RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384354.1

RNU6-171P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 171, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-171P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-171P-201ENST00000384354 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
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RNU6-171P-201ENST00000384354 A0A1W2PQY0 241 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 USP17L15C9J2P7 530 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 C19orf81C9J6K1 198 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 USP17L13C9JLJ4 530 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 USP17L11C9JVI0 530 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 USP17L18D6R9N7 530 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 USP17L22D6RA61 530 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 USP17L17D6RBQ6 530 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 USP17L19D6RCP7 530 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 USP17L20D6RJB6 530 aa6.67□□□□□ -1.34
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RNU6-171P-201ENST00000384354 ACRP10323 421 aa6.67□□□□□ -1.34
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RNU6-171P-201ENST00000384354 PLCD1P51178 756 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 PPP4CP60510 307 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAAP100Q0VG06 881 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 USP17L24Q0WX57 530 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 MAP3K12Q12852 859 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 MVPQ14764 893 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 SEPT2Q15019 361 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 RAB3GAP1Q15042 981 aa6.67□□□□□ -1.34
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RNU6-171P-201ENST00000384354 LBX2Q6XYB7 198 aa6.67□□□□□ -1.34
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RNU6-171P-201ENST00000384354 SLF2Q8IX21 1173 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
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RNU6-171P-201ENST00000384354 ATG4CQ96DT6 458 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 MAML3Q96JK9 1138 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF576Q9H609 170 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 ANTXR1Q9H6X2 564 aa6.67□□□□□ -1.34
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RNU6-171P-201ENST00000384354 KBTBD13C9JR72 458 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 KIAA0355O15063 1070 aa6.66□□□□□ -1.34
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RNU6-171P-201ENST00000384354 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 C11orf16Q9NQ32 467 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 FBXO28Q9NVF7 368 aa6.66□□□□□ -1.34
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RNU6-171P-201ENST00000384354 MSCO60682 206 aa6.65□□□□□ -1.34
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RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM240Q5SV17 173 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 RASIP1Q5U651 963 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 C1orf53Q5VUE5 145 aa6.65□□□□□ -1.34
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RNU6-171P-201ENST00000384354 DPP9Q86TI2 863 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 SPICE1Q8N0Z3 855 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
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RNU6-171P-201ENST00000384354 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
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RNU6-171P-201ENST00000384354 EPHX3Q9H6B9 360 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 THEGQ9P2T0 379 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa6.65□□□□□ -1.35
RNU6-171P-201ENST00000384354 SIP14410 1827 aa6.64□□□□□ -1.35
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