RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434353.6

CXorf40A-208, Transcript of chromosome X open reading frame 40A, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene CXorf40A, Length 1,524 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CXorf40A-208ENST00000434353 SEC23AQ15436 765 aa22.17■■□□□ 1.14
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CXorf40A-208ENST00000434353 MAP2K2P36507 400 aa22.14■■□□□ 1.13
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CXorf40A-208ENST00000434353 C12orf42Q96LP6 360 aa22.14■■□□□ 1.13
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CXorf40A-208ENST00000434353 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa22.11■■□□□ 1.13
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CXorf40A-208ENST00000434353 TMTC2Q8N394 836 aa22.11■■□□□ 1.13
CXorf40A-208ENST00000434353 BRF1Q92994 677 aa22.11■■□□□ 1.13
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CXorf40A-208ENST00000434353 TANGO6Q9C0B7 1094 aa22.1■■□□□ 1.13
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CXorf40A-208ENST00000434353 MYL10Q9BUA6 226 aa22.09■■□□□ 1.13
CXorf40A-208ENST00000434353 PDHBP11177 359 aa22.08■■□□□ 1.13
CXorf40A-208ENST00000434353 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
CXorf40A-208ENST00000434353 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa22.08■■□□□ 1.13
CXorf40A-208ENST00000434353 SGMS1Q86VZ5 419 aa22.08■■□□□ 1.13
CXorf40A-208ENST00000434353 ZNF654Q8IZM8 581 aa22.08■■□□□ 1.13
CXorf40A-208ENST00000434353 DCAF4Q8WV16 495 aa22.08■■□□□ 1.13
CXorf40A-208ENST00000434353 SLC12A7Q9Y666 1083 aa22.08■■□□□ 1.13
CXorf40A-208ENST00000434353 USP17L15C9J2P7 530 aa22.07■■□□□ 1.12
CXorf40A-208ENST00000434353 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.07■■□□□ 1.12
CXorf40A-208ENST00000434353 USP17L11C9JVI0 530 aa22.07■■□□□ 1.12
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