RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
PTPRC-202ENST00000367364 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
PTPRC-202ENST00000367364 FAM8A1Q9UBU6 413 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRC-202ENST00000367364 MAPK1P28482 360 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRC-202ENST00000367364 TEKQ02763 1124 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRC-202ENST00000367364 CHRNEQ04844 493 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRC-202ENST00000367364 SPPL2CQ8IUH8 684 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRC-202ENST00000367364 FEZF2Q8TBJ5 459 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRC-202ENST00000367364 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
PTPRC-202ENST00000367364 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
PTPRC-202ENST00000367364 LRRN2O75325 713 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRC-202ENST00000367364 SASH1O94885 1247 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRC-202ENST00000367364 ANKS4BQ8N8V4 417 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRC-202ENST00000367364 LINC01599Q8WXQ3 324 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRC-202ENST00000367364 SIGLEC10Q96LC7 697 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRC-202ENST00000367364 G6PC3Q9BUM1 346 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRC-202ENST00000367364 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
PTPRC-202ENST00000367364 SLC22A31A6NKX4 558 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRC-202ENST00000367364 CELA3BP08861 270 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRC-202ENST00000367364 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRC-202ENST00000367364 EPHB3P54753 998 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRC-202ENST00000367364 RPS26P62854 115 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRC-202ENST00000367364 ALG1LQ6GMV1 187 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRC-202ENST00000367364 KCNH3Q9ULD8 1083 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF281Q9Y2X9 895 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRC-202ENST00000367364 IRAK3Q9Y616 596 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRC-202ENST00000367364 OR14I1A6ND48 311 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRC-202ENST00000367364 DUSP4Q13115 394 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRC-202ENST00000367364 NLRX1Q86UT6 975 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRC-202ENST00000367364 SIRT2Q8IXJ6 389 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRC-202ENST00000367364 ADAM30Q9UKF2 790 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRC-202ENST00000367364 SPG7Q9UQ90 795 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRC-202ENST00000367364 SHISA3A0PJX4 238 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRC-202ENST00000367364 ADRB1P08588 477 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRC-202ENST00000367364 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRC-202ENST00000367364 ADGRF1Q5T601 910 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRC-202ENST00000367364 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRC-202ENST00000367364 HRKO00198 91 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRC-202ENST00000367364 VMACQ2NL98 169 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRC-202ENST00000367364 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRC-202ENST00000367364 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRC-202ENST00000367364 UPK3BL1B0FP48 263 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRC-202ENST00000367364 UPK3BL2E5RIL1 263 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRC-202ENST00000367364 PDE4BQ07343 736 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRC-202ENST00000367364 AGMOQ6ZNB7 445 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRC-202ENST00000367364 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRC-202ENST00000367364 SYT8Q8NBV8 401 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRC-202ENST00000367364 RNF141Q8WVD5 230 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRC-202ENST00000367364 CNTD2Q9H8S5 307 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRC-202ENST00000367364 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRC-202ENST00000367364 CORINQ9Y5Q5 1042 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRC-202ENST00000367364 N4BP3O15049 544 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRC-202ENST00000367364 VIPR1P32241 457 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRC-202ENST00000367364 TMEFF1Q8IYR6 380 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRC-202ENST00000367364 ADAM7Q9H2U9 754 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRC-202ENST00000367364 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRC-202ENST00000367364 SIRT5Q9NXA8 310 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRC-202ENST00000367364 USP2O75604 605 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRC-202ENST00000367364 LMNB1P20700 586 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRC-202ENST00000367364 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRC-202ENST00000367364 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRC-202ENST00000367364 LIG3P49916 1009 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRC-202ENST00000367364 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRC-202ENST00000367364 EFEMP1Q12805 493 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRC-202ENST00000367364 FAM13CQ8NE31 585 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRC-202ENST00000367364 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRC-202ENST00000367364 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRC-202ENST00000367364 NRDCO43847 1150 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRC-202ENST00000367364 SDHBP21912 280 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRC-202ENST00000367364 CDR1P51861 262 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRC-202ENST00000367364 MAP3K11Q16584 847 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRC-202ENST00000367364 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRC-202ENST00000367364 SP8Q8IXZ3 490 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRC-202ENST00000367364 RETREG2Q8NC44 543 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRC-202ENST00000367364 BORCS6Q96GS4 357 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRC-202ENST00000367364 TEPSINQ96N21 525 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRC-202ENST00000367364 CRTAC1Q9NQ79 661 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRC-202ENST00000367364 YBX1P67809 324 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRC-202ENST00000367364 ATP2B2Q01814 1243 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRC-202ENST00000367364 KREMEN1Q96MU8 473 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRC-202ENST00000367364 PLCG1P19174 1290 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRC-202ENST00000367364 ERICH6BQ5W0A0 696 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRC-202ENST00000367364 FAM129CQ86XR2 697 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRC-202ENST00000367364 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM201Q5SNT2 666 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRC-202ENST00000367364 CNKSR3Q6P9H4 555 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRC-202ENST00000367364 MZB1Q8WU39 189 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRC-202ENST00000367364 MAP6Q96JE9 813 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRC-202ENST00000367364 ASPNQ9BXN1 380 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRC-202ENST00000367364 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRC-202ENST00000367364 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
PTPRC-202ENST00000367364 RPL10P27635 214 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
PTPRC-202ENST00000367364 YARSP54577 528 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
PTPRC-202ENST00000367364 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
PTPRC-202ENST00000367364 SPATS1Q496A3 300 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRC-202ENST00000367364 IGDCC3Q8IVU1 814 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRC-202ENST00000367364 SLFN12Q8IYM2 578 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRC-202ENST00000367364 USHBP1Q8N6Y0 703 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRC-202ENST00000367364 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
PTPRC-202ENST00000367364 ASB16Q96NS5 453 aa8.26□□□□□ -1.09
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