RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215941.8

ANKRD54-201, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD54, Length 2,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-201ENST00000215941 FERMT2Q96AC1 680 aa25.86■■□□□ 1.73
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ANKRD54-201ENST00000215941 LRRC10BA6NIK2 292 aa25.86■■□□□ 1.73
ANKRD54-201ENST00000215941 CAMTA2O94983 1202 aa25.86■■□□□ 1.73
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ANKRD54-201ENST00000215941 PARP10Q53GL7 1025 aa25.83■■□□□ 1.73
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ANKRD54-201ENST00000215941 CASP8Q14790 479 aa25.82■■□□□ 1.72
ANKRD54-201ENST00000215941 CTR9Q6PD62 1173 aa25.82■■□□□ 1.72
ANKRD54-201ENST00000215941 TRIM34Q9BYJ4 488 aa25.82■■□□□ 1.72
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ANKRD54-201ENST00000215941 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
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ANKRD54-201ENST00000215941 TRERF1Q96PN7 1200 aa25.82■■□□□ 1.72
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ANKRD54-201ENST00000215941 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
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ANKRD54-201ENST00000215941 MAP3K12Q12852 859 aa25.8■■□□□ 1.72
ANKRD54-201ENST00000215941 NR5A1Q13285 461 aa25.8■■□□□ 1.72
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ANKRD54-201ENST00000215941 MYH8P13535 1937 aa25.8■■□□□ 1.72
ANKRD54-201ENST00000215941 AMPD2Q01433 879 aa25.8■■□□□ 1.72
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ANKRD54-201ENST00000215941 BCORQ6W2J9 1755 aa25.8■■□□□ 1.72
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ANKRD54-201ENST00000215941 USP49Q70CQ1 688 aa25.79■■□□□ 1.72
ANKRD54-201ENST00000215941 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa25.79■■□□□ 1.72
ANKRD54-201ENST00000215941 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa25.79■■□□□ 1.72
ANKRD54-201ENST00000215941 MYO6Q9UM54 1294 aa25.79■■□□□ 1.72
ANKRD54-201ENST00000215941 MROH5Q6ZUA9 1318 aa25.79■■□□□ 1.72
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ANKRD54-201ENST00000215941 MAP9Q49MG5 647 aa25.79■■□□□ 1.72
ANKRD54-201ENST00000215941 RWDD2AQ9UIY3 292 aa25.79■■□□□ 1.72
ANKRD54-201ENST00000215941 RTL9Q8NET4 1388 aa25.79■■□□□ 1.72
ANKRD54-201ENST00000215941 CTDSPL2Q05D32 466 aa25.78■■□□□ 1.72
ANKRD54-201ENST00000215941 CCDC148Q8NFR7 591 aa25.78■■□□□ 1.72
ANKRD54-201ENST00000215941 LPIN2Q92539 896 aa25.78■■□□□ 1.72
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ANKRD54-201ENST00000215941 KLHL10Q6JEL2 608 aa25.78■■□□□ 1.72
ANKRD54-201ENST00000215941 GSG1L2A8MUP6 293 aa25.77■■□□□ 1.72
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ANKRD54-201ENST00000215941 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF662Q6ZS27 426 aa25.77■■□□□ 1.72
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF654Q8IZM8 581 aa25.77■■□□□ 1.72
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF652Q9Y2D9 606 aa25.77■■□□□ 1.72
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF831Q5JPB2 1677 aa25.76■■□□□ 1.72
ANKRD54-201ENST00000215941 MBD4O95243 580 aa25.76■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 KRT2P35908 639 aa25.76■■□□□ 1.71
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ANKRD54-201ENST00000215941 ERVK-24P63145 666 aa25.76■■□□□ 1.71
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