RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 NFXL1Q6ZNB6 911 aa6.54□□□□□ -1.36
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PTPRC-210ENST00000462363 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 STK11IPQ8N1F8 1099 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 FSIP1Q8NA03 581 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 RNF214Q8ND24 703 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 FBXO22Q8NEZ5 403 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 FAM200AQ8TCP9 573 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 OXER1Q8TDS5 423 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 WASF1Q92558 559 aa6.54□□□□□ -1.36
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PTPRC-210ENST00000462363 MRIQ9BWK5 157 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 SLC26A6Q9BXS9 759 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
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PTPRC-210ENST00000462363 MYH4Q9Y623 1939 aa6.54□□□□□ -1.36
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PTPRC-210ENST00000462363 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 ESPNB1AK53 854 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 M0R2N6 131 aa6.53□□□□□ -1.36
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PTPRC-210ENST00000462363 BAG3O95817 575 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC192P0DO97 292 aa6.53□□□□□ -1.36
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PTPRC-210ENST00000462363 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 SLC15A2Q16348 729 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
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PTPRC-210ENST00000462363 HHIPL2Q6UWX4 724 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 CATIPQ7Z7H3 387 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 IQCA1Q86XH1 822 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC125Q86Z20 511 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 TRIM22Q8IYM9 498 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
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PTPRC-210ENST00000462363 DYNLL2Q96FJ2 89 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 TIGD1Q96MW7 591 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 TNMDQ9H2S6 317 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 CBX8Q9HC52 389 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 MAD2L2Q9UI95 211 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 TUBE1Q9UJT0 475 aa6.53□□□□□ -1.36
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PTPRC-210ENST00000462363 ME1P48163 572 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 CDK8P49336 464 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 GTF2IP78347 998 aa6.52□□□□□ -1.37
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PTPRC-210ENST00000462363 NR5A1Q13285 461 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 STK38Q15208 465 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 CAMK4Q16566 473 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
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PTPRC-210ENST00000462363 CCDC178Q5BJE1 867 aa6.52□□□□□ -1.37
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PTPRC-210ENST00000462363 SARM1Q6SZW1 724 aa6.52□□□□□ -1.37
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PTPRC-210ENST00000462363 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 CKAP2LQ8IYA6 745 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 TEX11Q8IYF3 940 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 DAGLBQ8NCG7 672 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 BICD2Q8TD16 824 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 TAOK2Q9UL54 1235 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 PARP3Q9Y6F1 533 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 USP17L3A6NCW0 530 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 USP17L4A6NCW7 530 aa6.51□□□□□ -1.37
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