RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
AMIGO1-201ENST00000369862 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa27.23■■□□□ 1.95
AMIGO1-201ENST00000369862 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
AMIGO1-201ENST00000369862 NPY5RQ15761 445 aa27.22■■□□□ 1.95
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa27.22■■□□□ 1.95
AMIGO1-201ENST00000369862 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa27.22■■□□□ 1.95
AMIGO1-201ENST00000369862 USP49Q70CQ1 688 aa27.22■■□□□ 1.95
AMIGO1-201ENST00000369862 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
AMIGO1-201ENST00000369862 TMEM139Q8IV31 216 aa27.22■■□□□ 1.95
AMIGO1-201ENST00000369862 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
AMIGO1-201ENST00000369862 CEP131Q9UPN4 1083 aa27.22■■□□□ 1.95
AMIGO1-201ENST00000369862 ZBTB22O15209 634 aa27.22■■□□□ 1.95
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AMIGO1-201ENST00000369862 FAM196AQ6ZSG2 479 aa27.22■■□□□ 1.95
AMIGO1-201ENST00000369862 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
AMIGO1-201ENST00000369862 USP17L8P0C7I0 530 aa27.21■■□□□ 1.95
AMIGO1-201ENST00000369862 CLCN6P51797 869 aa27.21■■□□□ 1.95
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM193AP78312 1265 aa27.21■■□□□ 1.95
AMIGO1-201ENST00000369862 CSRNP2Q9H175 543 aa27.21■■□□□ 1.95
AMIGO1-201ENST00000369862 INTS13Q9NVM9 706 aa27.21■■□□□ 1.95
AMIGO1-201ENST00000369862 MCM9Q9NXL9 1143 aa27.21■■□□□ 1.95
AMIGO1-201ENST00000369862 SERTAD1Q9UHV2 236 aa27.21■■□□□ 1.95
AMIGO1-201ENST00000369862 WNT7AO00755 349 aa27.21■■□□□ 1.95
AMIGO1-201ENST00000369862 PDE4BQ07343 736 aa27.21■■□□□ 1.95
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AMIGO1-201ENST00000369862 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
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AMIGO1-201ENST00000369862 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
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AMIGO1-201ENST00000369862 POSTNQ15063 836 aa27.2■■□□□ 1.95
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AMIGO1-201ENST00000369862 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.95
AMIGO1-201ENST00000369862 TNFRSF25Q93038 417 aa27.2■■□□□ 1.95
AMIGO1-201ENST00000369862 TRIM75PA6NK02 468 aa27.2■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 GRIK5Q16478 980 aa27.2■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 NT5DC1Q5TFE4 455 aa27.2■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 RCSD1Q6JBY9 416 aa27.2■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa27.19■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 TAF3Q5VWG9 929 aa27.19■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 PDILTQ8N807 584 aa27.19■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 CNBD1Q8NA66 436 aa27.19■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 MNS1Q8NEH6 495 aa27.19■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 DACH1Q9UI36 760 aa27.19■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 MAN1B1Q9UKM7 699 aa27.19■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa27.19■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 LEMD3Q9Y2U8 911 aa27.19■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 FHOD1Q9Y613 1164 aa27.19■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa27.18■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 MLKLQ8NB16 471 aa27.18■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 LRRC4BQ9NT99 713 aa27.18■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 PARP3Q9Y6F1 533 aa27.18■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 VWA3AA6NCI4 1184 aa27.18■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 TSPY2A6NKD2 308 aa27.18■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 EFCAB8A8MWE9 144 aa27.18■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 FANCGO15287 622 aa27.18■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 URI1O94763 535 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
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AMIGO1-201ENST00000369862 TADA3O75528 432 aa27.17■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 LDHBP07195 334 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 GOLGA8FQ08AF8 430 aa27.17■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa27.17■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 STX10O60499 249 aa27.17■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 TPM1P09493 284 aa27.17■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF18P17022 549 aa27.17■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 SARSP49591 514 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 DIXDC1Q155Q3 683 aa27.17■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 WDR66Q8TBY9 1149 aa27.17■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 XDHP47989 1333 aa27.16■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 C12orf60Q5U649 245 aa27.16■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 TRIML1Q8N9V2 468 aa27.16■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa27.16■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa27.16■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 PRR5LQ6MZQ0 368 aa27.16■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 IL17RBQ9NRM6 502 aa27.16■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 A0A087X0B3 334 aa27.15■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 MORC3Q14149 939 aa27.15■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 SMARCE1Q969G3 411 aa27.15■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 DYNLL2Q96FJ2 89 aa27.15■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa27.15■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP27.14■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 EPSTI1Q96J88 318 aa27.14■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 BRMS1Q9HCU9 246 aa27.14■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 USP5P45974 858 aa27.14■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 TFAP4Q01664 338 aa27.14■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 PTPN21Q16825 1174 aa27.14■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 TMCO3Q6UWJ1 677 aa27.14■■□□□ 1.94
AMIGO1-201ENST00000369862 ADAMTS3O15072 1205 aa27.13■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 SCG2P13521 617 aa27.13■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
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