RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437051.5

SGO1-208, Transcript of shugoshin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SGO1, Length 1,187 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1-208ENST00000437051 ZNF236Q9UL36 1845 aa22.31■■□□□ 1.16
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SGO1-208ENST00000437051 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SGO1-208ENST00000437051 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SGO1-208ENST00000437051 KBTBD3Q8NAB2 608 aa22.31■■□□□ 1.16
SGO1-208ENST00000437051 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SGO1-208ENST00000437051 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
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SGO1-208ENST00000437051 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
SGO1-208ENST00000437051 CHRDL2Q6WN34 429 aa22.3■■□□□ 1.16
SGO1-208ENST00000437051 APBA2Q99767 749 aa22.3■■□□□ 1.16
SGO1-208ENST00000437051 HTATIP2Q9BUP3 242 aa22.3■■□□□ 1.16
SGO1-208ENST00000437051 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
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SGO1-208ENST00000437051 TMX2Q9Y320 296 aa22.3■■□□□ 1.16
SGO1-208ENST00000437051 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa22.3■■□□□ 1.16
SGO1-208ENST00000437051 PTPREP23469 700 aa22.29■■□□□ 1.16
SGO1-208ENST00000437051 RGS2P41220 211 aa22.29■■□□□ 1.16
SGO1-208ENST00000437051 MAP2K5Q13163 448 aa22.29■■□□□ 1.16
SGO1-208ENST00000437051 PI4K2BQ8TCG2 481 aa22.29■■□□□ 1.16
SGO1-208ENST00000437051 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
SGO1-208ENST00000437051 ICA1Q05084 483 aa22.28■■□□□ 1.16
SGO1-208ENST00000437051 GRB14Q14449 540 aa22.28■■□□□ 1.16
SGO1-208ENST00000437051 LHX8Q68G74 356 aa22.28■■□□□ 1.16
SGO1-208ENST00000437051 NPLOC4Q8TAT6 608 aa22.28■■□□□ 1.16
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SGO1-208ENST00000437051 SALL3Q9BXA9 1300 aa22.28■■□□□ 1.16
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SGO1-208ENST00000437051 M0R2C6 588 aa22.27■■□□□ 1.16
SGO1-208ENST00000437051 CAPN2P17655 700 aa22.27■■□□□ 1.16
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SGO1-208ENST00000437051 ANKLE1Q8NAG6 615 aa22.27■■□□□ 1.16
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SGO1-208ENST00000437051 VCPKMTQ9H867 229 aa22.27■■□□□ 1.16
SGO1-208ENST00000437051 PFASO15067 1338 aa22.27■■□□□ 1.16
SGO1-208ENST00000437051 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.15
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SGO1-208ENST00000437051 HOXC6P09630 235 aa22.26■■□□□ 1.15
SGO1-208ENST00000437051 DSG3P32926 999 aa22.26■■□□□ 1.15
SGO1-208ENST00000437051 COG2Q14746 738 aa22.26■■□□□ 1.15
SGO1-208ENST00000437051 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa22.26■■□□□ 1.15
SGO1-208ENST00000437051 APPBP2Q92624 585 aa22.26■■□□□ 1.15
SGO1-208ENST00000437051 ATG4CQ96DT6 458 aa22.26■■□□□ 1.15
SGO1-208ENST00000437051 LAMA3Q16787 3333 aa22.26■■□□□ 1.15
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SGO1-208ENST00000437051 SBK1Q52WX2 424 aa22.25■■□□□ 1.15
SGO1-208ENST00000437051 TRPV1Q8NER1 839 aa22.25■■□□□ 1.15
SGO1-208ENST00000437051 CCDC17Q96LX7 622 aa22.25■■□□□ 1.15
SGO1-208ENST00000437051 TANGO6Q9C0B7 1094 aa22.25■■□□□ 1.15
SGO1-208ENST00000437051 PCDH10Q9P2E7 1040 aa22.25■■□□□ 1.15
SGO1-208ENST00000437051 COL6A1P12109 1028 aa22.24■■□□□ 1.15
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SGO1-208ENST00000437051 CCNA1P78396 465 aa22.24■■□□□ 1.15
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SGO1-208ENST00000437051 WDR78Q5VTH9 848 aa22.23■■□□□ 1.15
SGO1-208ENST00000437051 CRBNQ96SW2 442 aa22.23■■□□□ 1.15
SGO1-208ENST00000437051 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa22.23■■□□□ 1.15
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SGO1-208ENST00000437051 FOXP2O15409 715 aa22.22■■□□□ 1.15
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SGO1-208ENST00000437051 HOXC10Q9NYD6 342 aa22.22■■□□□ 1.15
SGO1-208ENST00000437051 TTC41PQ6P2S7 1318 aa22.22■■□□□ 1.15
SGO1-208ENST00000437051 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.21■■□□□ 1.15
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SGO1-208ENST00000437051 CYP2C19P33261 490 aa22.21■■□□□ 1.15
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SGO1-208ENST00000437051 SHCBP1Q8NEM2 672 aa22.21■■□□□ 1.15
SGO1-208ENST00000437051 NBPF3Q9H094 633 aa22.21■■□□□ 1.15
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SGO1-208ENST00000437051 C11orf49Q9H6J7 331 aa22.2■■□□□ 1.14
SGO1-208ENST00000437051 KANSL2Q9H9L4 492 aa22.2■■□□□ 1.14
SGO1-208ENST00000437051 NR2E3Q9Y5X4 410 aa22.2■■□□□ 1.14
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SGO1-208ENST00000437051 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
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SGO1-208ENST00000437051 MINDY4BA8MYZ0 360 aa22.18■■□□□ 1.14
SGO1-208ENST00000437051 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SGO1-208ENST00000437051 CYBAP13498 195 aa22.18■■□□□ 1.14
SGO1-208ENST00000437051 ATP2B2Q01814 1243 aa22.18■■□□□ 1.14
SGO1-208ENST00000437051 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.18■■□□□ 1.14
SGO1-208ENST00000437051 AMOTL1Q8IY63 956 aa22.18■■□□□ 1.14
SGO1-208ENST00000437051 C7orf61Q8IZ16 206 aa22.18■■□□□ 1.14
SGO1-208ENST00000437051 MB21D1Q8N884 522 aa22.18■■□□□ 1.14
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