RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216014.8

KDELR3-201, Transcript of KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KDELR3, Length 1,728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3-201ENST00000216014 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 MTA3Q9BTC8 594 aa23.45■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 EMILIN3Q9NT22 766 aa23.45■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 HPS5Q9UPZ3 1129 aa23.45■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa23.44■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 MOGSQ13724 837 aa23.44■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 SPICE1Q8N0Z3 855 aa23.44■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 PPATQ06203 517 aa23.43■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 ST3GAL1Q11201 340 aa23.43■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 TROAPQ12815 778 aa23.43■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 SART3Q15020 963 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 APOA5Q6Q788 366 aa23.43■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa23.43■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 ZNF654Q8IZM8 581 aa23.43■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 ZIC5Q96T25 663 aa23.43■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 PARP14Q460N5 1801 aa23.43■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 ERICH2A1L162 156 aa23.42■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 NDUFB10O96000 172 aa23.42■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 HMGCS2P54868 508 aa23.42■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 EVCP57679 992 aa23.42■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 FGD1P98174 961 aa23.42■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 PPIL2Q13356 520 aa23.42■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 SPRYD7Q5W111 196 aa23.42■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa23.42■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 KAT14Q9H8E8 782 aa23.42■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa23.42■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 PCNTO95613 3336 aa23.42■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 UNCXA6NJT0 531 aa23.42■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 F5H6K3 240 aa23.42■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 BACE1P56817 501 aa23.42■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 KLRC3Q07444 240 aa23.42■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 RGMBQ6NW40 437 aa23.42■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 NFXL1Q6ZNB6 911 aa23.42■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 KCNH4Q9UQ05 1017 aa23.42■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 RLFQ13129 1914 aa23.42■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 USP17L10C9JJH3 530 aa23.41■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 ME3Q16798 604 aa23.41■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 SLC35G1Q2M3R5 365 aa23.41■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 FEZ1Q99689 392 aa23.41■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 VCPKMTQ9H867 229 aa23.41■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 CREBZFQ9NS37 354 aa23.41■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 STK3Q13188 491 aa23.4■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 CCDC178Q5BJE1 867 aa23.4■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 CYP4F22Q6NT55 531 aa23.4■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 USP17L2Q6R6M4 530 aa23.4■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 MICU3Q86XE3 530 aa23.4■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 STAG2Q8N3U4 1231 aa23.4■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 NECAB1Q8N987 351 aa23.4■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 MS4A4AQ96JQ5 239 aa23.4■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 CPVLQ9H3G5 476 aa23.4■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 CEP350Q5VT06 3117 aa23.4■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 CCDC69A6NI79 296 aa23.39■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 RAD21O60216 631 aa23.39■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 GOLGA8HP0CJ92 632 aa23.39■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 PDHBP11177 359 aa23.39■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa23.39■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 AS3MTQ9HBK9 375 aa23.39■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 GOLGA8BA8MQT2 603 aa23.39■■□□□ 1.33
KDELR3-201ENST00000216014 SLC10A3P09131 477 aa23.39■■□□□ 1.33
KDELR3-201ENST00000216014 SNHG28P0DPA3 235 aa23.39■■□□□ 1.33
KDELR3-201ENST00000216014 CDC27P30260 824 aa23.39■■□□□ 1.33
KDELR3-201ENST00000216014 TREML2Q5T2D2 321 aa23.39■■□□□ 1.33
KDELR3-201ENST00000216014 SLFN13Q68D06 897 aa23.39■■□□□ 1.33
KDELR3-201ENST00000216014 NUP133Q8WUM0 1156 aa23.39■■□□□ 1.33
KDELR3-201ENST00000216014 SLC12A7Q9Y666 1083 aa23.39■■□□□ 1.33
KDELR3-201ENST00000216014 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
KDELR3-201ENST00000216014 CCT2P78371 535 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
KDELR3-201ENST00000216014 SH3D19Q5HYK7 790 aa23.38■■□□□ 1.33
KDELR3-201ENST00000216014 TTBK2Q6IQ55 1244 aa23.38■■□□□ 1.33
KDELR3-201ENST00000216014 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
KDELR3-201ENST00000216014 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
KDELR3-201ENST00000216014 VCAM1P19320 739 aa23.37■■□□□ 1.33
KDELR3-201ENST00000216014 FAM83BQ5T0W9 1011 aa23.37■■□□□ 1.33
KDELR3-201ENST00000216014 KCTD1Q719H9 257 aa23.37■■□□□ 1.33
KDELR3-201ENST00000216014 NBPF11Q86T75 865 aa23.37■■□□□ 1.33
KDELR3-201ENST00000216014 MAD2L2Q9UI95 211 aa23.37■■□□□ 1.33
KDELR3-201ENST00000216014 RASSF10A6NK89 507 aa23.36■■□□□ 1.33
KDELR3-201ENST00000216014 ZBTB43O43298 467 aa23.36■■□□□ 1.33
KDELR3-201ENST00000216014 ST18O60284 1047 aa23.36■■□□□ 1.33
KDELR3-201ENST00000216014 PPFIA3O75145 1194 aa23.36■■□□□ 1.33
KDELR3-201ENST00000216014 GRM1Q13255 1194 aa23.36■■□□□ 1.33
KDELR3-201ENST00000216014 CATIPQ7Z7H3 387 aa23.36■■□□□ 1.33
KDELR3-201ENST00000216014 TMTC2Q8N394 836 aa23.36■■□□□ 1.33
KDELR3-201ENST00000216014 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
KDELR3-201ENST00000216014 CXCL11O14625 94 aa23.36■■□□□ 1.33
KDELR3-201ENST00000216014 PLEKHA8P1O95397 391 aa23.36■■□□□ 1.33
KDELR3-201ENST00000216014 SCRN1Q12765 414 aa23.36■■□□□ 1.33
KDELR3-201ENST00000216014 GRM4Q14833 912 aa23.36■■□□□ 1.33
KDELR3-201ENST00000216014 GPAT2Q6NUI2 795 aa23.36■■□□□ 1.33
KDELR3-201ENST00000216014 BRI3BPQ8WY22 251 aa23.36■■□□□ 1.33
KDELR3-201ENST00000216014 C12orf42Q96LP6 360 aa23.36■■□□□ 1.33
KDELR3-201ENST00000216014 PTPN18Q99952 460 aa23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms