RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-215ENST00000621029 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP34.81■■■■□ 3.16
SEMA3B-215ENST00000621029 ADCY3O60266 1144 aa34.8■■■■□ 3.16
SEMA3B-215ENST00000621029 GUCY1A2P33402 732 aa34.8■■■■□ 3.16
SEMA3B-215ENST00000621029 TMEM179Q6ZVK1 233 aa34.8■■■■□ 3.16
SEMA3B-215ENST00000621029 SLAIN1Q8ND83 568 aa34.8■■■■□ 3.16
SEMA3B-215ENST00000621029 PI4K2BQ8TCG2 481 aa34.8■■■■□ 3.16
SEMA3B-215ENST00000621029 OSBP2Q969R2 916 aa34.8■■■■□ 3.16
SEMA3B-215ENST00000621029 FSD1Q9BTV5 496 aa34.8■■■■□ 3.16
SEMA3B-215ENST00000621029 MYH7P12883 1935 aa34.79■■■■□ 3.16
SEMA3B-215ENST00000621029 USP17L15C9J2P7 530 aa34.79■■■■□ 3.16
SEMA3B-215ENST00000621029 USP17L13C9JLJ4 530 aa34.79■■■■□ 3.16
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SEMA3B-215ENST00000621029 USP17L18D6R9N7 530 aa34.79■■■■□ 3.16
SEMA3B-215ENST00000621029 USP17L22D6RA61 530 aa34.79■■■■□ 3.16
SEMA3B-215ENST00000621029 USP17L17D6RBQ6 530 aa34.79■■■■□ 3.16
SEMA3B-215ENST00000621029 USP17L19D6RCP7 530 aa34.79■■■■□ 3.16
SEMA3B-215ENST00000621029 USP17L20D6RJB6 530 aa34.79■■■■□ 3.16
SEMA3B-215ENST00000621029 UBXN2AP68543 259 aa34.79■■■■□ 3.16
SEMA3B-215ENST00000621029 USP17L24Q0WX57 530 aa34.79■■■■□ 3.16
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SEMA3B-215ENST00000621029 C12orf42Q96LP6 360 aa34.79■■■■□ 3.16
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SEMA3B-215ENST00000621029 MORF4L1Q9UBU8 362 aa34.79■■■■□ 3.16
SEMA3B-215ENST00000621029 CDK8P49336 464 aa34.78■■■■□ 3.16
SEMA3B-215ENST00000621029 AAMPQ13685 434 aa34.78■■■■□ 3.16
SEMA3B-215ENST00000621029 MTFR1Q15390 333 aa34.78■■■■□ 3.16
SEMA3B-215ENST00000621029 CTR9Q6PD62 1173 aa34.78■■■■□ 3.16
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SEMA3B-215ENST00000621029 SMIM22K7EJ46 135 aa34.77■■■■□ 3.16
SEMA3B-215ENST00000621029 PEX10O60683 326 aa34.77■■■■□ 3.16
SEMA3B-215ENST00000621029 VCAM1P19320 739 aa34.77■■■■□ 3.16
SEMA3B-215ENST00000621029 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP34.77■■■■□ 3.16
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SEMA3B-215ENST00000621029 GPAA1O43292 621 aa34.76■■■■□ 3.16
SEMA3B-215ENST00000621029 APPP05067 770 aa34.76■■■■□ 3.16
SEMA3B-215ENST00000621029 AKR1B1P15121 316 aa34.76■■■■□ 3.16
SEMA3B-215ENST00000621029 ELNP15502 786 aa34.76■■■■□ 3.16
SEMA3B-215ENST00000621029 CCDC17Q96LX7 622 aa34.76■■■■□ 3.16
SEMA3B-215ENST00000621029 C16orf86Q6ZW13 317 aa34.75■■■■□ 3.15
SEMA3B-215ENST00000621029 TXNRD2Q9NNW7 524 aa34.75■■■■□ 3.15
SEMA3B-215ENST00000621029 RBPJLQ9UBG7 517 aa34.75■■■■□ 3.15
SEMA3B-215ENST00000621029 GSG1L2A8MUP6 293 aa34.74■■■■□ 3.15
SEMA3B-215ENST00000621029 MINDY4BA8MYZ0 360 aa34.74■■■■□ 3.15
SEMA3B-215ENST00000621029 M0R2C6 588 aa34.74■■■■□ 3.15
SEMA3B-215ENST00000621029 CCL5P13501 91 aa34.74■■■■□ 3.15
SEMA3B-215ENST00000621029 GNAT2P19087 354 aa34.74■■■■□ 3.15
SEMA3B-215ENST00000621029 IRF5Q13568 498 aa34.74■■■■□ 3.15
SEMA3B-215ENST00000621029 STK11IPQ8N1F8 1099 aa34.74■■■■□ 3.15
SEMA3B-215ENST00000621029 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP34.74■■■■□ 3.15
SEMA3B-215ENST00000621029 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP34.74■■■■□ 3.15
SEMA3B-215ENST00000621029 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa34.74■■■■□ 3.15
SEMA3B-215ENST00000621029 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP34.74■■■■□ 3.15
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SEMA3B-215ENST00000621029 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa34.73■■■■□ 3.15
SEMA3B-215ENST00000621029 RNF208Q9H0X6 261 aa34.73■■■■□ 3.15
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SEMA3B-215ENST00000621029 GIMAP6Q6P9H5 292 aa34.72■■■■□ 3.15
SEMA3B-215ENST00000621029 CLEC10AQ8IUN9 316 aa34.72■■■■□ 3.15
SEMA3B-215ENST00000621029 EXOC6Q8TAG9 804 aa34.72■■■■□ 3.15
SEMA3B-215ENST00000621029 PXYLP1Q8TE99 480 aa34.72■■■■□ 3.15
SEMA3B-215ENST00000621029 ERVK-9P63128 1117 aa34.71■■■■□ 3.15
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SEMA3B-215ENST00000621029 ATP2B2Q01814 1243 aa34.71■■■■□ 3.15
SEMA3B-215ENST00000621029 SH2D4AQ9H788 454 aa34.71■■■■□ 3.15
SEMA3B-215ENST00000621029 INHAP05111 366 aa34.7■■■■□ 3.15
SEMA3B-215ENST00000621029 TANGO6Q9C0B7 1094 aa34.7■■■■□ 3.15
SEMA3B-215ENST00000621029 MKNK2Q9HBH9 465 aa34.7■■■■□ 3.15
SEMA3B-215ENST00000621029 MAPK4P31152 587 aa34.69■■■■□ 3.14
SEMA3B-215ENST00000621029 Q3C1V9 767 aa34.69■■■■□ 3.14
SEMA3B-215ENST00000621029 SBK1Q52WX2 424 aa34.69■■■■□ 3.14
SEMA3B-215ENST00000621029 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa34.69■■■■□ 3.14
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SEMA3B-215ENST00000621029 LNPKQ9C0E8 428 aa34.68■■■■□ 3.14
SEMA3B-215ENST00000621029 UNC93B1Q9H1C4 597 aa34.68■■■■□ 3.14
SEMA3B-215ENST00000621029 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP34.68■■■■□ 3.14
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SEMA3B-215ENST00000621029 GJD2Q9UKL4 321 aa34.67■■■■□ 3.14
SEMA3B-215ENST00000621029 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa34.67■■■■□ 3.14
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SEMA3B-215ENST00000621029 NUDT12Q9BQG2 462 aa34.66■■■■□ 3.14
SEMA3B-215ENST00000621029 PORCNQ9H237 461 aa34.66■■■■□ 3.14
SEMA3B-215ENST00000621029 KANSL2Q9H9L4 492 aa34.66■■■■□ 3.14
SEMA3B-215ENST00000621029 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP34.66■■■■□ 3.14
SEMA3B-215ENST00000621029 STAP2Q9UGK3 403 aa34.66■■■■□ 3.14
SEMA3B-215ENST00000621029 TMX2Q9Y320 296 aa34.66■■■■□ 3.14
SEMA3B-215ENST00000621029 GJB1P08034 283 aa34.65■■■■□ 3.14
SEMA3B-215ENST00000621029 CYP2B6P20813 491 aa34.65■■■■□ 3.14
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