RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610404.4

TTR-204, Transcript of transthyretin, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TTR, Length 1,040 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTR-204ENST00000610404 IL16Q14005 1332 aa11.09□□□□□ -0.63
TTR-204ENST00000610404 GRM8O00222 908 aa11.08□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 TNNI2P48788 182 aa11.08□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 UBE4AQ14139 1066 aa11.08□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 MTFR1Q15390 333 aa11.08□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 WRNIP1Q96S55 665 aa11.08□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 CACNA1FO60840 1977 aa11.07□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 SZT2Q5T011 3432 aa11.07□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 CETPP11597 493 aa11.07□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 MYSM1Q5VVJ2 828 aa11.07□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 ERO1BQ86YB8 467 aa11.07□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa11.07□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 TSC1Q92574 1164 aa11.07□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 LIMD1Q9UGP4 676 aa11.07□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 LILRB3O75022 631 aa11.06□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 PDE4DQ08499 809 aa11.06□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 PPIL2Q13356 520 aa11.06□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 SNAPC2Q13487 334 aa11.06□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 KIF22Q14807 665 aa11.06□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 C4orf48Q5BLP8 95 aa11.06□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 C17orf99Q6UX52 265 aa11.06□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 FBXO33Q7Z6M2 555 aa11.06□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 KAZALD1Q96I82 304 aa11.06□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 SUCLG2Q96I99 432 aa11.06□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 CPA4Q9UI42 421 aa11.06□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 GNRH1P01148 92 aa11.05□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 INPP5BP32019 993 aa11.05□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 GRM5P41594 1212 aa11.05□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa11.05□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 TEKT1Q969V4 418 aa11.05□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 ITPKCQ96DU7 683 aa11.05□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 ZFAND3Q9H8U3 227 aa11.05□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 SRRDQ9UH36 339 aa11.05□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa11.05□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 ADGRA2Q96PE1 1338 aa11.05□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 NR3C2P08235 984 aa11.04□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 PSMC4P43686 418 aa11.04□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 PRMT2P55345 433 aa11.04□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 QPCTQ16769 361 aa11.04□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 LRRC24Q50LG9 513 aa11.04□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 FAM83AQ86UY5 434 aa11.04□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 DPF3Q92784 378 aa11.04□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 ZDHHC15Q96MV8 337 aa11.04□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 ALDH1L1O75891 902 aa11.03□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 LORP23490 312 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 GRK4P32298 578 aa11.03□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 PPATQ06203 517 aa11.03□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 MOGSQ13724 837 aa11.03□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 FKBP1CQ5VVH2 108 aa11.03□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 SLC4A10Q6U841 1118 aa11.03□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 MIGA2Q7L4E1 593 aa11.03□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 ANKRD23Q86SG2 305 aa11.03□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 VPS37DQ86XT2 251 aa11.03□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 VGLL2Q8N8G2 317 aa11.03□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa11.03□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 PRO3102Q9H379 93 aa11.03□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 TMOD2Q9NZR1 351 aa11.03□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 MROH5Q6ZUA9 1318 aa11.03□□□□□ -0.64
TTR-204ENST00000610404 PDHXO00330 501 aa11.02□□□□□ -0.65
TTR-204ENST00000610404 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
TTR-204ENST00000610404 UPP2O95045 317 aa11.02□□□□□ -0.65
TTR-204ENST00000610404 GJB1P08034 283 aa11.02□□□□□ -0.65
TTR-204ENST00000610404 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
TTR-204ENST00000610404 CCL5P13501 91 aa11.02□□□□□ -0.65
TTR-204ENST00000610404 GJA8P48165 433 aa11.02□□□□□ -0.65
TTR-204ENST00000610404 DCAF15Q66K64 600 aa11.02□□□□□ -0.65
TTR-204ENST00000610404 RAET1EQ8TD07 263 aa11.02□□□□□ -0.65
TTR-204ENST00000610404 MRIQ9BWK5 157 aa11.02□□□□□ -0.65
TTR-204ENST00000610404 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa11.02□□□□□ -0.65
TTR-204ENST00000610404 ZNF341Q9BYN7 854 aa11.02□□□□□ -0.65
TTR-204ENST00000610404 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa11.02□□□□□ -0.65
TTR-204ENST00000610404 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
TTR-204ENST00000610404 KCNH4Q9UQ05 1017 aa11.02□□□□□ -0.65
TTR-204ENST00000610404 MYPNQ86TC9 1320 aa11.02□□□□□ -0.65
TTR-204ENST00000610404 SOBPA7XYQ1 873 aa11.01□□□□□ -0.65
TTR-204ENST00000610404 MAN1A2O60476 641 aa11.01□□□□□ -0.65
TTR-204ENST00000610404 PRKCZQ05513 592 aa11.01□□□□□ -0.65
TTR-204ENST00000610404 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
TTR-204ENST00000610404 CAVIN4Q5BKX8 364 aa11.01□□□□□ -0.65
TTR-204ENST00000610404 METTL24Q5JXM2 366 aa11.01□□□□□ -0.65
TTR-204ENST00000610404 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa11.01□□□□□ -0.65
TTR-204ENST00000610404 WDR63Q8IWG1 891 aa11.01□□□□□ -0.65
TTR-204ENST00000610404 ANKRD44Q8N8A2 993 aa11.01□□□□□ -0.65
TTR-204ENST00000610404 KLHDC4Q8TBB5 520 aa11.01□□□□□ -0.65
TTR-204ENST00000610404 HOOK2Q96ED9 719 aa11.01□□□□□ -0.65
TTR-204ENST00000610404 RNF208Q9H0X6 261 aa11.01□□□□□ -0.65
TTR-204ENST00000610404 ZNF112Q9UJU3 913 aa11.01□□□□□ -0.65
TTR-204ENST00000610404 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms