RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 KBTBD3Q8NAB2 608 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 FAM161BQ96MY7 647 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 ANTXR1Q9H6X2 564 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 SMC3Q9UQE7 1217 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 C5P01031 1676 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa5.12□□□□□ -1.59
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PTPRC-201ENST00000348564 GOLGA8HP0CJ92 632 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 ELNP15502 786 aa5.12□□□□□ -1.59
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PTPRC-201ENST00000348564 ABHD8Q96I13 439 aa5.12□□□□□ -1.59
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PTPRC-201ENST00000348564 SLC26A6Q9BXS9 759 aa5.11□□□□□ -1.59
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PTPRC-201ENST00000348564 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
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PTPRC-201ENST00000348564 MED23Q9ULK4 1368 aa5.11□□□□□ -1.59
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PTPRC-201ENST00000348564 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 SPDYE2Q495Y8 402 aa5.11□□□□□ -1.59
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PTPRC-201ENST00000348564 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa5.1□□□□□ -1.59
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PTPRC-201ENST00000348564 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 CASTP20810 708 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 FAM83AQ86UY5 434 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 ZDHHC15Q96MV8 337 aa5.1□□□□□ -1.59
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