RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439083.5

TNS1-208, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 5

Gene TNS1, Length 538 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-208ENST00000439083 CEP290O15078 2479 aa17.35■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 CHGBP05060 677 aa17.34■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 HOXC6P09630 235 aa17.34■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 PTPREP23469 700 aa17.34■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 ICA1Q05084 483 aa17.34■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 SBK1Q52WX2 424 aa17.34■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 CTR9Q6PD62 1173 aa17.34■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 MB21D1Q8N884 522 aa17.34■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 KANSL2Q9H9L4 492 aa17.34■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 BTBD7Q9P203 1132 aa17.34■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 OGDHLQ9ULD0 1010 aa17.34■□□□□ 0.37
TNS1-208ENST00000439083 TTC41PQ6P2S7 1318 aa17.33■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 STRNO43815 780 aa17.33■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 AKR1B1P15121 316 aa17.33■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 APPBP2Q92624 585 aa17.33■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 NBPF3Q9H094 633 aa17.33■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 VCPKMTQ9H867 229 aa17.33■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa17.33■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa17.32■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 EVI5O60447 810 aa17.32■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 DSG3P32926 999 aa17.32■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 GRB14Q14449 540 aa17.32■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 SHCBP1Q8NEM2 672 aa17.32■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 TANGO6Q9C0B7 1094 aa17.32■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa17.32■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 PLXNB2O15031 1838 aa17.32■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 GSG1L2A8MUP6 293 aa17.31■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 ERC2O15083 957 aa17.31■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 WDR46O15213 610 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 GNAT2P19087 354 aa17.31■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 MFSD14CQ5VZR4 134 aa17.31■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 OSBP2Q969R2 916 aa17.31■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 SMIM22K7EJ46 135 aa17.3■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP17.3■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 CCL14Q16627 93 aa17.3■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa17.3■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 WDR78Q5VTH9 848 aa17.3■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 SPATC1LQ9H0A9 340 aa17.3■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 FLOT1O75955 427 aa17.29■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 IGHA2P01877 340 aa17.29■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 EEF2P13639 858 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 LHX8Q68G74 356 aa17.29■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 CHRDL2Q6WN34 429 aa17.29■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 ABRAQ8N0Z2 381 aa17.29■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 PRO3102Q9H379 93 aa17.29■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 MROH8Q9H579 483 aa17.29■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 GPAA1O43292 621 aa17.28■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 MSCO60682 206 aa17.28■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 ATP2B2Q01814 1243 aa17.28■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 TSHZ3Q63HK5 1081 aa17.28■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 CLEC10AQ8IUN9 316 aa17.28■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 SPICE1Q8N0Z3 855 aa17.28■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 PI4K2BQ8TCG2 481 aa17.28■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP17.28■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 C11orf49Q9H6J7 331 aa17.28■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 ZNF287Q9HBT7 754 aa17.28■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 GOPCQ9HD26 462 aa17.28■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa17.28■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 ROBO3Q96MS0 1386 aa17.28■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 A0A1W2PPC1 479 aa17.27■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 ERCC3P19447 782 aa17.27■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 OLFML2BQ68BL8 750 aa17.27■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 DPP9Q86TI2 863 aa17.27■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 ATG4CQ96DT6 458 aa17.27■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 MKNK2Q9HBH9 465 aa17.27■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 SLC5A4Q9NY91 659 aa17.27■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 NYAP2Q9P242 653 aa17.27■□□□□ 0.36
TNS1-208ENST00000439083 MYH7P12883 1935 aa17.26■□□□□ 0.35
TNS1-208ENST00000439083 SLC25A27O95847 323 aa17.26■□□□□ 0.35
TNS1-208ENST00000439083 COL6A1P12109 1028 aa17.26■□□□□ 0.35
TNS1-208ENST00000439083 RASA1P20936 1047 aa17.26■□□□□ 0.35
TNS1-208ENST00000439083 ADORA2AP29274 412 aa17.26■□□□□ 0.35
TNS1-208ENST00000439083 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
TNS1-208ENST00000439083 NPLOC4Q8TAT6 608 aa17.26■□□□□ 0.35
TNS1-208ENST00000439083 CRBNQ96SW2 442 aa17.26■□□□□ 0.35
TNS1-208ENST00000439083 FLRT1Q9NZU1 646 aa17.26■□□□□ 0.35
TNS1-208ENST00000439083 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
TNS1-208ENST00000439083 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
TNS1-208ENST00000439083 MINDY4BA8MYZ0 360 aa17.25■□□□□ 0.35
TNS1-208ENST00000439083 MX1P20591 662 aa17.25■□□□□ 0.35
TNS1-208ENST00000439083 TDO2P48775 406 aa17.25■□□□□ 0.35
TNS1-208ENST00000439083 NACAP1Q9BZK3 213 aa17.25■□□□□ 0.35
TNS1-208ENST00000439083 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
TNS1-208ENST00000439083 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa17.25■□□□□ 0.35
TNS1-208ENST00000439083 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa17.25■□□□□ 0.35
TNS1-208ENST00000439083 M0R2C6 588 aa17.24■□□□□ 0.35
TNS1-208ENST00000439083 APPP05067 770 aa17.24■□□□□ 0.35
TNS1-208ENST00000439083 COPB2P35606 906 aa17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms