RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429490.5

SGMS1-203, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 3,634 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-203ENST00000429490 TRIM10Q9UDY6 481 aa15.46■□□□□ 0.07
SGMS1-203ENST00000429490 SAR1BQ9Y6B6 198 aa15.46■□□□□ 0.07
SGMS1-203ENST00000429490 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa15.46■□□□□ 0.07
SGMS1-203ENST00000429490 PLEKHA8P1O95397 391 aa15.45■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 KRT18P05783 430 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 COPB1P53618 953 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 PTPAQ15257 358 aa15.45■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 MFAP3LO75121 409 aa15.45■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 BMP15O95972 392 aa15.45■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 KRT31Q15323 416 aa15.45■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 OR8K1Q8NGG5 319 aa15.45■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 GOLGA5Q8TBA6 731 aa15.45■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 SALL1Q9NSC2 1324 aa15.45■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 TRIM49BA6NDI0 452 aa15.45■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 MNAT1P51948 309 aa15.45■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 KRT83P78385 493 aa15.45■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 TRIML1Q8N9V2 468 aa15.45■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 MCM9Q9NXL9 1143 aa15.45■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP15.45■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 ATP2C2O75185 946 aa15.44■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 MCM3P25205 808 aa15.44■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 PTPROQ16827 1216 aa15.44■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 LETM2Q2VYF4 491 aa15.44■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa15.44■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 DIP2AQ14689 1571 aa15.44■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 DIP2BQ9P265 1576 aa15.44■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 GNAT2P19087 354 aa15.44■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 CXCR5P32302 372 aa15.44■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 CCDC152Q4G0S7 254 aa15.44■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa15.44■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 FAM76AQ8TAV0 307 aa15.44■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 CHP1Q99653 195 aa15.44■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 BMP6P22004 513 aa15.43■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 PDE4DQ08499 809 aa15.43■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP15.43■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 MAATS1Q7Z4T9 603 aa15.43■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 RFX7Q2KHR2 1363 aa15.43■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 GOLGA6CA6NDK9 693 aa15.43■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 EBAG9O00559 213 aa15.43■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 ATP8B1O43520 1251 aa15.43■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 RNF40O75150 1001 aa15.43■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 GOLGA6DP0CG33 693 aa15.43■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 LIFRP42702 1097 aa15.43■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 CUL4BQ13620 913 aa15.43■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 CCDC93Q567U6 631 aa15.43■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 TYW1BQ6NUM6 668 aa15.43■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 EXOC4Q96A65 974 aa15.43■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 FERMT2Q96AC1 680 aa15.43■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 POLD4Q9HCU8 107 aa15.43■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa15.43■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP15.43■□□□□ 0.063e-7■■■■□ 23.1
SGMS1-203ENST00000429490 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 NCAPD2Q15021 1401 aa15.43■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 B4DLN1 442 aa15.43■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 TACC1O75410 805 aa15.43■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 KIF5BP33176 963 aa15.43■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa15.43■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 CADPS2Q86UW7 1296 aa15.43■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 RTL9Q8NET4 1388 aa15.43■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 INTS13Q9NVM9 706 aa15.43■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 GOLGA6BA6NDN3 693 aa15.42■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 GOLGA6L10A6NI86 522 aa15.42■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 H3BQF6 201 aa15.42■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 NLRP10Q86W26 655 aa15.42■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 PNKPQ96T60 521 aa15.42■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 KCNJ6P48051 423 aa15.42■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa15.42■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 EHBP1Q8NDI1 1231 aa15.42■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 GSDMAQ96QA5 445 aa15.42■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 PANX2Q96RD6 677 aa15.42■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 FUT8Q9BYC5 575 aa15.42■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa15.42■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 HPSEQ9Y251 543 aa15.42■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 C3P01024 1663 aa15.42■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 ALS2CR12Q96Q35 445 aa15.42■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 NOP2P46087 812 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 LIG3P49916 1009 aa15.41■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 CASP7P55210 303 aa15.41■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 CCDC40Q4G0X9 1142 aa15.41■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 DYMQ7RTS9 669 aa15.41■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 ATG3Q9NT62 314 aa15.41■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 TMEM51Q9NW97 253 aa15.41■□□□□ 0.06
SGMS1-203ENST00000429490 NMT2O60551 498 aa15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms