RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381514.7

MRPL23-201, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L23, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene MRPL23, Length 919 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23-201ENST00000381514 ZNF280CQ8ND82 737 aa20.52■□□□□ 0.88
MRPL23-201ENST00000381514 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
MRPL23-201ENST00000381514 GOPCQ9HD26 462 aa20.52■□□□□ 0.88
MRPL23-201ENST00000381514 TACC3Q9Y6A5 838 aa20.52■□□□□ 0.88
MRPL23-201ENST00000381514 TNKSO95271 1327 aa20.52■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 PLIN4Q96Q06 1357 aa20.51■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 USP17L10C9JJH3 530 aa20.51■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 TOP1P11387 765 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 EEF2P13639 858 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 CATIPQ7Z7H3 387 aa20.51■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 OPTNQ96CV9 577 aa20.51■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 OTUD5Q96G74 571 aa20.51■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 WDR18Q9BV38 432 aa20.51■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 TMOD4Q9NZQ9 345 aa20.51■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa20.51■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 LAMA4Q16363 1823 aa20.5■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 SPDYE5A6NIY4 337 aa20.5■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 C19orf81C9J6K1 198 aa20.5■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 SPP2Q13103 211 aa20.5■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 Q6ZUG5 572 aa20.5■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 IL17RAQ96F46 866 aa20.5■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 CLMNQ96JQ2 1002 aa20.5■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 IL17RBQ9NRM6 502 aa20.5■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa20.5■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 TRIM75PA6NK02 468 aa20.49■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 CXCL11O14625 94 aa20.49■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 NMT2O60551 498 aa20.49■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 LIFRP42702 1097 aa20.49■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 PPIL2Q13356 520 aa20.49■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 SLC12A7Q9Y666 1083 aa20.49■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa20.48■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 CALM1P0DP23 149 aa20.48■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 CALM2P0DP24 149 aa20.48■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 CALM3P0DP25 149 aa20.48■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 CPA1P15085 419 aa20.48■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 GTF2A2P52657 109 aa20.48■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 SNAPC2Q13487 334 aa20.48■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 USP17L2Q6R6M4 530 aa20.48■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 ANKS1AQ92625 1134 aa20.48■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 MKL1Q969V6 931 aa20.48■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 CHMP4CQ96CF2 233 aa20.48■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 ERO1AQ96HE7 468 aa20.48■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 LRRC2Q9BYS8 371 aa20.48■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 GUCY1A2P33402 732 aa20.47■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 BACE1P56817 501 aa20.47■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 ANTXR2P58335 489 aa20.47■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 JAG1P78504 1218 aa20.47■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa20.47■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa20.47■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 TCEANC2Q96MN5 208 aa20.47■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 TMEM47Q9BQJ4 181 aa20.47■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 TMX2Q9Y320 296 aa20.47■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa20.47■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 TRIM17Q9Y577 477 aa20.47■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 MYH8P13535 1937 aa20.47■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 SIPA1L1O43166 1804 aa20.46■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 MCM2P49736 904 aa20.46■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 PNMA1Q8ND90 353 aa20.46■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 BRF1Q92994 677 aa20.46■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 WNK4Q96J92 1243 aa20.46■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa20.46■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 MTMR7Q9Y216 660 aa20.46■□□□□ 0.87
MRPL23-201ENST00000381514 CETPP11597 493 aa20.45■□□□□ 0.86
MRPL23-201ENST00000381514 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP20.45■□□□□ 0.863e-6■■■■■ 29.1
MRPL23-201ENST00000381514 MTMR2Q13614 643 aa20.45■□□□□ 0.86
MRPL23-201ENST00000381514 ARHGEF6Q15052 776 aa20.45■□□□□ 0.86
MRPL23-201ENST00000381514 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
MRPL23-201ENST00000381514 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
MRPL23-201ENST00000381514 SPRYD7Q5W111 196 aa20.45■□□□□ 0.86
MRPL23-201ENST00000381514 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
MRPL23-201ENST00000381514 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
MRPL23-201ENST00000381514 FBXL16Q8N461 479 aa20.45■□□□□ 0.86
MRPL23-201ENST00000381514 NUP133Q8WUM0 1156 aa20.45■□□□□ 0.86
MRPL23-201ENST00000381514 LPAR1Q92633 364 aa20.45■□□□□ 0.86
MRPL23-201ENST00000381514 F5H6K3 240 aa20.44■□□□□ 0.86
MRPL23-201ENST00000381514 IRF6O14896 467 aa20.44■□□□□ 0.86
MRPL23-201ENST00000381514 KIF5BP33176 963 aa20.44■□□□□ 0.86
MRPL23-201ENST00000381514 SLC1A4P43007 532 aa20.44■□□□□ 0.86
MRPL23-201ENST00000381514 KLRC3Q07444 240 aa20.44■□□□□ 0.86
MRPL23-201ENST00000381514 SEC23AQ15436 765 aa20.44■□□□□ 0.86
MRPL23-201ENST00000381514 SLFN13Q68D06 897 aa20.44■□□□□ 0.86
MRPL23-201ENST00000381514 OTOP1Q7RTM1 612 aa20.44■□□□□ 0.86
MRPL23-201ENST00000381514 CLEC10AQ8IUN9 316 aa20.44■□□□□ 0.86
MRPL23-201ENST00000381514 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
MRPL23-201ENST00000381514 ACER1Q8TDN7 264 aa20.44■□□□□ 0.86
MRPL23-201ENST00000381514 TMEM106CQ9BVX2 250 aa20.44■□□□□ 0.86
MRPL23-201ENST00000381514 VCPKMTQ9H867 229 aa20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms