RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
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HTATSF1-201ENST00000218364 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
HTATSF1-201ENST00000218364 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
HTATSF1-201ENST00000218364 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
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HTATSF1-201ENST00000218364 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP25.09■■□□□ 1.61
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HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF569Q5MCW4 686 aa25.09■■□□□ 1.61
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HTATSF1-201ENST00000218364 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
HTATSF1-201ENST00000218364 CYP7A1P22680 504 aa25.08■■□□□ 1.61
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HTATSF1-201ENST00000218364 GPS2Q13227 327 aa25.08■■□□□ 1.61
HTATSF1-201ENST00000218364 NPY5RQ15761 445 aa25.08■■□□□ 1.61
HTATSF1-201ENST00000218364 E2F4Q16254 413 aa25.08■■□□□ 1.61
HTATSF1-201ENST00000218364 SUSD4Q5VX71 490 aa25.08■■□□□ 1.61
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HTATSF1-201ENST00000218364 ADGRA1Q86SQ6 560 aa25.08■■□□□ 1.61
HTATSF1-201ENST00000218364 V9GY48 417 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
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HTATSF1-201ENST00000218364 BRMS1Q9HCU9 246 aa25.07■■□□□ 1.6
HTATSF1-201ENST00000218364 PSD3Q9NYI0 1048 aa25.07■■□□□ 1.6
HTATSF1-201ENST00000218364 CTAGE9A4FU28 777 aa25.07■■□□□ 1.6
HTATSF1-201ENST00000218364 PRDM1O75626 825 aa25.07■■□□□ 1.6
HTATSF1-201ENST00000218364 MUM1L1Q5H9M0 696 aa25.07■■□□□ 1.6
HTATSF1-201ENST00000218364 TTC38Q5R3I4 469 aa25.07■■□□□ 1.6
HTATSF1-201ENST00000218364 CATIPQ7Z7H3 387 aa25.07■■□□□ 1.6
HTATSF1-201ENST00000218364 SDR42E1Q8WUS8 393 aa25.07■■□□□ 1.6
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HTATSF1-201ENST00000218364 KRT31Q15323 416 aa25.06■■□□□ 1.6
HTATSF1-201ENST00000218364 NEK11Q8NG66 645 aa25.06■■□□□ 1.6
HTATSF1-201ENST00000218364 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa25.06■■□□□ 1.6
HTATSF1-201ENST00000218364 MYO1AQ9UBC5 1043 aa25.06■■□□□ 1.6
HTATSF1-201ENST00000218364 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
HTATSF1-201ENST00000218364 RWDD2AQ9UIY3 292 aa25.06■■□□□ 1.6
HTATSF1-201ENST00000218364 CTNND2Q9UQB3 1225 aa25.06■■□□□ 1.6
HTATSF1-201ENST00000218364 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa25.06■■□□□ 1.6
HTATSF1-201ENST00000218364 PLEKHA8P1O95397 391 aa25.06■■□□□ 1.6
HTATSF1-201ENST00000218364 CALM1P0DP23 149 aa25.06■■□□□ 1.6
HTATSF1-201ENST00000218364 CALM2P0DP24 149 aa25.06■■□□□ 1.6
HTATSF1-201ENST00000218364 CALM3P0DP25 149 aa25.06■■□□□ 1.6
HTATSF1-201ENST00000218364 TROAPQ12815 778 aa25.06■■□□□ 1.6
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF174Q15697 407 aa25.06■■□□□ 1.6
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HTATSF1-201ENST00000218364 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
HTATSF1-201ENST00000218364 FGRP09769 529 aa25.05■■□□□ 1.6
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HTATSF1-201ENST00000218364 SLC35F6Q8N357 371 aa25.05■■□□□ 1.6
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HTATSF1-201ENST00000218364 ABHD10Q9NUJ1 306 aa25.05■■□□□ 1.6
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HTATSF1-201ENST00000218364 TRIM14Q14142 442 aa25.05■■□□□ 1.6
HTATSF1-201ENST00000218364 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
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HTATSF1-201ENST00000218364 PDXDC2PQ6P474 469 aa25.05■■□□□ 1.6
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HTATSF1-201ENST00000218364 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC152Q4G0S7 254 aa25.04■■□□□ 1.6
HTATSF1-201ENST00000218364 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa25.04■■□□□ 1.6
HTATSF1-201ENST00000218364 SMIM22K7EJ46 135 aa25.04■■□□□ 1.6
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HTATSF1-201ENST00000218364 ARHGAP25P42331 645 aa25.04■■□□□ 1.6
HTATSF1-201ENST00000218364 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa25.04■■□□□ 1.6
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HTATSF1-201ENST00000218364 CYP26C1Q6V0L0 522 aa25.04■■□□□ 1.6
HTATSF1-201ENST00000218364 TMTC3Q6ZXV5 915 aa25.04■■□□□ 1.6
HTATSF1-201ENST00000218364 ACRBPQ8NEB7 543 aa25.04■■□□□ 1.6
HTATSF1-201ENST00000218364 PNKPQ96T60 521 aa25.04■■□□□ 1.6
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HTATSF1-201ENST00000218364 N4BP3O15049 544 aa25.03■■□□□ 1.6
HTATSF1-201ENST00000218364 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
HTATSF1-201ENST00000218364 DDAH1O94760 285 aa25.03■■□□□ 1.6
HTATSF1-201ENST00000218364 COPB1P53618 953 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
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HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF804BA4D1E1 1349 aa25.03■■□□□ 1.6
HTATSF1-201ENST00000218364 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
HTATSF1-201ENST00000218364 TRAPPC10P48553 1259 aa25.03■■□□□ 1.6
HTATSF1-201ENST00000218364 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
HTATSF1-201ENST00000218364 BRIP1Q9BX63 1249 aa25.03■■□□□ 1.6
HTATSF1-201ENST00000218364 L1RE1Q9UN81 338 aa25.03■■□□□ 1.6
HTATSF1-201ENST00000218364 ERLIN1O75477 346 aa25.02■■□□□ 1.6
HTATSF1-201ENST00000218364 EIF5P55010 431 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
HTATSF1-201ENST00000218364 RRAGBQ5VZM2 374 aa25.02■■□□□ 1.6
HTATSF1-201ENST00000218364 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
HTATSF1-201ENST00000218364 ADAM21Q9UKJ8 722 aa25.02■■□□□ 1.6
HTATSF1-201ENST00000218364 CHRNDQ07001 517 aa25.02■■□□□ 1.6
HTATSF1-201ENST00000218364 IQCA1Q86XH1 822 aa25.02■■□□□ 1.6
HTATSF1-201ENST00000218364 MTRQ99707 1265 aa25.02■■□□□ 1.6
HTATSF1-201ENST00000218364 DLEC1Q9Y238 1755 aa25.02■■□□□ 1.6
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