RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
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USP46-201ENST00000441222 KDM5BQ9UGL1 1544 aa7.34□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 CAPN9O14815 690 aa7.34□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 OPHN1O60890 802 aa7.34□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 CHMLP26374 656 aa7.34□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 IDI1Q13907 227 aa7.34□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP7.34□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 SNX29Q8TEQ0 813 aa7.34□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa7.34□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP7.34□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 SMIM24O75264 130 aa7.34□□□□□ -1.23
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USP46-201ENST00000441222 ESRRGP62508 458 aa7.34□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 SLFN12Q8IYM2 578 aa7.34□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 BBS5Q8N3I7 341 aa7.34□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 PDZD8Q8NEN9 1154 aa7.34□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 MMEL1Q495T6 779 aa7.34□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 TRAPPC3LQ5T215 181 aa7.34□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 RAB20Q9NX57 234 aa7.34□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 USTQ9Y2C2 406 aa7.34□□□□□ -1.23
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USP46-201ENST00000441222 CHST3Q7LGC8 479 aa7.34□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 CHURC1Q8WUH1 139 aa7.34□□□□□ -1.23
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USP46-201ENST00000441222 MED4Q9NPJ6 270 aa7.34□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP7.34□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 MBD4O95243 580 aa7.34□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 SRGAP2BP0DMP2 458 aa7.34□□□□□ -1.23
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USP46-201ENST00000441222 GALNT17Q6IS24 598 aa7.34□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 CEP85Q6P2H3 762 aa7.34□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 KRT26Q7Z3Y9 468 aa7.34□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa7.34□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 PLIN2Q99541 437 aa7.34□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 ARHGAP42A6NI28 874 aa7.34□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 S100BP04271 92 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 CDC37L1Q7L3B6 337 aa7.34□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 CTAGE3PQ8IX95 158 aa7.34□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 VPS37BQ9H9H4 285 aa7.34□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 GGA1Q9UJY5 639 aa7.34□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 FANCAO15360 1455 aa7.34□□□□□ -1.24
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USP46-201ENST00000441222 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 XPOTO43592 962 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.24
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USP46-201ENST00000441222 CARD6Q9BX69 1037 aa7.33□□□□□ -1.24
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USP46-201ENST00000441222 RNF8O76064 485 aa7.33□□□□□ -1.24
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USP46-201ENST00000441222 KRT19P08727 400 aa7.33□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 HOXB7P09629 217 aa7.33□□□□□ -1.24
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USP46-201ENST00000441222 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa7.33□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa7.33□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa7.33□□□□□ -1.24
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USP46-201ENST00000441222 FAM83GA6ND36 823 aa7.33□□□□□ -1.24
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USP46-201ENST00000441222 SPDYE2Q495Y8 402 aa7.33□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 BEND3Q5T5X7 828 aa7.33□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 TUBB6Q9BUF5 446 aa7.33□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 TRIM31Q9BZY9 425 aa7.33□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 EFCC1Q9HA90 598 aa7.33□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa7.33□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa7.33□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa7.33□□□□□ -1.24
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