RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 BMP3P12645 472 aa8.77□□□□□ -1.01
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CCL20-202ENST00000409189 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
CCL20-202ENST00000409189 BEND4Q6ZU67 534 aa8.77□□□□□ -1.01
CCL20-202ENST00000409189 GJD3Q8N144 294 aa8.77□□□□□ -1.01
CCL20-202ENST00000409189 SLC7A3Q8WY07 619 aa8.77□□□□□ -1.01
CCL20-202ENST00000409189 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
CCL20-202ENST00000409189 POLR3GLQ9BT43 218 aa8.77□□□□□ -1.01
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CCL20-202ENST00000409189 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
CCL20-202ENST00000409189 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
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CCL20-202ENST00000409189 FAM13AO94988 1023 aa8.76□□□□□ -1.01
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CCL20-202ENST00000409189 ARL4DP49703 201 aa8.76□□□□□ -1.01
CCL20-202ENST00000409189 SMIM5Q71RC9 77 aa8.76□□□□□ -1.01
CCL20-202ENST00000409189 AMIGO3Q86WK7 504 aa8.76□□□□□ -1.01
CCL20-202ENST00000409189 DTX1Q86Y01 620 aa8.76□□□□□ -1.01
CCL20-202ENST00000409189 CDK19Q9BWU1 502 aa8.76□□□□□ -1.01
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CCL20-202ENST00000409189 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
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CCL20-202ENST00000409189 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa8.74□□□□□ -1.01
CCL20-202ENST00000409189 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
CCL20-202ENST00000409189 SHKBP1Q8TBC3 707 aa8.74□□□□□ -1.01
CCL20-202ENST00000409189 MRS2Q9HD23 443 aa8.74□□□□□ -1.01
CCL20-202ENST00000409189 USP54Q70EL1 1684 aa8.73□□□□□ -1.01
CCL20-202ENST00000409189 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
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CCL20-202ENST00000409189 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
CCL20-202ENST00000409189 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa8.73□□□□□ -1.01
CCL20-202ENST00000409189 PXDNLA1KZ92 1463 aa8.72□□□□□ -1.01
CCL20-202ENST00000409189 PKD1L3Q7Z443 1732 aa8.72□□□□□ -1.01
CCL20-202ENST00000409189 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa8.72□□□□□ -1.01
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CCL20-202ENST00000409189 KCNF1Q9H3M0 494 aa8.72□□□□□ -1.01
CCL20-202ENST00000409189 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa8.72□□□□□ -1.01
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CCL20-202ENST00000409189 C9orf131Q5VYM1 1079 aa8.71□□□□□ -1.02
CCL20-202ENST00000409189 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa8.71□□□□□ -1.02
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CCL20-202ENST00000409189 PANK3Q9H999 370 aa8.71□□□□□ -1.02
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CCL20-202ENST00000409189 CCDC87Q9NVE4 849 aa8.71□□□□□ -1.02
CCL20-202ENST00000409189 RNF114Q9Y508 228 aa8.71□□□□□ -1.02
CCL20-202ENST00000409189 NFAT5O94916 1531 aa8.7□□□□□ -1.02
CCL20-202ENST00000409189 C5P01031 1676 aa8.7□□□□□ -1.02
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CCL20-202ENST00000409189 IL2RBP14784 551 aa8.7□□□□□ -1.02
CCL20-202ENST00000409189 SMC1BQ8NDV3 1235 aa8.7□□□□□ -1.02
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CCL20-202ENST00000409189 CYP4F12Q9HCS2 524 aa8.7□□□□□ -1.02
CCL20-202ENST00000409189 KNSTRNQ9Y448 316 aa8.7□□□□□ -1.02
CCL20-202ENST00000409189 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa8.7□□□□□ -1.02
CCL20-202ENST00000409189 ZBED9Q6R2W3 1325 aa8.7□□□□□ -1.02
CCL20-202ENST00000409189 TAF1LQ8IZX4 1826 aa8.7□□□□□ -1.02
CCL20-202ENST00000409189 NSD3Q9BZ95 1437 aa8.7□□□□□ -1.02
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CCL20-202ENST00000409189 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
CCL20-202ENST00000409189 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CCL20-202ENST00000409189 USP26Q9BXU7 913 aa8.69□□□□□ -1.02
CCL20-202ENST00000409189 NLRP2Q9NX02 1062 aa8.69□□□□□ -1.02
CCL20-202ENST00000409189 KIF13BQ9NQT8 1826 aa8.68□□□□□ -1.02
CCL20-202ENST00000409189 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CCL20-202ENST00000409189 A0A0G2JLW4 131 aa8.68□□□□□ -1.02
CCL20-202ENST00000409189 AAMPQ13685 434 aa8.68□□□□□ -1.02
CCL20-202ENST00000409189 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CCL20-202ENST00000409189 CCNJLQ8IV13 435 aa8.68□□□□□ -1.02
CCL20-202ENST00000409189 ASAP3Q8TDY4 903 aa8.68□□□□□ -1.02
CCL20-202ENST00000409189 EGFL7Q9UHF1 273 aa8.68□□□□□ -1.02
CCL20-202ENST00000409189 CARNS1A5YM72 827 aa8.67□□□□□ -1.02
CCL20-202ENST00000409189 METTL12A8MUP2 240 aa8.67□□□□□ -1.02
CCL20-202ENST00000409189 WDR64B1ANS9 1081 aa8.67□□□□□ -1.02
CCL20-202ENST00000409189 LBX1P52954 281 aa8.67□□□□□ -1.02
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