RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418674.1

PTPRC-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 462 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-207ENST00000418674 SLAMF8Q9P0V8 285 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-207ENST00000418674 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-207ENST00000418674 GBP1P32455 592 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-207ENST00000418674 NAALADL2Q58DX5 795 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-207ENST00000418674 DTWD2Q8NBA8 298 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-207ENST00000418674 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-207ENST00000418674 KREMEN1Q96MU8 473 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-207ENST00000418674 ASPNQ9BXN1 380 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-207ENST00000418674 GPR62Q9BZJ7 368 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-207ENST00000418674 TGIF2Q9GZN2 237 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-207ENST00000418674 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-207ENST00000418674 LRRC10BA6NIK2 292 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-207ENST00000418674 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-207ENST00000418674 ESR1P03372 595 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-207ENST00000418674 C8AP07357 584 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-207ENST00000418674 GLI1P08151 1106 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-207ENST00000418674 SRFP11831 508 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-207ENST00000418674 RAC2P15153 192 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-207ENST00000418674 RAG1P15918 1043 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-207ENST00000418674 TMEM67Q5HYA8 995 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-207ENST00000418674 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-207ENST00000418674 FYB2Q5VWT5 728 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-207ENST00000418674 TTC6Q86TZ1 520 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-207ENST00000418674 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-207ENST00000418674 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-207ENST00000418674 KIF2CQ99661 725 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-207ENST00000418674 BRMS1Q9HCU9 246 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-207ENST00000418674 C19orf73Q9NVV2 129 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-207ENST00000418674 DUSP13Q9UII6 198 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-207ENST00000418674 TMEM59LQ9UK28 342 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-207ENST00000418674 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-207ENST00000418674 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-207ENST00000418674 WASH4PA8MWX3 477 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-207ENST00000418674 GREM1O60565 184 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-207ENST00000418674 DNAJA2O60884 412 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-207ENST00000418674 LRRN2O75325 713 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-207ENST00000418674 ATE1O95260 518 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-207ENST00000418674 LTKP29376 864 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-207ENST00000418674 RNF4P78317 190 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-207ENST00000418674 EGR3Q06889 387 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-207ENST00000418674 PKN1Q16512 942 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-207ENST00000418674 MLANAQ16655 118 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-207ENST00000418674 GAB4Q2WGN9 574 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-207ENST00000418674 ARSHQ5FYA8 562 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-207ENST00000418674 MPZL3Q6UWV2 235 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-207ENST00000418674 KSR1Q8IVT5 923 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-207ENST00000418674 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-207ENST00000418674 SLC38A3Q99624 504 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-207ENST00000418674 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-207ENST00000418674 GMIPQ9P107 970 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-207ENST00000418674 USP35Q9P2H5 1018 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-207ENST00000418674 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-207ENST00000418674 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-207ENST00000418674 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-207ENST00000418674 SLC22A31A6NKX4 558 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-207ENST00000418674 RGS13O14921 159 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-207ENST00000418674 MCM4P33991 863 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-207ENST00000418674 CRKP46108 304 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-207ENST00000418674 ZNF165P49910 485 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-207ENST00000418674 HK2P52789 917 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-207ENST00000418674 APOBRQ0VD83 1088 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-207ENST00000418674 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-207ENST00000418674 SEZ6Q53EL9 994 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-207ENST00000418674 RALGPS1Q5JS13 557 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-207ENST00000418674 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-207ENST00000418674 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-207ENST00000418674 FAM84AQ96KN4 292 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-207ENST00000418674 TINF2Q9BSI4 451 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-207ENST00000418674 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-207ENST00000418674 UBP1Q9NZI7 540 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-207ENST00000418674 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-207ENST00000418674 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-207ENST00000418674 RACK1P63244 317 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-207ENST00000418674 ZNF394Q53GI3 561 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-207ENST00000418674 OVOS1Q6IE37 1185 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-207ENST00000418674 GK5Q6ZS86 529 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-207ENST00000418674 USP48Q86UV5 1035 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-207ENST00000418674 KIAA0825Q8IV33 1275 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-207ENST00000418674 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-207ENST00000418674 SLC43A3Q8NBI5 491 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-207ENST00000418674 ABHD4Q8TB40 342 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-207ENST00000418674 MYLIPQ8WY64 445 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-207ENST00000418674 NKD1Q969G9 470 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-207ENST00000418674 DRC1Q96MC2 740 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-207ENST00000418674 NT5C1AQ9BXI3 368 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-207ENST00000418674 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-207ENST00000418674 ADAMTS10Q9H324 1103 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-207ENST00000418674 ACBD3Q9H3P7 528 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-207ENST00000418674 CCSER2Q9H7U1 834 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-207ENST00000418674 EHMT1Q9H9B1 1298 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-207ENST00000418674 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-207ENST00000418674 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-207ENST00000418674 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-207ENST00000418674 UBOX5O94941 541 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-207ENST00000418674 HPXP02790 462 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-207ENST00000418674 CLCQ05315 142 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-207ENST00000418674 ZNF124Q15973 351 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-207ENST00000418674 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-207ENST00000418674 CDCP2Q5VXM1 449 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-207ENST00000418674 NLRC3Q7RTR2 1065 aa4.56□□□□□ -1.68
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