RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616395.4

TRAPPC3-209, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,336 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-209ENST00000616395 ARRDC4Q8NCT1 418 aa21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 XAGE2Q96GT9 111 aa21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 HMG20BQ9P0W2 317 aa21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 SIPA1L1O43166 1804 aa21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 A0A1B0GUL7 405 aa21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 HOXC6P09630 235 aa21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 CCNA1P78396 465 aa21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 GRIN2CQ14957 1233 aa21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 RAI14Q9P0K7 980 aa21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 RLFQ13129 1914 aa21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 KBTBD13C9JR72 458 aa21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
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TRAPPC3-209ENST00000616395 MVPQ14764 893 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 SNX17Q15036 470 aa21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 ANO1Q5XXA6 986 aa21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 USP17L2Q6R6M4 530 aa21.55■■□□□ 1.04
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TRAPPC3-209ENST00000616395 TNNQ9UQP3 1299 aa21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 BCAR3O75815 825 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 IGHA2P01877 340 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 PLA2G5P39877 138 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 EPHB4P54760 987 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 GRB14Q14449 540 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
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TRAPPC3-209ENST00000616395 GINM1Q9NU53 330 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa21.54■■□□□ 1.04
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TRAPPC3-209ENST00000616395 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 SPATA5Q8NB90 893 aa21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 TRIM34Q9BYJ4 488 aa21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 USP17L15C9J2P7 530 aa21.52■■□□□ 1.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 USP17L13C9JLJ4 530 aa21.52■■□□□ 1.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 USP17L11C9JVI0 530 aa21.52■■□□□ 1.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 USP17L18D6R9N7 530 aa21.52■■□□□ 1.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 USP17L22D6RA61 530 aa21.52■■□□□ 1.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 USP17L17D6RBQ6 530 aa21.52■■□□□ 1.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 USP17L19D6RCP7 530 aa21.52■■□□□ 1.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 USP17L20D6RJB6 530 aa21.52■■□□□ 1.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 ITGB8P26012 769 aa21.52■■□□□ 1.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 ADCYAP1R1P41586 468 aa21.52■■□□□ 1.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 USP17L24Q0WX57 530 aa21.52■■□□□ 1.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa21.52■■□□□ 1.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 FERMT2Q96AC1 680 aa21.52■■□□□ 1.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 BTBD7Q9P203 1132 aa21.52■■□□□ 1.03
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TRAPPC3-209ENST00000616395 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 FAM122AQ96E09 287 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 C12orf42Q96LP6 360 aa21.51■■□□□ 1.03
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TRAPPC3-209ENST00000616395 PALD1Q9ULE6 856 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 AKAP2Q9Y2D5 859 aa21.51■■□□□ 1.03
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TRAPPC3-209ENST00000616395 TLE2Q04725 743 aa21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 NEUROD6Q96NK8 337 aa21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 FEZ1Q99689 392 aa21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 FLT1P17948 1338 aa21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 GH2P01242 217 aa21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 C1orf53Q5VUE5 145 aa21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 LRP2BPQ9P2M1 347 aa21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 SEPT4O43236 478 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 AAMPQ13685 434 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 DPP9Q86TI2 863 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 PPM1EQ8WY54 764 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF576Q9H609 170 aa21.48■■□□□ 1.03
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TRAPPC3-209ENST00000616395 BAG3O95817 575 aa21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 LRRC41Q15345 812 aa21.47■■□□□ 1.03
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TRAPPC3-209ENST00000616395 LBX2Q6XYB7 198 aa21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 ASB2Q96Q27 587 aa21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 CLTBP09497 229 aa21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 TRIM27P14373 513 aa21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 PLCG2P16885 1265 aa21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 VCAM1P19320 739 aa21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 ADORA2AP29274 412 aa21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 MCAMP43121 646 aa21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 RAG1P15918 1043 aa21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 PPP4CP60510 307 aa21.45■■□□□ 1.02
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