RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608287.1

SGMS1-208, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-208ENST00000608287 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
SGMS1-208ENST00000608287 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
SGMS1-208ENST00000608287 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
SGMS1-208ENST00000608287 SEMA6BQ9H3T3 888 aa23.36■■□□□ 1.33
SGMS1-208ENST00000608287 FAM196BA6NMK8 535 aa23.35■■□□□ 1.33
SGMS1-208ENST00000608287 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
SGMS1-208ENST00000608287 ZAP70P43403 619 aa23.35■■□□□ 1.33
SGMS1-208ENST00000608287 RHBDL3P58872 404 aa23.35■■□□□ 1.33
SGMS1-208ENST00000608287 MORN1Q5T089 497 aa23.35■■□□□ 1.33
SGMS1-208ENST00000608287 LPAR1Q92633 364 aa23.35■■□□□ 1.33
SGMS1-208ENST00000608287 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
SGMS1-208ENST00000608287 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
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SGMS1-208ENST00000608287 USP17L10C9JJH3 530 aa23.34■■□□□ 1.33
SGMS1-208ENST00000608287 SLURP2P0DP57 97 aa23.34■■□□□ 1.33
SGMS1-208ENST00000608287 FOSL2P15408 326 aa23.34■■□□□ 1.33
SGMS1-208ENST00000608287 MAP2K5Q13163 448 aa23.34■■□□□ 1.33
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF384Q8TF68 577 aa23.34■■□□□ 1.33
SGMS1-208ENST00000608287 TRIM34Q9BYJ4 488 aa23.34■■□□□ 1.33
SGMS1-208ENST00000608287 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
SGMS1-208ENST00000608287 LTBP2Q14767 1821 aa23.33■■□□□ 1.33
SGMS1-208ENST00000608287 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
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SGMS1-208ENST00000608287 TXNRD2Q9NNW7 524 aa23.33■■□□□ 1.33
SGMS1-208ENST00000608287 CRBNQ96SW2 442 aa23.32■■□□□ 1.32
SGMS1-208ENST00000608287 TTC28Q96AY4 2481 aa23.32■■□□□ 1.32
SGMS1-208ENST00000608287 RTP1P59025 263 aa23.31■■□□□ 1.32
SGMS1-208ENST00000608287 CCL14Q16627 93 aa23.31■■□□□ 1.32
SGMS1-208ENST00000608287 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
SGMS1-208ENST00000608287 ARRDC4Q8NCT1 418 aa23.31■■□□□ 1.32
SGMS1-208ENST00000608287 PAGR1Q9BTK6 254 aa23.31■■□□□ 1.32
SGMS1-208ENST00000608287 RBPJLQ9UBG7 517 aa23.31■■□□□ 1.32
SGMS1-208ENST00000608287 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa23.31■■□□□ 1.32
SGMS1-208ENST00000608287 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa23.31■■□□□ 1.32
SGMS1-208ENST00000608287 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
SGMS1-208ENST00000608287 PLCG2P16885 1265 aa23.3■■□□□ 1.32
SGMS1-208ENST00000608287 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
SGMS1-208ENST00000608287 TJAP1Q5JTD0 557 aa23.3■■□□□ 1.32
SGMS1-208ENST00000608287 TEX11Q8IYF3 940 aa23.3■■□□□ 1.32
SGMS1-208ENST00000608287 LRRCC1Q9C099 1032 aa23.3■■□□□ 1.32
SGMS1-208ENST00000608287 PORCNQ9H237 461 aa23.3■■□□□ 1.32
SGMS1-208ENST00000608287 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
SGMS1-208ENST00000608287 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa23.3■■□□□ 1.32
SGMS1-208ENST00000608287 SLC15A5A6NIM6 579 aa23.29■■□□□ 1.32
SGMS1-208ENST00000608287 KBTBD13C9JR72 458 aa23.29■■□□□ 1.32
SGMS1-208ENST00000608287 CNGA1P29973 690 aa23.29■■□□□ 1.32
SGMS1-208ENST00000608287 ATP2B2Q01814 1243 aa23.29■■□□□ 1.32
SGMS1-208ENST00000608287 MYLIPQ8WY64 445 aa23.29■■□□□ 1.32
SGMS1-208ENST00000608287 COL9A1P20849 921 aa23.28■■□□□ 1.32
SGMS1-208ENST00000608287 SHHQ15465 462 aa23.28■■□□□ 1.32
SGMS1-208ENST00000608287 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
SGMS1-208ENST00000608287 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa23.28■■□□□ 1.32
SGMS1-208ENST00000608287 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa23.28■■□□□ 1.32
SGMS1-208ENST00000608287 VCANP13611 3396 aa23.28■■□□□ 1.32
SGMS1-208ENST00000608287 TNFRSF10AO00220 468 aa23.27■■□□□ 1.32
SGMS1-208ENST00000608287 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
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SGMS1-208ENST00000608287 Q3C1V9 767 aa23.27■■□□□ 1.32
SGMS1-208ENST00000608287 USP17L2Q6R6M4 530 aa23.27■■□□□ 1.32
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SGMS1-208ENST00000608287 ANTXR1Q9H6X2 564 aa23.27■■□□□ 1.32
SGMS1-208ENST00000608287 DCTPP1Q9H773 170 aa23.27■■□□□ 1.32
SGMS1-208ENST00000608287 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
SGMS1-208ENST00000608287 IGSF3O75054 1194 aa23.26■■□□□ 1.31
SGMS1-208ENST00000608287 HOXC6P09630 235 aa23.26■■□□□ 1.31
SGMS1-208ENST00000608287 WDR78Q5VTH9 848 aa23.26■■□□□ 1.31
SGMS1-208ENST00000608287 RLFQ13129 1914 aa23.25■■□□□ 1.31
SGMS1-208ENST00000608287 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
SGMS1-208ENST00000608287 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP23.25■■□□□ 1.31
SGMS1-208ENST00000608287 CYP7A1P22680 504 aa23.24■■□□□ 1.31
SGMS1-208ENST00000608287 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa23.24■■□□□ 1.31
SGMS1-208ENST00000608287 ADGRA1Q86SQ6 560 aa23.24■■□□□ 1.31
SGMS1-208ENST00000608287 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
SGMS1-208ENST00000608287 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP23.24■■□□□ 1.31
SGMS1-208ENST00000608287 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
SGMS1-208ENST00000608287 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
SGMS1-208ENST00000608287 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa23.24■■□□□ 1.31
SGMS1-208ENST00000608287 USP17L15C9J2P7 530 aa23.23■■□□□ 1.31
SGMS1-208ENST00000608287 USP17L13C9JLJ4 530 aa23.23■■□□□ 1.31
SGMS1-208ENST00000608287 USP17L11C9JVI0 530 aa23.23■■□□□ 1.31
SGMS1-208ENST00000608287 USP17L18D6R9N7 530 aa23.23■■□□□ 1.31
SGMS1-208ENST00000608287 USP17L22D6RA61 530 aa23.23■■□□□ 1.31
SGMS1-208ENST00000608287 USP17L17D6RBQ6 530 aa23.23■■□□□ 1.31
SGMS1-208ENST00000608287 USP17L19D6RCP7 530 aa23.23■■□□□ 1.31
SGMS1-208ENST00000608287 USP17L20D6RJB6 530 aa23.23■■□□□ 1.31
SGMS1-208ENST00000608287 HLA-DOAP06340 250 aa23.23■■□□□ 1.31
SGMS1-208ENST00000608287 PTPREP23469 700 aa23.23■■□□□ 1.31
SGMS1-208ENST00000608287 USP14P54578 494 aa23.23■■□□□ 1.31
SGMS1-208ENST00000608287 USP17L24Q0WX57 530 aa23.23■■□□□ 1.31
SGMS1-208ENST00000608287 MAP3K12Q12852 859 aa23.23■■□□□ 1.31
SGMS1-208ENST00000608287 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
SGMS1-208ENST00000608287 C9orf50Q5SZB4 431 aa23.23■■□□□ 1.31
SGMS1-208ENST00000608287 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
SGMS1-208ENST00000608287 BADQ92934 168 aa23.23■■□□□ 1.31
SGMS1-208ENST00000608287 FEZ1Q99689 392 aa23.23■■□□□ 1.31
SGMS1-208ENST00000608287 PEX10O60683 326 aa23.22■■□□□ 1.31
SGMS1-208ENST00000608287 GRB14Q14449 540 aa23.22■■□□□ 1.31
SGMS1-208ENST00000608287 SNX17Q15036 470 aa23.22■■□□□ 1.31
SGMS1-208ENST00000608287 C1orf53Q5VUE5 145 aa23.22■■□□□ 1.31
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