RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 MCTP2Q6DN12 878 aa23.4■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 VSIG1Q86XK7 387 aa23.4■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 H7C1D1 291 aa23.4■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 CTSWP56202 376 aa23.4■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 BLIDQ8IZY5 108 aa23.4■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 PPP2R5EQ16537 467 aa23.4■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa23.4■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 DCUN1D2Q6PH85 259 aa23.4■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 CDAN1Q8IWY9 1227 aa23.4■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 HAUS4Q9H6D7 363 aa23.4■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 NLRC4Q9NPP4 1024 aa23.4■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 ODF2LQ9ULJ1 636 aa23.4■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 EFCAB8A8MWE9 144 aa23.39■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 STK10O94804 968 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 MORC3Q14149 939 aa23.39■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 NAA25Q14CX7 972 aa23.39■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 PICK1Q9NRD5 415 aa23.39■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 LGSNQ5TDP6 509 aa23.39■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa23.39■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 GPT2Q8TD30 523 aa23.39■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa23.39■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 KRT71Q3SY84 523 aa23.39■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC8AQ8IWT6 810 aa23.39■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 IWS1Q96ST2 819 aa23.39■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHA7Q9UN72 937 aa23.39■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PQ27 194 aa23.39■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PQ64 194 aa23.39■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PQD8 194 aa23.39■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 HHATQ5VTY9 493 aa23.39■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 OSBPL3Q9H4L5 887 aa23.39■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 USP17L12C9JPN9 530 aa23.38■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 USP17L21D6R901 530 aa23.38■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 MYOCDQ8IZQ8 938 aa23.38■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa23.38■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 TMOD4Q9NZQ9 345 aa23.38■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 AMFRQ9UKV5 643 aa23.38■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 PDE6AP16499 860 aa23.38■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 POLD1P28340 1107 aa23.38■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 GALNT17Q6IS24 598 aa23.38■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 LMNTD2Q8IXW0 634 aa23.38■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 HYOU1Q9Y4L1 999 aa23.38■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 STAT1P42224 750 aa23.38■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 FAM47AQ5JRC9 791 aa23.38■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 GMNNO75496 209 aa23.38■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 ADD1P35611 737 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 HSPA1LP34931 641 aa23.37■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 ITIH3Q06033 890 aa23.37■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGAP24Q8N264 748 aa23.37■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 CEP85LQ5SZL2 805 aa23.37■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 MAP4K1Q92918 833 aa23.37■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.37■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 SPATA1Q5VX52 437 aa23.37■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 RPS8P62241 208 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 PKP1Q13835 747 aa23.37■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 VPS52Q8N1B4 723 aa23.37■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 ADCY9O60503 1353 aa23.36■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa23.36■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 DENND2CQ68D51 928 aa23.36■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.36■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 GBP1P32455 592 aa23.36■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 RASA3Q14644 834 aa23.36■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 COPRSQ9NQ92 184 aa23.36■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 ERCC3P19447 782 aa23.36■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa23.36■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 ATP10AO60312 1499 aa23.36■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 FGAP02671 866 aa23.36■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 TCP1P17987 556 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 PCK1P35558 622 aa23.36■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 LRMPQ12912 555 aa23.36■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 MCUR1Q96AQ8 359 aa23.36■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 CLEC11AQ9Y240 323 aa23.36■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 CFBP00751 764 aa23.35■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 FANCLQ9NW38 375 aa23.35■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC62Q6P9F0 684 aa23.35■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 MAEAQ7L5Y9 396 aa23.35■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 TNKSO95271 1327 aa23.35■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 ZBED4O75132 1171 aa23.35■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 HOOK2Q96ED9 719 aa23.35■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 RTEL1Q9NZ71 1219 aa23.35■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 PCP11498 1178 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 DESI2Q9BSY9 194 aa23.34■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 KRT15P19012 456 aa23.34■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 LONRF2Q1L5Z9 754 aa23.34■■□□□ 1.33
CCSAP-201ENST00000284617 USH1GQ495M9 461 aa23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms