RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639525.1

SPIN3-223, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5 BASIC

Gene SPIN3, Length 3,958 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-223	ENST00000639525	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
SPIN3-223	ENST00000639525	WDR24	Q96S15	920 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM107B	Q9H098	131 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SPIN3-223	ENST00000639525	DIP2A	Q14689	1571 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SPIN3-223	ENST00000639525	PPP6R2	O75170	966 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SPIN3-223	ENST00000639525	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SPIN3-223	ENST00000639525	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
SPIN3-223	ENST00000639525	CTR9	Q6PD62	1173 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SPIN3-223	ENST00000639525	CNGA4	Q8IV77	575 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SPIN3-223	ENST00000639525	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
SPIN3-223	ENST00000639525	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SPIN3-223	ENST00000639525	IKBKB	O14920	756 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SPIN3-223	ENST00000639525	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
SPIN3-223	ENST00000639525	TFAP4	Q01664	338 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SPIN3-223	ENST00000639525	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
SPIN3-223	ENST00000639525	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SPIN3-223	ENST00000639525	ZBTB22	O15209	634 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SPIN3-223	ENST00000639525	PAK1	Q13153	545 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SPIN3-223	ENST00000639525	SUSD4	Q5VX71	490 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SPIN3-223	ENST00000639525	DYM	Q7RTS9	669 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SPIN3-223	ENST00000639525	LY9	Q9HBG7	655 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SPIN3-223	ENST00000639525	IFNAR1	P17181	557 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SPIN3-223	ENST00000639525	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	13.28	□□□□□ -0.28
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC35F6	Q8N357	371 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SPIN3-223	ENST00000639525	ANKRD7	Q92527	254 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SPIN3-223	ENST00000639525	CPVL	Q9H3G5	476 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SPIN3-223	ENST00000639525	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.28
SPIN3-223	ENST00000639525	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.28
SPIN3-223	ENST00000639525	CEP112	Q8N8E3	955 aa		13.27	□□□□□ -0.28
SPIN3-223	ENST00000639525	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.28
SPIN3-223	ENST00000639525	CCDC42	Q96M95	316 aa		13.27	□□□□□ -0.28
SPIN3-223	ENST00000639525	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.28
SPIN3-223	ENST00000639525	GBP3	Q9H0R5	595 aa		13.27	□□□□□ -0.28
SPIN3-223	ENST00000639525	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		13.27	□□□□□ -0.28
SPIN3-223	ENST00000639525	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.28
SPIN3-223	ENST00000639525	ITSN1	Q15811	1721 aa		13.27	□□□□□ -0.28
SPIN3-223	ENST00000639525	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	INF2	Q27J81	1249 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	SETDB2	Q96T68	719 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	RTL9	Q8NET4	1388 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	TXK	P42681	527 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	SPAG1	Q07617	926 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	PTPRO	Q16827	1216 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM182B	Q5T319	152 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	DIP2B	Q9P265	1576 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	PDE4D	Q08499	809 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	TNNI2	P48788	182 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	TERF2	Q15554	542 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	RESP18	Q5W5W9	173 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	CALML4	Q96GE6	196 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	ATG3	Q9NT62	314 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	STX10	O60499	249 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	BMP15	O95972	392 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	RMND1	Q9NWS8	449 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	PLCD1	P51178	756 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	NBPF11	Q86T75	865 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	RGS22	Q8NE09	1264 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	TUBB4A	P04350	444 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	SPATA1	Q5VX52	437 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	GDA	Q9Y2T3	454 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	PAFAH1B1	P43034	410 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	KIF5A	Q12840	1032 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	NCAPD2	Q15021	1401 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	KCNJ18	B7U540	433 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	SMIM22	K7EJ46	135 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	CYP2D6	P10635	497 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	MORC3	Q14149	939 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	KCNJ12	Q14500	433 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	PTPRE	P23469	700 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-223	ENST00000639525	ODF2	Q5BJF6	829 aa		13.24	□□□□□ -0.29

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