RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592446.1

CNP-211, Transcript of 2',3'-cyclic nucleotide 3' phosphodiesterase, humanhuman

TSL 4

Gene CNP, Length 587 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNP-211ENST00000592446 PEX10O60683 326 aa28.25■■■□□ 2.11
CNP-211ENST00000592446 CDK8P49336 464 aa28.25■■■□□ 2.11
CNP-211ENST00000592446 MTFR1Q15390 333 aa28.25■■■□□ 2.11
CNP-211ENST00000592446 TXNRD2Q9NNW7 524 aa28.25■■■□□ 2.11
CNP-211ENST00000592446 RBPJLQ9UBG7 517 aa28.25■■■□□ 2.11
CNP-211ENST00000592446 CENPFP49454 3210 aa28.25■■■□□ 2.11
CNP-211ENST00000592446 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa28.25■■■□□ 2.11
CNP-211ENST00000592446 SALL3Q9BXA9 1300 aa28.24■■■□□ 2.11
CNP-211ENST00000592446 GSG1L2A8MUP6 293 aa28.24■■■□□ 2.11
CNP-211ENST00000592446 USP17L15C9J2P7 530 aa28.24■■■□□ 2.11
CNP-211ENST00000592446 USP17L13C9JLJ4 530 aa28.24■■■□□ 2.11
CNP-211ENST00000592446 USP17L11C9JVI0 530 aa28.24■■■□□ 2.11
CNP-211ENST00000592446 USP17L18D6R9N7 530 aa28.24■■■□□ 2.11
CNP-211ENST00000592446 USP17L22D6RA61 530 aa28.24■■■□□ 2.11
CNP-211ENST00000592446 USP17L17D6RBQ6 530 aa28.24■■■□□ 2.11
CNP-211ENST00000592446 USP17L19D6RCP7 530 aa28.24■■■□□ 2.11
CNP-211ENST00000592446 USP17L20D6RJB6 530 aa28.24■■■□□ 2.11
CNP-211ENST00000592446 USP17L24Q0WX57 530 aa28.24■■■□□ 2.11
CNP-211ENST00000592446 IRF5Q13568 498 aa28.24■■■□□ 2.11
CNP-211ENST00000592446 POTEEQ6S8J3 1075 aa28.24■■■□□ 2.11
CNP-211ENST00000592446 TMEM179Q6ZVK1 233 aa28.24■■■□□ 2.11
CNP-211ENST00000592446 C16orf86Q6ZW13 317 aa28.24■■■□□ 2.11
CNP-211ENST00000592446 SLAIN1Q8ND83 568 aa28.24■■■□□ 2.11
CNP-211ENST00000592446 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
CNP-211ENST00000592446 A0A1W2PRG0 241 aa28.23■■■□□ 2.11
CNP-211ENST00000592446 ADCY3O60266 1144 aa28.23■■■□□ 2.11
CNP-211ENST00000592446 AKR1B1P15121 316 aa28.23■■■□□ 2.11
CNP-211ENST00000592446 VCAM1P19320 739 aa28.23■■■□□ 2.11
CNP-211ENST00000592446 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
CNP-211ENST00000592446 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa28.23■■■□□ 2.11
CNP-211ENST00000592446 CCDC17Q96LX7 622 aa28.23■■■□□ 2.11
CNP-211ENST00000592446 GPAA1O43292 621 aa28.22■■■□□ 2.11
CNP-211ENST00000592446 GIMAP6Q6P9H5 292 aa28.22■■■□□ 2.11
CNP-211ENST00000592446 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa28.22■■■□□ 2.11
CNP-211ENST00000592446 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
CNP-211ENST00000592446 PTPRFP10586 1907 aa28.22■■■□□ 2.11
CNP-211ENST00000592446 M0R2C6 588 aa28.21■■■□□ 2.11
CNP-211ENST00000592446 SBK1Q52WX2 424 aa28.21■■■□□ 2.11
CNP-211ENST00000592446 SIAH1Q8IUQ4 282 aa28.21■■■□□ 2.11
CNP-211ENST00000592446 PXYLP1Q8TE99 480 aa28.21■■■□□ 2.11
CNP-211ENST00000592446 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
CNP-211ENST00000592446 GJD2Q9UKL4 321 aa28.21■■■□□ 2.11
CNP-211ENST00000592446 LOC285556D6RIA3 1793 aa28.21■■■□□ 2.11
CNP-211ENST00000592446 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
CNP-211ENST00000592446 ELNP15502 786 aa28.2■■■□□ 2.1
CNP-211ENST00000592446 UBXN2AP68543 259 aa28.2■■■□□ 2.1
CNP-211ENST00000592446 Q3C1V9 767 aa28.2■■■□□ 2.1
CNP-211ENST00000592446 EXOC6Q8TAG9 804 aa28.2■■■□□ 2.1
CNP-211ENST00000592446 FSD1Q9BTV5 496 aa28.2■■■□□ 2.1
CNP-211ENST00000592446 STAP2Q9UGK3 403 aa28.2■■■□□ 2.1
CNP-211ENST00000592446 CCL5P13501 91 aa28.19■■■□□ 2.1
CNP-211ENST00000592446 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
CNP-211ENST00000592446 PAGR1Q9BTK6 254 aa28.19■■■□□ 2.1
CNP-211ENST00000592446 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
CNP-211ENST00000592446 MYH1P12882 1939 aa28.19■■■□□ 2.1
CNP-211ENST00000592446 ATAD5Q96QE3 1844 aa28.18■■■□□ 2.1
CNP-211ENST00000592446 GNAT2P19087 354 aa28.18■■■□□ 2.1
CNP-211ENST00000592446 PDE1AP54750 535 aa28.18■■■□□ 2.1
CNP-211ENST00000592446 ERVK-9P63128 1117 aa28.18■■■□□ 2.1
CNP-211ENST00000592446 ERVK-24P63145 666 aa28.18■■■□□ 2.1
CNP-211ENST00000592446 CLEC10AQ8IUN9 316 aa28.18■■■□□ 2.1
CNP-211ENST00000592446 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
CNP-211ENST00000592446 ICA1Q05084 483 aa28.17■■■□□ 2.1
CNP-211ENST00000592446 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa28.17■■■□□ 2.1
CNP-211ENST00000592446 RNF208Q9H0X6 261 aa28.17■■■□□ 2.1
CNP-211ENST00000592446 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
CNP-211ENST00000592446 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa28.17■■■□□ 2.1
CNP-211ENST00000592446 MINDY4BA8MYZ0 360 aa28.16■■■□□ 2.1
CNP-211ENST00000592446 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
CNP-211ENST00000592446 CNMDO75829 334 aa28.16■■■□□ 2.1
CNP-211ENST00000592446 APPP05067 770 aa28.16■■■□□ 2.1
CNP-211ENST00000592446 INHAP05111 366 aa28.16■■■□□ 2.1
CNP-211ENST00000592446 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa28.16■■■□□ 2.1
CNP-211ENST00000592446 SMC5Q8IY18 1101 aa28.16■■■□□ 2.1
CNP-211ENST00000592446 PORCNQ9H237 461 aa28.16■■■□□ 2.1
CNP-211ENST00000592446 TMX2Q9Y320 296 aa28.16■■■□□ 2.1
CNP-211ENST00000592446 GJB1P08034 283 aa28.15■■■□□ 2.1
CNP-211ENST00000592446 MAPK4P31152 587 aa28.15■■■□□ 2.1
CNP-211ENST00000592446 LBX2Q6XYB7 198 aa28.15■■■□□ 2.1
CNP-211ENST00000592446 UNC93B1Q9H1C4 597 aa28.15■■■□□ 2.1
CNP-211ENST00000592446 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa28.15■■■□□ 2.1
CNP-211ENST00000592446 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
CNP-211ENST00000592446 IGHDP01880 384 aa28.14■■■□□ 2.1
CNP-211ENST00000592446 TDO2P48775 406 aa28.14■■■□□ 2.1
CNP-211ENST00000592446 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
CNP-211ENST00000592446 STK11IPQ8N1F8 1099 aa28.14■■■□□ 2.1
CNP-211ENST00000592446 EVI5LQ96CN4 794 aa28.14■■■□□ 2.1
CNP-211ENST00000592446 LNPKQ9C0E8 428 aa28.14■■■□□ 2.1
CNP-211ENST00000592446 KANSL2Q9H9L4 492 aa28.14■■■□□ 2.1
CNP-211ENST00000592446 BRCA2P51587 3418 aa28.14■■■□□ 2.1
CNP-211ENST00000592446 NAV1Q8NEY1 1877 aa28.14■■■□□ 2.1
CNP-211ENST00000592446 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.09
CNP-211ENST00000592446 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
CNP-211ENST00000592446 EEF2P13639 858 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
CNP-211ENST00000592446 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa28.13■■■□□ 2.09
CNP-211ENST00000592446 IFNL3Q8IZI9 196 aa28.13■■■□□ 2.09
CNP-211ENST00000592446 LPAR1Q92633 364 aa28.13■■■□□ 2.09
CNP-211ENST00000592446 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP28.13■■■□□ 2.09
CNP-211ENST00000592446 SH2D4AQ9H788 454 aa28.13■■■□□ 2.09
CNP-211ENST00000592446 RASA1P20936 1047 aa28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms