RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026390.7

Rabgef1-201, Transcript of Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabgef1, Length 2,828 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ces3aQ63880 571 aa11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tm4sf1Q64302 202 aa11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 DaglaQ6WQJ1 1044 aa11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Enox1Q8BHR2 643 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ces3bQ8VCU1 571 aa11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Psmd10Q9Z2X2 231 aa11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm45140A0A0N4SUM8 220 aa11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cyp26c1B2RXA7 518 aa11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tex13cD3YU32 604 aa11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Adam7O35227 789 aa11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Api5O35841 504 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Grem2O88273 168 aa11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Il7P10168 154 aa11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ap5z1Q3U829 807 aa11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fhdc1Q3ULZ2 1149 aa11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc9a1Q61165 820 aa11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hdac4Q6NZM9 1076 aa11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ccp110Q7TSH4 1004 aa11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 WdpcpQ8C456 722 aa11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Klrc1Q9Z202 244 aa11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 VirmaA2AIV2 1811 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 StrcQ8VIM6 1809 aa11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 A0A0U1RNP2 1173 aa11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sdc2P43407 202 aa11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 VrtnQ3SYK4 740 aa11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 TfrcQ62351 763 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ankk1Q8BZ25 745 aa11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mboat7Q8CHK3 473 aa11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zbed3Q9D0L1 228 aa11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cbx6Q9DBY5 414 aa11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nrxn2E9Q7X7 1710 aa11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dnajc25A2ALW5 357 aa11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kcna1P16388 495 aa11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fam198bQ3UPI1 517 aa11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nxf2Q4ZGD8 691 aa11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Krt39Q6IFX4 482 aa11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Panx2Q6IMP4 677 aa11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ankrd13aQ80UP5 588 aa11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cep128Q8BI22 1102 aa11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Txnrd3Q99MD6 652 aa11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Baiap2l1Q9DBJ3 514 aa11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cul4bA2A432 970 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tbc1d2B1AVH7 922 aa11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Znf568E9PYI1 671 aa11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm5134E9QAB5 671 aa11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Surf1P09925 306 aa11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 GnaqP21279 359 aa11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Eya3P97480 510 aa11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dok7Q18PE0 504 aa11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Armc2Q3URY6 854 aa11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Adck2Q6NSR3 617 aa11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 CtifQ6PEE2 600 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kctd3Q8BFX3 815 aa11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mtmr6Q8VE11 617 aa11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Clstn1Q9EPL2 979 aa11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sgpp1Q9JI99 430 aa11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Btn2a2A4QPC6 514 aa11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mboat4P0C7A3 435 aa11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gja5Q01231 358 aa11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mdh1bQ5F204 500 aa11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nsrp1Q5NCR9 542 aa11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tbx2Q60707 711 aa11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nell2Q61220 819 aa11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Glg1Q61543 1175 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dnm3Q8BZ98 863 aa11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ugt1a6bK9J7B2 531 aa11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Alppl2P24823 529 aa11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Adssl1P28650 457 aa11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nap1l2P51860 460 aa11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 EgfrQ01279 1210 aa11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kiaa0319Q5SZV5 1081 aa11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ugt1a6Q64435 531 aa11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ugt1a7cQ6ZQM8 531 aa11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mxd3Q80US8 206 aa11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Anks1bQ8BIZ1 1259 aa11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 LRWD1Q8BUI3 648 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pspc1Q8R326 523 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rbm19Q8R3C6 952 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zscan18E9PUD6 809 aa11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nfil3O08750 462 aa11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 NppbP40753 121 aa11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tnnt2P50752 301 aa11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fam178bQ24JP3 464 aa11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tacc1Q6Y685 774 aa11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dlg1Q811D0 905 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nat10Q8K224 1024 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mmtag2Q99LX5 260 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gtf2iQ9ESZ8 998 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fam186bD3Z420 943 aa11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Serpina16D3Z660 418 aa11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Usp17lbE9Q9U0 468 aa11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gpatch11Q3UFS4 262 aa11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Abcf1Q6P542 837 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zdhhc14Q8BQQ1 489 aa11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Caps2Q8BUG5 550 aa11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 ParnQ8VDG3 624 aa11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lzts2Q91YU6 671 aa11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 LpxnQ99N69 386 aa11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mtfr1lQ9CWE0 289 aa11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tmem132bF7BAB2 1078 aa11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 32.9 ms