RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637578.1

CLN3-260, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 2

Gene CLN3, Length 1,577 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-260ENST00000637578 USP14P54578 494 aa23.1■■□□□ 1.29
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CLN3-260ENST00000637578 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
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CLN3-260ENST00000637578 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
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CLN3-260ENST00000637578 LPAR1Q92633 364 aa22.99■■□□□ 1.27
CLN3-260ENST00000637578 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.99■■□□□ 1.27
CLN3-260ENST00000637578 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa22.99■■□□□ 1.27
CLN3-260ENST00000637578 EN2P19622 333 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
CLN3-260ENST00000637578 MTFR1Q15390 333 aa22.98■■□□□ 1.27
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