RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465525.6

PTPRU-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 1,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-206ENST00000465525 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
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PTPRU-206ENST00000465525 TOP1P11387 765 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PTPRU-206ENST00000465525 NOVP48745 357 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRU-206ENST00000465525 LDLRAD1Q5T700 205 aa20.13■□□□□ 0.81
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PTPRU-206ENST00000465525 TRPM7Q96QT4 1865 aa20.12■□□□□ 0.81
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PTPRU-206ENST00000465525 RAD21O60216 631 aa20.12■□□□□ 0.81
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PTPRU-206ENST00000465525 ASNSP08243 561 aa20.12■□□□□ 0.81
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PTPRU-206ENST00000465525 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.81
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PTPRU-206ENST00000465525 SCYL3Q8IZE3 742 aa20.12■□□□□ 0.81
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PTPRU-206ENST00000465525 GTF3C6Q969F1 213 aa20.12■□□□□ 0.81
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PTPRU-206ENST00000465525 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa20.09■□□□□ 0.81
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PTPRU-206ENST00000465525 USP17L5A8MUK1 530 aa20.08■□□□□ 0.81
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PTPRU-206ENST00000465525 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa20.08■□□□□ 0.81
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PTPRU-206ENST00000465525 STAG2Q8N3U4 1231 aa20.07■□□□□ 0.8
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PTPRU-206ENST00000465525 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
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PTPRU-206ENST00000465525 MYH6P13533 1939 aa20.06■□□□□ 0.8
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PTPRU-206ENST00000465525 CPLX1O14810 134 aa20.06■□□□□ 0.8
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PTPRU-206ENST00000465525 ERO1BQ86YB8 467 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRU-206ENST00000465525 DDX11Q96FC9 970 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRU-206ENST00000465525 CPVLQ9H3G5 476 aa20.06■□□□□ 0.8
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PTPRU-206ENST00000465525 AS3MTQ9HBK9 375 aa20.05■□□□□ 0.8
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PTPRU-206ENST00000465525 MAD2L2Q9UI95 211 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRU-206ENST00000465525 SPDYE5A6NIY4 337 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRU-206ENST00000465525 TRIM75PA6NK02 468 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRU-206ENST00000465525 NDUFB10O96000 172 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRU-206ENST00000465525 RCAN1P53805 252 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRU-206ENST00000465525 PPATQ06203 517 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRU-206ENST00000465525 MTMR2Q13614 643 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRU-206ENST00000465525 KCTD1Q719H9 257 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRU-206ENST00000465525 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
PTPRU-206ENST00000465525 PHKBQ93100 1093 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRU-206ENST00000465525 WDR18Q9BV38 432 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRU-206ENST00000465525 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
PTPRU-206ENST00000465525 PTPRFP10586 1907 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRU-206ENST00000465525 PTPDC1A2A3K4 754 aa20.03■□□□□ 0.8
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