RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298317.8

RPUSD4-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPUSD4, Length 2,512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4-201ENST00000298317 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
RPUSD4-201ENST00000298317 GSDMAQ96QA5 445 aa15.21■□□□□ 0.03
RPUSD4-201ENST00000298317 SH3GL2Q99962 352 aa15.21■□□□□ 0.03
RPUSD4-201ENST00000298317 EHD4Q9H223 541 aa15.21■□□□□ 0.03
RPUSD4-201ENST00000298317 CEP131Q9UPN4 1083 aa15.21■□□□□ 0.03
RPUSD4-201ENST00000298317 SHTN1A0MZ66 631 aa15.2■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 CCDC189A1A4V9 331 aa15.2■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 N4BP3O15049 544 aa15.2■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 INPP5BP32019 993 aa15.2■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 GUCY1A2P33402 732 aa15.2■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 KRT9P35527 623 aa15.2■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 SCARF1Q14162 830 aa15.2■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 ZNF662Q6ZS27 426 aa15.2■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 CHP1Q99653 195 aa15.2■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 MYL10Q9BUA6 226 aa15.2■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP15.2■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa15.2■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa15.2■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 B4E1Z4 1266 aa15.2■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 SRGAP2O75044 1071 aa15.2■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 ZMYND10O75800 440 aa15.2■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 IFNAR1P17181 557 aa15.2■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 FAM69CQ0P6D2 419 aa15.2■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 HOMEZQ8IX15 550 aa15.2■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 FAM184BQ9ULE4 1060 aa15.2■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 KCNJ14Q9UNX9 436 aa15.2■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 ATRNO75882 1429 aa15.2■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 LRP6O75581 1613 aa15.19■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 ADORA1P30542 326 aa15.19■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 AFMP43652 599 aa15.19■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 COPB1P53618 953 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 NFXL1Q6ZNB6 911 aa15.19■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 CTNND2Q9UQB3 1225 aa15.19■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 GOLGA8KD6RF30 607 aa15.19■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 CASP1P29466 404 aa15.19■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 ATP6V1AP38606 617 aa15.19■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 LIFRP42702 1097 aa15.19■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 ZAP70P43403 619 aa15.19■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 HERVK_113P62684 666 aa15.19■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 GNGT1P63211 74 aa15.19■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 SPAG1Q07617 926 aa15.19■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 RPAINQ86UA6 219 aa15.19■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 XAGE2Q96GT9 111 aa15.19■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 PKD1L3Q7Z443 1732 aa15.19■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 JAKMIP2Q96AA8 810 aa15.18■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 CAPZA3Q96KX2 299 aa15.18■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 SKOR1P84550 965 aa15.18■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 NR5A1Q13285 461 aa15.18■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 TMEM67Q5HYA8 995 aa15.18■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 EHBP1Q8NDI1 1231 aa15.18■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 VPS16Q9H269 839 aa15.18■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 CEP126Q9P2H0 1117 aa15.18■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 EPB41P11171 864 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 KCNA6P17658 529 aa15.17■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 FNTAP49354 379 aa15.17■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 AMOTL1Q8IY63 956 aa15.17■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 RUBCNQ92622 972 aa15.17■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 TAB2Q9NYJ8 693 aa15.17■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 SLC12A7Q9Y666 1083 aa15.17■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 GLI3P10071 1580 aa15.17■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 ANO9A1A5B4 782 aa15.17■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 TCP11X2Q5H9J9 407 aa15.17■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 CCDC122Q5T0U0 273 aa15.17■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 EPSTI1Q96J88 318 aa15.17■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 DNAJC7Q99615 494 aa15.17■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 RWDD2AQ9UIY3 292 aa15.17■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 NUP188Q5SRE5 1749 aa15.16■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 FSBPO95073 299 aa15.16■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 ADD2P35612 726 aa15.16■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 DDR1Q08345 913 aa15.16■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 RNF217Q8TC41 542 aa15.16■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 A6NNZ2 444 aa15.16■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 TUBB8Q3ZCM7 444 aa15.16■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 IQCEQ6IPM2 695 aa15.16■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 PI16Q6UXB8 463 aa15.16■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 OR8K1Q8NGG5 319 aa15.16■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 CABS1Q96KC9 395 aa15.16■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 TTC26A0AVF1 554 aa15.15■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 KCNJ18B7U540 433 aa15.15■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 IRF6O14896 467 aa15.15■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 KCNJ12Q14500 433 aa15.15■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 TRIM22Q8IYM9 498 aa15.15■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 CAGE1Q8TC20 777 aa15.15■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 OXER1Q8TDS5 423 aa15.15■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP15.15■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 RABEP2Q9H5N1 569 aa15.15■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 TFR2Q9UP52 801 aa15.15■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 CAPN7Q9Y6W3 813 aa15.15■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 OPA1O60313 960 aa15.15■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 COBLO75128 1261 aa15.15■□□□□ 0.02
RPUSD4-201ENST00000298317 DEXIO95424 95 aa15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms