RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628455.2

PCBP1-AS1-329, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 361 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 SHMT1P34896 483 aa13.06□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 ADD2P35612 726 aa13.06□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 WDR78Q5VTH9 848 aa13.06□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 C12orf42Q96LP6 360 aa13.06□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP13.06□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 TXNRD2Q9NNW7 524 aa13.06□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa13.06□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa13.05□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 MBD4O95243 580 aa13.05□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 RGS2P41220 211 aa13.05□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 SEPT2Q15019 361 aa13.05□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 UBE3CQ15386 1083 aa13.05□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 C20orf194Q5TEA3 1177 aa13.05□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa13.05□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 TMEM179Q6ZVK1 233 aa13.05□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 PLEKHH3Q7Z736 793 aa13.05□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 ACER1Q8TDN7 264 aa13.05□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 PCDH10Q9P2E7 1040 aa13.05□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 RPTORQ8N122 1335 aa13.05□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 EVI5O60447 810 aa13.04□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 VCAM1P19320 739 aa13.04□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 GABPAQ06546 454 aa13.04□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 Q3C1V9 767 aa13.04□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 GPR142Q7Z601 462 aa13.04□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 NECAB2Q7Z6G3 386 aa13.04□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 CCDC17Q96LX7 622 aa13.04□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 SH2D4AQ9H788 454 aa13.04□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa13.04□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 ECHDC1Q9NTX5 307 aa13.04□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 HOXC10Q9NYD6 342 aa13.04□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa13.04□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa13.04□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 HTTP42858 3142 aa13.03□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 PRKAB2O43741 272 aa13.03□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 PEX10O60683 326 aa13.03□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 CYP2D6P10635 497 aa13.03□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 COG2Q14746 738 aa13.03□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 ANKLE1Q8NAG6 615 aa13.03□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 TRIB2Q92519 343 aa13.03□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 TANGO6Q9C0B7 1094 aa13.03□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa13.03□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 USP17L12C9JPN9 530 aa13.02□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 USP17L21D6R901 530 aa13.02□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 GUCY1A2P33402 732 aa13.02□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 MAP2K5Q13163 448 aa13.02□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa13.02□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 SLC44A5Q8NCS7 719 aa13.02□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 DYNLL2Q96FJ2 89 aa13.02□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 APBA2Q99767 749 aa13.02□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa13.02□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 PORCNQ9H237 461 aa13.02□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 PHIPQ8WWQ0 1821 aa13.02□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 ATP2B2Q01814 1243 aa13.01□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 ICA1Q05084 483 aa13.01□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 TRIM32Q13049 653 aa13.01□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 SLFNL1Q499Z3 407 aa13.01□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 C12orf60Q5U649 245 aa13.01□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 MFSD14CQ5VZR4 134 aa13.01□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 CHRDL2Q6WN34 429 aa13.01□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 LBX2Q6XYB7 198 aa13.01□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 LPAR1Q92633 364 aa13.01□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 NBPF3Q9H094 633 aa13.01□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 DCTPP1Q9H773 170 aa13.01□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 LOC285556D6RIA3 1793 aa13□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 SLC15A5A6NIM6 579 aa13□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 RAD21O60216 631 aa13□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 PTPREP23469 700 aa13□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 CDK8P49336 464 aa13□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 MORN1Q5T089 497 aa13□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 DPP9Q86TI2 863 aa13□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 TMX2Q9Y320 296 aa13□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 A0A1W2PRG0 241 aa12.99□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 ERC2O15083 957 aa12.99□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 FLOT1O75955 427 aa12.99□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 AKR1B1P15121 316 aa12.99□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 EVX2Q03828 476 aa12.99□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 PLS1Q14651 629 aa12.99□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 C16orf86Q6ZW13 317 aa12.99□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 MB21D1Q8N884 522 aa12.99□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 KBTBD3Q8NAB2 608 aa12.99□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms