RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636071.2

SCN2A-209, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene SCN2A, Length 8,881 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2A-209ENST00000636071 CDR2Q01850 454 aa7.01□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 SFMBT2Q5VUG0 894 aa7.01□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa7.01□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 CDCA7LQ96GN5 454 aa7.01□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 STK17AQ9UEE5 414 aa7.01□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 ITSN2Q9NZM3 1697 aa7.01□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 UBE4BO95155 1302 aa7.01□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 TOP2BQ02880 1626 aa7.01□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 ATP2B3Q16720 1220 aa7.01□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 CCDC25Q86WR0 208 aa7.01□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 SAR1BQ9Y6B6 198 aa7.01□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 HMGXB3Q12766 1538 aa7.01□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 CTAGE3PQ8IX95 158 aa7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 RPS6KC1Q96S38 1066 aa7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 TLDC2A0PJX2 215 aa7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 GOLGA8IPA6NC78 632 aa7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 BIN1O00499 593 aa7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 SMIM24O75264 130 aa7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 HDAC4P56524 1084 aa7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 CDC37L1Q7L3B6 337 aa7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 ARHGAP10A1A4S6 786 aa7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 LPXNO60711 386 aa7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 PEX26Q7Z412 305 aa7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 OLFML3Q9NRN5 406 aa7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 CDC25BP30305 580 aa7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 SERPINB10P48595 397 aa7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 ATP8B2P98198 1209 aa7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 KRT71Q3SY84 523 aa7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 KMT5BQ4FZB7 885 aa7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 NBPF14Q5TI25 921 aa7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 BRF1Q92994 677 aa7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 DENND2AQ9ULE3 1009 aa7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 EXOC5O00471 708 aa7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 RINT1Q6NUQ1 792 aa7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 ANKRD35Q8N283 1001 aa7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 TM6SF1Q9BZW5 370 aa7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 NR1I2O75469 434 aa7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 C4BPBP20851 252 aa7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 RAPGEF1Q13905 1077 aa7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 LRRC8BQ6P9F7 803 aa7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 RABEP2Q9H5N1 569 aa7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 PIK3C2GO75747 1445 aa7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 XPOTO43592 962 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 DCUN1D2Q6PH85 259 aa7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 LINS1Q8NG48 757 aa7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 MPP6Q9NZW5 540 aa7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 SBNO1A3KN83 1393 aa7□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 TRIM27P14373 513 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 PDE1AP54750 535 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 GRIN1Q05586 938 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 MYD88Q99836 296 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 SYF2O95926 243 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 MED21Q13503 144 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 PRPSAP1Q14558 356 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 ALS2CLQ60I27 953 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 RPAINQ86UA6 219 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 TMEM247A6NEH6 219 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 KRT4P19013 534 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 CCDC197Q8NCU1 140 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 KRT12Q99456 494 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 PRDM10Q9NQV6 1147 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 STX8Q9UNK0 236 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 TRAF5O00463 557 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 KRT16P08779 473 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 RANBP1P43487 201 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 NLRP12P59046 1061 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 OCA2Q04671 838 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 PARP10Q53GL7 1025 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-209ENST00000636071 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms