RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435328.1

RAPGEF4-AS1-202, RAPGEF4 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RAPGEF4-AS1, Length 4,625 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 SIRT1Q96EB6 747 aa14.61□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa14.61□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 ENC1O14682 589 aa14.6□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 MFAP3LO75121 409 aa14.6□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 SEL1L2Q5TEA6 688 aa14.6□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 CCDC170Q8IYT3 715 aa14.6□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 VIPAS39Q9H9C1 493 aa14.6□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 HOMER3Q9NSC5 361 aa14.6□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 RASSF2P50749 326 aa14.6□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 SLC20A2Q08357 652 aa14.6□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 CCDC25Q86WR0 208 aa14.6□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 ACRBPQ8NEB7 543 aa14.6□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa14.6□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 BLZF1Q9H2G9 400 aa14.6□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 YY1AP1Q9H869 796 aa14.6□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 SLMAPQ14BN4 828 aa14.6□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 DENND2CQ68D51 928 aa14.6□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 ZNF790Q6PG37 636 aa14.6□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa14.6□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 FUCA2Q9BTY2 467 aa14.6□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 PARP2Q9UGN5 583 aa14.6□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 BAG3O95817 575 aa14.59□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 DESP17661 470 aa14.59□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 RPL13P26373 211 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 NNTQ13423 1086 aa14.59□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 KCTD16Q68DU8 428 aa14.59□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 RRAGAQ7L523 313 aa14.59□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 CCDC197Q8NCU1 140 aa14.59□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 WDR66Q8TBY9 1149 aa14.59□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 MYL10Q9BUA6 226 aa14.59□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 LGR6Q9HBX8 967 aa14.59□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 BTBD18B2RXH4 712 aa14.59□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 TRIM66O15016 1216 aa14.59□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 FLOT1O75955 427 aa14.59□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 NDUFA10O95299 355 aa14.59□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 ST5P78524 1137 aa14.59□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 CCDC65Q8IXS2 484 aa14.59□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 PLIN2Q99541 437 aa14.59□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 STX8Q9UNK0 236 aa14.59□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 PNPLA6Q8IY17 1366 aa14.59□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 KLHL30Q0D2K2 578 aa14.59□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 STAMQ92783 540 aa14.59□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 E9PCH4 1651 aa14.59□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 CTNNA2P26232 953 aa14.59□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 GUCY2DQ02846 1103 aa14.59□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa14.59□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 HDAC9Q9UKV0 1011 aa14.59□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 STAMBPO95630 424 aa14.58□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 BICDL1Q6ZP65 573 aa14.58□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 DAAM2Q86T65 1068 aa14.58□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 VAT1LQ9HCJ6 419 aa14.58□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 GPR108Q9NPR9 543 aa14.58□□□□□ -0.07
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 FGAP02671 866 aa14.58□□□□□ -0.08
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 NBPF9Q3BBW0 867 aa14.58□□□□□ -0.08
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 TSGA10IPQ3SY00 556 aa14.58□□□□□ -0.08
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 CLTAP09496 248 aa14.58□□□□□ -0.08
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 NR1D1P20393 614 aa14.58□□□□□ -0.08
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 GUCY2CP25092 1073 aa14.58□□□□□ -0.08
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 MXRA7P84157 204 aa14.58□□□□□ -0.08
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 TNIP1Q15025 636 aa14.58□□□□□ -0.08
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 PPP2R5AQ15172 486 aa14.58□□□□□ -0.08
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 NCAPH2Q6IBW4 605 aa14.58□□□□□ -0.08
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 PEX26Q7Z412 305 aa14.58□□□□□ -0.08
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 WHAMMQ8TF30 809 aa14.58□□□□□ -0.08
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 PRM3Q9NNZ6 103 aa14.58□□□□□ -0.08
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 TNRQ92752 1358 aa14.58□□□□□ -0.08
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 TSPY3P0CV98 308 aa14.58□□□□□ -0.08
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 TSPY8P0CW00 308 aa14.58□□□□□ -0.08
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 AKNAD1Q5T1N1 836 aa14.58□□□□□ -0.08
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 DCAF5Q96JK2 942 aa14.58□□□□□ -0.08
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 ANO9A1A5B4 782 aa14.57□□□□□ -0.08
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 CCDC169A6NNP5 214 aa14.57□□□□□ -0.08
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 ANKRD65E5RJM6 399 aa14.57□□□□□ -0.08
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 ZMYND10O75800 440 aa14.57□□□□□ -0.08
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP14.57□□□□□ -0.08
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 HOMER2Q9NSB8 354 aa14.57□□□□□ -0.08
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 ADGRG1Q9Y653 693 aa14.57□□□□□ -0.08
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 TET3O43151 1660 aa14.57□□□□□ -0.08
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 PLA2G4AP47712 749 aa14.57□□□□□ -0.08
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 CCDC152Q4G0S7 254 aa14.57□□□□□ -0.08
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 FYB2Q5VWT5 728 aa14.57□□□□□ -0.08
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 SYCP3Q8IZU3 236 aa14.57□□□□□ -0.08
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 CCHCR1Q8TD31 782 aa14.57□□□□□ -0.08
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms