RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 MYH6P13533 1939 aa24.09■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 PHF20L1A8MW92 1017 aa24.09■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 PLEKHA8P1O95397 391 aa24.09■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 GNAQP50148 359 aa24.09■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa24.09■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa24.09■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 MKL1Q969V6 931 aa24.09■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC26A6Q9BXS9 759 aa24.09■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 ZDHHC9Q9Y397 364 aa24.09■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 ASNSP08243 561 aa24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 NBPF11Q86T75 865 aa24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC82Q8N4S0 544 aa24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF341Q9BYN7 854 aa24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 MAD2L2Q9UI95 211 aa24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-201ENST00000298838 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-201ENST00000298838 POTECB2RU33 542 aa24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-201ENST00000298838 H3BQV1 296 aa24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-201ENST00000298838 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-201ENST00000298838 PDHBP11177 359 aa24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-201ENST00000298838 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-201ENST00000298838 IFFO2Q5TF58 517 aa24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-201ENST00000298838 KRT26Q7Z3Y9 468 aa24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-201ENST00000298838 WASF1Q92558 559 aa24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-201ENST00000298838 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-201ENST00000298838 MTMR6Q9Y217 621 aa24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-201ENST00000298838 SSC5DA1L4H1 1573 aa24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-201ENST00000298838 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-201ENST00000298838 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-201ENST00000298838 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-201ENST00000298838 FUT2Q10981 343 aa24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-201ENST00000298838 SIAH1Q8IUQ4 282 aa24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-201ENST00000298838 LZTS2Q9BRK4 669 aa24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-201ENST00000298838 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-201ENST00000298838 GINM1Q9NU53 330 aa24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-201ENST00000298838 ADM5C9JUS6 153 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-201ENST00000298838 DEXIO95424 95 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-201ENST00000298838 SNHG28P0DPA3 235 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-201ENST00000298838 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-201ENST00000298838 STAG2Q8N3U4 1231 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-201ENST00000298838 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-201ENST00000298838 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-201ENST00000298838 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-201ENST00000298838 DOCK1Q14185 1865 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-201ENST00000298838 USP17L5A8MUK1 530 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-201ENST00000298838 ASPRV1Q53RT3 343 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-201ENST00000298838 USP17L2Q6R6M4 530 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-201ENST00000298838 RASGRP2Q7LDG7 609 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-201ENST00000298838 C8orf76Q96K31 380 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-201ENST00000298838 ALG1Q9BT22 464 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-201ENST00000298838 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
PACSIN3-201ENST00000298838 CDC37L1Q7L3B6 337 aa24.04■■□□□ 1.44
PACSIN3-201ENST00000298838 KLRF2D3W0D1 207 aa24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-201ENST00000298838 GOLGA8HP0CJ92 632 aa24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-201ENST00000298838 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-201ENST00000298838 WRNIP1Q96S55 665 aa24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-201ENST00000298838 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF112Q9UJU3 913 aa24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-201ENST00000298838 RAD21O60216 631 aa24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-201ENST00000298838 F13A1P00488 732 aa24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-201ENST00000298838 FOSBP53539 338 aa24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-201ENST00000298838 USP48Q86UV5 1035 aa24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-201ENST00000298838 RGS22Q8NE09 1264 aa24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-201ENST00000298838 SH2D4AQ9H788 454 aa24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-201ENST00000298838 V9GY48 417 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
PACSIN3-201ENST00000298838 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 INPP5BP32019 993 aa24.01■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF543Q08ER8 600 aa24.01■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 SLFN13Q68D06 897 aa24.01■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa24.01■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 DCAF4Q8WV16 495 aa24.01■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 GBP4Q96PP9 640 aa24.01■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 TMX2Q9Y320 296 aa24.01■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A1W2PRG0 241 aa24■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 F5H6K3 240 aa24■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 UBE2Q2LH0YL09 131 aa24■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 SMARCA1P28370 1054 aa24■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 KLRC3Q07444 240 aa24■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 TRIM29Q14134 588 aa24■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC96Q2M329 555 aa24■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 KLRG1Q96E93 195 aa24■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 AIFM3Q96NN9 605 aa24■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 SPZ1Q9BXG8 430 aa24■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC1A4P43007 532 aa24■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 SCYL3Q8IZE3 742 aa24■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 GMCL1Q96IK5 515 aa24■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 GOPCQ9HD26 462 aa24■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa24■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 NF2P35240 595 aa23.99■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 ECE1P42892 770 aa23.99■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 GUCY1B3Q02153 619 aa23.99■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 ACER1Q8TDN7 264 aa23.99■■□□□ 1.43
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