RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 DDX11Q96FC9 970 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 LY9Q9HBG7 655 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 MTMR6Q9Y217 621 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 CD2APQ9Y5K6 639 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 PTPDC1A2A3K4 754 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 F13A1P00488 732 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 USP17L8P0C7I0 530 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 PTGDRQ13258 359 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 TTC6Q86TZ1 520 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 LARGE2Q8N3Y3 721 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 USP40Q9NVE5 1235 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 TACC3Q9Y6A5 838 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 TSPY2A6NKD2 308 aa11.79□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 JAK2O60674 1132 aa11.79□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 PRDM1O75626 825 aa11.79□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 CALM1P0DP23 149 aa11.79□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 CALM2P0DP24 149 aa11.79□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 CALM3P0DP25 149 aa11.79□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 NCLP19338 710 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 SCNN1DP51172 638 aa11.79□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP11.79□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 RHBDL3P58872 404 aa11.79□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 DACT2Q5SW24 774 aa11.79□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 CATIPQ7Z7H3 387 aa11.79□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 RGS22Q8NE09 1264 aa11.79□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 KCNQ5Q9NR82 932 aa11.79□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP11.79□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 MYH7P12883 1935 aa11.78□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 DOCK2Q92608 1830 aa11.78□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 GOLGA8AA7E2F4 631 aa11.78□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 TERTO14746 1132 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 CTDNEP1O95476 244 aa11.78□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 MICU3Q86XE3 530 aa11.78□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 KIAA0825Q8IV33 1275 aa11.78□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 ZDHHC15Q96MV8 337 aa11.78□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa11.78□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 SERPINA10Q9UK55 444 aa11.78□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa11.78□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 MYO3BQ8WXR4 1341 aa11.78□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 CACNA1SQ13698 1873 aa11.77□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 CYP2D6P10635 497 aa11.77□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 ADD1P35611 737 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 CRKP46108 304 aa11.77□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 DGKHQ86XP1 1220 aa11.77□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 OGFOD1Q8N543 542 aa11.77□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 FANCBQ8NB91 859 aa11.77□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 WASF1Q92558 559 aa11.77□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 MXD3Q9BW11 206 aa11.77□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 DUOX1Q9NRD9 1551 aa11.77□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 TNKSO95271 1327 aa11.77□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 TSPY3P0CV98 308 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 TSPY8P0CW00 308 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 IARSP41252 1262 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 PLCD1P51178 756 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 TFAP4Q01664 338 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 SEC23AQ15436 765 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 RTN1Q16799 776 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 NIM1KQ8IY84 436 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIM22Q8IYM9 498 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF654Q8IZM8 581 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 NUP133Q8WUM0 1156 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 JDP2Q8WYK2 163 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 LMBRD1Q9NUN5 540 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 HDAC9Q9UKV0 1011 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNRF3Q9ULT6 936 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 QSER1Q2KHR3 1735 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 FLT1P17948 1338 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1B0GUL6 1792 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM181BA6NEQ2 426 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRC37AA6NMS7 1700 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 SMIM22K7EJ46 135 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 HLA-DOAP06340 250 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 VIL1P09327 827 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 IFNAR1P17181 557 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 CDK8P49336 464 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM47AQ5JRC9 791 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 C16orf86Q6ZW13 317 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 DYNLL2Q96FJ2 89 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGGTB-201ENST00000319942 C8orf76Q96K31 380 aa11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms