RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296031.4

CXCL2-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXCL2, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2-201ENST00000296031 RUFY2Q8WXA3 655 aa29.64■■■□□ 2.34
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CXCL2-201ENST00000296031 VCPKMTQ9H867 229 aa29.64■■■□□ 2.34
CXCL2-201ENST00000296031 MYH4Q9Y623 1939 aa29.64■■■□□ 2.34
CXCL2-201ENST00000296031 SPICE1Q8N0Z3 855 aa29.63■■■□□ 2.33
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CXCL2-201ENST00000296031 NYAP2Q9P242 653 aa29.63■■■□□ 2.33
CXCL2-201ENST00000296031 TACC3Q9Y6A5 838 aa29.63■■■□□ 2.33
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CXCL2-201ENST00000296031 RAD21O60216 631 aa29.61■■■□□ 2.33
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CXCL2-201ENST00000296031 MORF4L1Q9UBU8 362 aa29.61■■■□□ 2.33
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CXCL2-201ENST00000296031 ZNF213O14771 459 aa29.59■■■□□ 2.33
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CXCL2-201ENST00000296031 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
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CXCL2-201ENST00000296031 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa29.59■■■□□ 2.33
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CXCL2-201ENST00000296031 TTLL1O95922 423 aa29.58■■■□□ 2.33
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CXCL2-201ENST00000296031 PRMT2P55345 433 aa29.58■■■□□ 2.33
CXCL2-201ENST00000296031 BMP2KLQ5H9B9 411 aa29.58■■■□□ 2.33
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CXCL2-201ENST00000296031 SRRDQ9UH36 339 aa29.58■■■□□ 2.33
CXCL2-201ENST00000296031 CTNNA3Q9UI47 895 aa29.58■■■□□ 2.33
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CXCL2-201ENST00000296031 AKNAD1Q5T1N1 836 aa29.57■■■□□ 2.32
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CXCL2-201ENST00000296031 F5H6K3 240 aa29.55■■■□□ 2.32
CXCL2-201ENST00000296031 ERVK-9P63128 1117 aa29.55■■■□□ 2.32
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CXCL2-201ENST00000296031 KLRC3Q07444 240 aa29.55■■■□□ 2.32
CXCL2-201ENST00000296031 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa29.55■■■□□ 2.32
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CXCL2-201ENST00000296031 Q3C1V9 767 aa29.53■■■□□ 2.32
CXCL2-201ENST00000296031 FAM83BQ5T0W9 1011 aa29.53■■■□□ 2.32
CXCL2-201ENST00000296031 COA7Q96BR5 231 aa29.53■■■□□ 2.32
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CXCL2-201ENST00000296031 NDUFB10O96000 172 aa29.52■■■□□ 2.32
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CXCL2-201ENST00000296031 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
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CXCL2-201ENST00000296031 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
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CXCL2-201ENST00000296031 NOVP48745 357 aa29.49■■■□□ 2.31
CXCL2-201ENST00000296031 ESR2Q92731 530 aa29.49■■■□□ 2.31
CXCL2-201ENST00000296031 PORCNQ9H237 461 aa29.49■■■□□ 2.31
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