RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589636.5

BECN1-211, Transcript of beclin 1, humanhuman

TSL 4

Gene BECN1, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1-211ENST00000589636 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa18.53■□□□□ 0.56
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BECN1-211ENST00000589636 CTGFP29279 349 aa18.53■□□□□ 0.56
BECN1-211ENST00000589636 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
BECN1-211ENST00000589636 USP17L2Q6R6M4 530 aa18.53■□□□□ 0.56
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BECN1-211ENST00000589636 AMOTL1Q8IY63 956 aa18.53■□□□□ 0.56
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BECN1-211ENST00000589636 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP18.53■□□□□ 0.56
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BECN1-211ENST00000589636 MYH8P13535 1937 aa18.52■□□□□ 0.56
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BECN1-211ENST00000589636 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP18.49■□□□□ 0.55
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BECN1-211ENST00000589636 FAM110CQ1W6H9 321 aa18.47■□□□□ 0.55
BECN1-211ENST00000589636 DSCC1Q9BVC3 393 aa18.47■□□□□ 0.55
BECN1-211ENST00000589636 EFCC1Q9HA90 598 aa18.47■□□□□ 0.55
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BECN1-211ENST00000589636 ZNF287Q9HBT7 754 aa18.47■□□□□ 0.55
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BECN1-211ENST00000589636 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa18.46■□□□□ 0.55
BECN1-211ENST00000589636 USP17L15C9J2P7 530 aa18.46■□□□□ 0.55
BECN1-211ENST00000589636 USP17L13C9JLJ4 530 aa18.46■□□□□ 0.55
BECN1-211ENST00000589636 USP17L11C9JVI0 530 aa18.46■□□□□ 0.55
BECN1-211ENST00000589636 USP17L18D6R9N7 530 aa18.46■□□□□ 0.55
BECN1-211ENST00000589636 USP17L22D6RA61 530 aa18.46■□□□□ 0.55
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BECN1-211ENST00000589636 USP17L19D6RCP7 530 aa18.46■□□□□ 0.55
BECN1-211ENST00000589636 USP17L20D6RJB6 530 aa18.46■□□□□ 0.55
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BECN1-211ENST00000589636 USP17L24Q0WX57 530 aa18.46■□□□□ 0.55
BECN1-211ENST00000589636 SKAP1Q86WV1 359 aa18.46■□□□□ 0.55
BECN1-211ENST00000589636 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
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BECN1-211ENST00000589636 VCPKMTQ9H867 229 aa18.46■□□□□ 0.55
BECN1-211ENST00000589636 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa18.46■□□□□ 0.55
BECN1-211ENST00000589636 MTMR4Q9NYA4 1195 aa18.46■□□□□ 0.55
BECN1-211ENST00000589636 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa18.46■□□□□ 0.55
BECN1-211ENST00000589636 TRIM17Q9Y577 477 aa18.46■□□□□ 0.55
BECN1-211ENST00000589636 PRDM1O75626 825 aa18.45■□□□□ 0.54
BECN1-211ENST00000589636 HERVK_113P62684 666 aa18.45■□□□□ 0.54
BECN1-211ENST00000589636 NKX2-3Q8TAU0 364 aa18.45■□□□□ 0.54
BECN1-211ENST00000589636 LPAR1Q92633 364 aa18.45■□□□□ 0.54
BECN1-211ENST00000589636 TXNRD2Q9NNW7 524 aa18.45■□□□□ 0.54
BECN1-211ENST00000589636 IL17RBQ9NRM6 502 aa18.45■□□□□ 0.54
BECN1-211ENST00000589636 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa18.45■□□□□ 0.54
BECN1-211ENST00000589636 DOCK3Q8IZD9 2030 aa18.44■□□□□ 0.54
BECN1-211ENST00000589636 MGAMO43451 1857 aa18.44■□□□□ 0.54
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