RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 GH2P01242 217 aa9.63□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 ADORA2AP29274 412 aa9.63□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 PPP4CP60510 307 aa9.63□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 COG2Q14746 738 aa9.63□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC41Q15345 812 aa9.63□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC158Q5M9N0 1113 aa9.63□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa9.63□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM199Q8N511 208 aa9.63□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC44A5Q8NCS7 719 aa9.63□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 NPLOC4Q8TAT6 608 aa9.63□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 FERMT2Q96AC1 680 aa9.63□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa9.63□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 PHF24Q9UPV7 400 aa9.63□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 RLFQ13129 1914 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM43BA6NCK2 446 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 PEX10O60683 326 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 FCER1AP12319 257 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 VCAM1P19320 739 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 IGFBP4P22692 258 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 USP5P45974 858 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 ABCB5Q2M3G0 1257 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 ALDH1L2Q3SY69 923 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 PHF12Q96QT6 1004 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 SPATC1LQ9H0A9 340 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 SPC25Q9HBM1 224 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 STARD7Q9NQZ5 370 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 SERPINB13Q9UIV8 391 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 PALD1Q9ULE6 856 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 CNPY2Q9Y2B0 182 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 MOXD2PA6NHM9 499 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 APBB1O00213 710 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 TLR3O15455 904 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
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PGGT1B-201ENST00000296642 SLC25A27O95847 323 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 TIMP1P01033 207 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 GNAI3P08754 354 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 AKR1A1P14550 325 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 COPB2P35606 906 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP9.61□□□□□ -0.87
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PGGT1B-201ENST00000296642 TTC39AQ5SRH9 613 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 ANO1Q5XXA6 986 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa9.61□□□□□ -0.87
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PGGT1B-201ENST00000296642 USP38Q8NB14 1042 aa9.61□□□□□ -0.87
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PGGT1B-201ENST00000296642 EHD4Q9H223 541 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 SH2D4AQ9H788 454 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC28A3Q9HAS3 691 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 VCANP13611 3396 aa9.6□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 ERCC3P19447 782 aa9.6□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 TFCP2Q12800 502 aa9.6□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 KCTD2Q14681 263 aa9.6□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM47AQ5JRC9 791 aa9.6□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 MFSD5Q6N075 450 aa9.6□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa9.6□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 TRPV1Q8NER1 839 aa9.6□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 SMC4Q9NTJ3 1288 aa9.6□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 BTBD7Q9P203 1132 aa9.6□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF236Q9UL36 1845 aa9.6□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa9.59□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1W2PQY0 241 aa9.59□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 E9PSI1 815 aa9.59□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 ANP32CO43423 234 aa9.59□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 TATDN1Q6P1N9 297 aa9.59□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 SSH1Q8WYL5 1049 aa9.59□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 HERVK_113Q902F9 699 aa9.59□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 MAML3Q96JK9 1138 aa9.59□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 PRDM12Q9H4Q4 367 aa9.59□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 DNAJC18Q9H819 358 aa9.59□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 TTC28Q96AY4 2481 aa9.59□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PGGT1B-201ENST00000296642 FLOT1O75955 427 aa9.58□□□□□ -0.88
PGGT1B-201ENST00000296642 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM31Q5JXX7 168 aa9.58□□□□□ -0.88
PGGT1B-201ENST00000296642 POTEEQ6S8J3 1075 aa9.58□□□□□ -0.88
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