RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461653.5

RABGGTB-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 1,702 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-204ENST00000461653 FBXL19Q6PCT2 694 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-204ENST00000461653 MPZL3Q6UWV2 235 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM84AQ96KN4 292 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-204ENST00000461653 KREMEN1Q96MU8 473 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-204ENST00000461653 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-204ENST00000461653 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-204ENST00000461653 ASPNQ9BXN1 380 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-204ENST00000461653 KCNQ5Q9NR82 932 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-204ENST00000461653 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-204ENST00000461653 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-204ENST00000461653 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-204ENST00000461653 HK2P52789 917 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-204ENST00000461653 MLECQ14165 292 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-204ENST00000461653 KIF2CQ99661 725 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-204ENST00000461653 LRRC3Q9BY71 257 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-204ENST00000461653 ROBO2Q9HCK4 1378 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-204ENST00000461653 LTKP29376 864 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-204ENST00000461653 EGR3Q06889 387 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-204ENST00000461653 ABHD4Q8TB40 342 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-204ENST00000461653 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-204ENST00000461653 PPP1R16BQ96T49 567 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-204ENST00000461653 ADAMTS10Q9H324 1103 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-204ENST00000461653 BRMS1Q9HCU9 246 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-204ENST00000461653 GGT7Q9UJ14 662 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-204ENST00000461653 GREM1O60565 184 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-204ENST00000461653 GBP1P32455 592 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-204ENST00000461653 CHMP4BP1P59074 171 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-204ENST00000461653 ERVFC1P60507 584 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-204ENST00000461653 PRR23BQ6ZRT6 265 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-204ENST00000461653 HS2ST1Q7LGA3 356 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-204ENST00000461653 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-204ENST00000461653 DBX1A6NMT0 343 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-204ENST00000461653 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC22A31A6NKX4 558 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGGTB-204ENST00000461653 HPXP02790 462 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGGTB-204ENST00000461653 ARSHQ5FYA8 562 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGGTB-204ENST00000461653 MYLIPQ8WY64 445 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGGTB-204ENST00000461653 RGS13O14921 159 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-204ENST00000461653 CRKP46108 304 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-204ENST00000461653 GMIPQ9P107 970 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-204ENST00000461653 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-204ENST00000461653 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-204ENST00000461653 SHISA3A0PJX4 238 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-204ENST00000461653 ATE1O95260 518 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-204ENST00000461653 ZGLP1P0C6A0 271 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-204ENST00000461653 RAG1P15918 1043 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-204ENST00000461653 VWCEQ96DN2 955 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-204ENST00000461653 DIRC2Q96SL1 478 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-204ENST00000461653 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-204ENST00000461653 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RABGGTB-204ENST00000461653 UBOX5O94941 541 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGGTB-204ENST00000461653 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RABGGTB-204ENST00000461653 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGGTB-204ENST00000461653 OVOS1Q6IE37 1185 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGGTB-204ENST00000461653 UBP1Q9NZI7 540 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGGTB-204ENST00000461653 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RABGGTB-204ENST00000461653 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RABGGTB-204ENST00000461653 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
RABGGTB-204ENST00000461653 RNF4P78317 190 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGGTB-204ENST00000461653 SEZ6Q53EL9 994 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGGTB-204ENST00000461653 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
RABGGTB-204ENST00000461653 PDZD8Q8NEN9 1154 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGGTB-204ENST00000461653 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RABGGTB-204ENST00000461653 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGGTB-204ENST00000461653 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RABGGTB-204ENST00000461653 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RABGGTB-204ENST00000461653 EHMT1Q9H9B1 1298 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGGTB-204ENST00000461653 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RABGGTB-204ENST00000461653 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RABGGTB-204ENST00000461653 TEKQ02763 1124 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGGTB-204ENST00000461653 APOBRQ0VD83 1088 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGGTB-204ENST00000461653 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RABGGTB-204ENST00000461653 GK5Q6ZS86 529 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGGTB-204ENST00000461653 OXR1Q8N573 874 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGGTB-204ENST00000461653 TMEM87AQ8NBN3 555 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGGTB-204ENST00000461653 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.25
RABGGTB-204ENST00000461653 SP110Q9HB58 689 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGGTB-204ENST00000461653 TSPAN15O95858 294 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGGTB-204ENST00000461653 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
RABGGTB-204ENST00000461653 RAP1GAPP47736 663 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGGTB-204ENST00000461653 CLCQ05315 142 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGGTB-204ENST00000461653 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGGTB-204ENST00000461653 CDCP2Q5VXM1 449 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGGTB-204ENST00000461653 TOX2Q96NM4 488 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGGTB-204ENST00000461653 RNF32Q9H0A6 362 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGGTB-204ENST00000461653 EPB41L4BQ9H329 900 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGGTB-204ENST00000461653 C19orf44Q9H6X5 657 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGGTB-204ENST00000461653 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
RABGGTB-204ENST00000461653 FITM1A5D6W6 292 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGGTB-204ENST00000461653 E9PSI1 815 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGGTB-204ENST00000461653 MCM4P33991 863 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGGTB-204ENST00000461653 LILRA2Q8N149 483 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGGTB-204ENST00000461653 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RABGGTB-204ENST00000461653 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RABGGTB-204ENST00000461653 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RABGGTB-204ENST00000461653 ATG4CQ96DT6 458 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGGTB-204ENST00000461653 HDAC8Q9BY41 377 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGGTB-204ENST00000461653 CNNM2Q9H8M5 875 aa7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms