RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626583.2

LINC01828-208, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1828, human

TSL 5

Gene LINC01828, Length 848 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC01828-208	ENST00000626583	IL9	P15248	144 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	SLC39A6	Q13433	755 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	MTMR2	Q13614	643 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	ITPR3	Q14573	2671 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	RELN	P78509	3460 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	KRBA1	A5PL33	1030 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	ADRB1	P08588	477 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	NDUFV2	P19404	249 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	FLT3LG	P49771	235 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	CCL15	Q16663	113 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	HERVK_113	Q902F9	699 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	OPTN	Q96CV9	577 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	ADAMTS20	P59510	1910 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	BTBD19	C9JJ37	291 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	FURIN	P09958	794 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	CAPN2	P17655	700 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	FSHR	P23945	695 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	HOXD10	P28358	340 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	NF2	P35240	595 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	NBL1	P41271	181 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	ELP3	Q9H9T3	547 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	COG5	Q9UP83	839 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	GAK	O14976	1311 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583		A0A087WZG4	1122 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	RNF217	Q8TC41	542 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	EPOP	A6NHQ4	379 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	OIP5	O43482	229 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	ECE2	O60344	883 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	ITGB7	P26010	798 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	CTH	P32929	405 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	RTP1	P59025	263 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	TMC4	Q7Z404	712 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	ACD	Q96AP0	544 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	GML	Q99445	158 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	PRRX2	Q99811	253 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	PTPRF	P10586	1907 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583		A0A1B0GUL6	1792 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	FLT4	P35916	1363 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	WNT10B	O00744	389 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	SASH1	O94885	1247 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LINC01828-208	ENST00000626583	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		4.74	□□□□□ -1.65

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