ENST00000473460 SEMA7AO75326 666 aa6.33□□□□□ -1.4
GINS1-202ENST00000473460 BPNT1O95861 308 aa6.33□□□□□ -1.4
GINS1-202ENST00000473460 ANKS4BQ8N8V4 417 aa6.33□□□□□ -1.4
GINS1-202ENST00000473460 CCDC74BQ96LY2 380 aa6.33□□□□□ -1.4
GINS1-202ENST00000473460 FAM161BQ96MY7 647 aa6.33□□□□□ -1.4
GINS1-202ENST00000473460 TRAIPQ9BWF2 469 aa6.33□□□□□ -1.4
GINS1-202ENST00000473460 SGPP1Q9BX95 441 aa6.33□□□□□ -1.4
GINS1-202ENST00000473460 ASPNQ9BXN1 380 aa6.33□□□□□ -1.4
GINS1-202ENST00000473460 KLHL3Q9UH77 587 aa6.33□□□□□ -1.4
GINS1-202ENST00000473460 GPR160Q9UJ42 338 aa6.33□□□□□ -1.4
GINS1-202ENST00000473460 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa6.33□□□□□ -1.4
GINS1-202ENST00000473460 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa6.32□□□□□ -1.4
GINS1-202ENST00000473460 GRIN3BO60391 1043 aa6.32□□□□□ -1.4
GINS1-202ENST00000473460 HTR3BO95264 441 aa6.32□□□□□ -1.4
GINS1-202ENST00000473460 TNNI2P48788 182 aa6.32□□□□□ -1.4
GINS1-202ENST00000473460 CTSWP56202 376 aa6.32□□□□□ -1.4
GINS1-202ENST00000473460 CHRNEQ04844 493 aa6.32□□□□□ -1.4
GINS1-202ENST00000473460 PSMD2Q13200 908 aa6.32□□□□□ -1.4
GINS1-202ENST00000473460 SNX17Q15036 470 aa6.32□□□□□ -1.4
GINS1-202ENST00000473460 TMC4Q7Z404 712 aa6.32□□□□□ -1.4
GINS1-202ENST00000473460 SPPL2CQ8IUH8 684 aa6.32□□□□□ -1.4
GINS1-202ENST00000473460 DUSP4Q13115 394 aa6.31□□□□□ -1.4
GINS1-202ENST00000473460 FBXO27Q8NI29 283 aa6.31□□□□□ -1.4
GINS1-202ENST00000473460 KIF2CQ99661 725 aa6.31□□□□□ -1.4
GINS1-202ENST00000473460 HDAC8Q9BY41 377 aa6.31□□□□□ -1.4
GINS1-202ENST00000473460 GARTP22102 1010 aa6.3□□□□□ -1.4
GINS1-202ENST00000473460 PDE6BP35913 854 aa6.3□□□□□ -1.4
GINS1-202ENST00000473460 FAM160A1Q05DH4 1040 aa6.3□□□□□ -1.4
GINS1-202ENST00000473460 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
GINS1-202ENST00000473460 NLRX1Q86UT6 975 aa6.3□□□□□ -1.4
GINS1-202ENST00000473460 USHBP1Q8N6Y0 703 aa6.3□□□□□ -1.4
GINS1-202ENST00000473460 TMEM74Q96NL1 305 aa6.3□□□□□ -1.4
GINS1-202ENST00000473460 RSRP1Q9BUV0 290 aa6.3□□□□□ -1.4
GINS1-202ENST00000473460 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
GINS1-202ENST00000473460 UBOX5O94941 541 aa6.29□□□□□ -1.4
GINS1-202ENST00000473460 MPP2Q14168 576 aa6.29□□□□□ -1.4
GINS1-202ENST00000473460 SSPNQ14714 243 aa6.29□□□□□ -1.4
GINS1-202ENST00000473460 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
GINS1-202ENST00000473460 REC114Q7Z4M0 266 aa6.29□□□□□ -1.4
GINS1-202ENST00000473460 FBXO33Q7Z6M2 555 aa6.29□□□□□ -1.4
GINS1-202ENST00000473460 SIRT2Q8IXJ6 389 aa6.29□□□□□ -1.4
GINS1-202ENST00000473460 PHACTR4Q8IZ21 702 aa6.29□□□□□ -1.4
GINS1-202ENST00000473460 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
GINS1-202ENST00000473460 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
GINS1-202ENST00000473460 KCNC2Q96PR1 638 aa6.29□□□□□ -1.4
GINS1-202ENST00000473460 PARD6AQ9NPB6 346 aa6.29□□□□□ -1.4
GINS1-202ENST00000473460 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
GINS1-202ENST00000473460 KCTD3Q9Y597 815 aa6.29□□□□□ -1.4
GINS1-202ENST00000473460 ADAMTS20P59510 1910 aa6.29□□□□□ -1.4
GINS1-202ENST00000473460 RGS13O14921 159 aa6.28□□□□□ -1.4
GINS1-202ENST00000473460 USP2O75604 605 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms