RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325558.10

PGA3-201, Transcript of pepsinogen 3, group I (pepsinogen A), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGA3, Length 1,748 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3-201ENST00000325558 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa13□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 ZNF75DP51815 510 aa13□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 SLC15A2Q16348 729 aa13□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 LONRF3Q496Y0 759 aa13□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 AMOTL1Q8IY63 956 aa13□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 KCNH3Q9ULD8 1083 aa13□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP13□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 MYO3BQ8WXR4 1341 aa12.99□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 A0A087WWV3 80 aa12.99□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 TSPY3P0CV98 308 aa12.99□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 TSPY8P0CW00 308 aa12.99□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 TRAPPC10P48553 1259 aa12.99□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 SARSP49591 514 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 NLRP12P59046 1061 aa12.99□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 NT5DC1Q5TFE4 455 aa12.99□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 TYW1BQ6NUM6 668 aa12.99□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 POTEAQ6S8J7 498 aa12.99□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 KRBA2Q6ZNG9 492 aa12.99□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 C2CD5Q86YS7 1000 aa12.99□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 DAGLBQ8NCG7 672 aa12.99□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 EYA3Q99504 573 aa12.99□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 LZTS2Q9BRK4 669 aa12.99□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 SIPA1L1O43166 1804 aa12.99□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 TRIM75PA6NK02 468 aa12.99□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 CDC25BP30305 580 aa12.99□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 NCAPHQ15003 741 aa12.99□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 DOK7Q18PE1 504 aa12.99□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa12.99□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 DACT2Q5SW24 774 aa12.99□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 C4orf32Q8N8J7 132 aa12.99□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 SPATA20Q8TB22 786 aa12.99□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 MXD3Q9BW11 206 aa12.99□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 SPZ1Q9BXG8 430 aa12.99□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 CEP131Q9UPN4 1083 aa12.99□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 NPM3O75607 178 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 BMP15O95972 392 aa12.98□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 TOP1P11387 765 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 DPCR1Q3MIW9 517 aa12.98□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 STRIP1Q5VSL9 837 aa12.98□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa12.98□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 ZDHHC15Q96MV8 337 aa12.98□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 KCNQ5Q9NR82 932 aa12.98□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 PSME4Q14997 1843 aa12.98□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 H0YIN7 160 aa12.97□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 OFD1O75665 1012 aa12.97□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 SNHG28P0DPA3 235 aa12.97□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 MSL1Q68DK7 614 aa12.97□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 USP49Q70CQ1 688 aa12.97□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa12.97□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 CEP57L1Q8IYX8 460 aa12.97□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 CEP95Q96GE4 821 aa12.97□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa12.97□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 HSD3B7Q9H2F3 369 aa12.97□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 MYH8P13535 1937 aa12.97□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 TPM3P06753 285 aa12.96□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 BMP6P22004 513 aa12.96□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 CALML3P27482 149 aa12.96□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 GALNT17Q6IS24 598 aa12.96□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 CNKSR1Q969H4 720 aa12.96□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 FERMT2Q96AC1 680 aa12.96□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 CSRNP2Q9H175 543 aa12.96□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 KCNF1Q9H3M0 494 aa12.96□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 USP40Q9NVE5 1235 aa12.96□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 MTMR4Q9NYA4 1195 aa12.96□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 TAOK2Q9UL54 1235 aa12.96□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 PCDHA4Q9UN74 947 aa12.96□□□□□ -0.33
PGA3-201ENST00000325558 STXBP3O00186 592 aa12.96□□□□□ -0.34
PGA3-201ENST00000325558 SOCS7O14512 581 aa12.96□□□□□ -0.34
PGA3-201ENST00000325558 MSNP26038 577 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.34
PGA3-201ENST00000325558 SHMT1P34896 483 aa12.96□□□□□ -0.34
PGA3-201ENST00000325558 NLRP5P59047 1200 aa12.96□□□□□ -0.34
PGA3-201ENST00000325558 IL17AQ16552 155 aa12.96□□□□□ -0.34
PGA3-201ENST00000325558 TTC38Q5R3I4 469 aa12.96□□□□□ -0.34
PGA3-201ENST00000325558 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa12.96□□□□□ -0.34
PGA3-201ENST00000325558 BLIDQ8IZY5 108 aa12.96□□□□□ -0.34
PGA3-201ENST00000325558 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP12.96□□□□□ -0.34
PGA3-201ENST00000325558 IDI2Q9BXS1 227 aa12.96□□□□□ -0.34
PGA3-201ENST00000325558 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.34
PGA3-201ENST00000325558 EHD4Q9H223 541 aa12.96□□□□□ -0.34
PGA3-201ENST00000325558 RIOX1Q9H6W3 641 aa12.96□□□□□ -0.34
PGA3-201ENST00000325558 BARHL2Q9NY43 387 aa12.96□□□□□ -0.34
PGA3-201ENST00000325558 SWAP70Q9UH65 585 aa12.96□□□□□ -0.34
PGA3-201ENST00000325558 A0A087X0B3 334 aa12.95□□□□□ -0.34
PGA3-201ENST00000325558 KLRF2D3W0D1 207 aa12.95□□□□□ -0.34
PGA3-201ENST00000325558 IKBKBO14920 756 aa12.95□□□□□ -0.34
PGA3-201ENST00000325558 CRKP46108 304 aa12.95□□□□□ -0.34
PGA3-201ENST00000325558 SPECC1Q5M775 1068 aa12.95□□□□□ -0.34
PGA3-201ENST00000325558 WWC2Q6AWC2 1192 aa12.95□□□□□ -0.34
PGA3-201ENST00000325558 TEKT1Q969V4 418 aa12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 158.1 ms