RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 NUDT8Q8WV74 236 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 MDFIQ99750 246 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 USP26Q9BXU7 913 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 GBP3Q9H0R5 595 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 CDH19Q9H159 772 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 ARNT2Q9HBZ2 717 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 CDC14CA4D256 554 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 KPNA6O60684 536 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 EFCAB14O75071 495 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 CLEC3AO75596 197 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 ASLP04424 464 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 SLFN14P0C7P3 912 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 GBP1P32455 592 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 BAG6P46379 1132 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 ERVK-24P63145 666 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 GABREP78334 506 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF460Q14592 562 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 PPM1JQ5JR12 505 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 ZBTB37Q5TC79 503 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC6A19Q695T7 634 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 ZBTB46Q86UZ6 589 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 GSTCDQ8NEC7 633 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 HOOK2Q96ED9 719 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 WDR18Q9BV38 432 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 CARD10Q9BWT7 1032 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC52A2Q9HAB3 445 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 NOP56O00567 594 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 TBX1O43435 398 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 CAPNS1P04632 268 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 GRIK5Q16478 980 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 PKDCCQ504Y2 493 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 PPP4R4Q6NUP7 873 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 FGD2Q7Z6J4 655 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 PASD1Q8IV76 773 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 BVESQ8NE79 360 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 TTC8Q8TAM2 541 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 CHMP4CQ96CF2 233 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC74BQ96LY2 380 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 YIPF4Q9BSR8 244 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 SPDYE3A6NKU9 549 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 FANCGO15287 622 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 AOC2O75106 756 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 PPM1BO75688 479 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 DGAT1O75907 488 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 IGFALSP35858 605 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 TMPRSS15P98073 1019 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 ELOA3BQ3SY89 546 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 DCAF15Q66K64 600 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 FCHSD1Q86WN1 690 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 HID1Q8IV36 788 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 ELOA3Q8NG57 546 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 USP7Q93009 1102 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 KLHDC7BQ96G42 594 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 TTC1Q99614 292 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 MTFR1LQ9H019 292 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP7.91□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 LRRC4BQ9NT99 713 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 MX2P20592 715 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 FLT3P36888 993 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 NLRP12P59046 1061 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 ID3Q02535 119 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 BRD3Q15059 726 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 SYCP2LQ5T4T6 812 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 TCEAL8Q8IYN2 117 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF507Q8TCN5 953 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 MRGPRX3Q96LB0 322 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 WHRNQ9P202 907 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 TRHDEQ9UKU6 1024 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGGTB-209ENST00000473406 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGGTB-209ENST00000473406 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
RABGGTB-209ENST00000473406 NEURL1BA8MQ27 555 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGGTB-209ENST00000473406 DLX3O60479 287 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGGTB-209ENST00000473406 JMJD7P0C870 316 aa7.89□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 196.5 ms