RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576069.5

SPNS3-206, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS3, Length 834 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-206ENST00000576069 RASA1P20936 1047 aa23.07■■□□□ 1.28
SPNS3-206ENST00000576069 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
SPNS3-206ENST00000576069 TMOD4Q9NZQ9 345 aa23.07■■□□□ 1.28
SPNS3-206ENST00000576069 USP14P54578 494 aa23.06■■□□□ 1.28
SPNS3-206ENST00000576069 USP17L2Q6R6M4 530 aa23.06■■□□□ 1.28
SPNS3-206ENST00000576069 STK11IPQ8N1F8 1099 aa23.06■■□□□ 1.28
SPNS3-206ENST00000576069 DSCC1Q9BVC3 393 aa23.06■■□□□ 1.28
SPNS3-206ENST00000576069 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa23.06■■□□□ 1.28
SPNS3-206ENST00000576069 TLR2O60603 784 aa23.05■■□□□ 1.28
SPNS3-206ENST00000576069 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP23.05■■□□□ 1.28
SPNS3-206ENST00000576069 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
SPNS3-206ENST00000576069 KANSL2Q9H9L4 492 aa23.05■■□□□ 1.28
SPNS3-206ENST00000576069 FKTNO75072 461 aa23.04■■□□□ 1.28
SPNS3-206ENST00000576069 TREML2Q5T2D2 321 aa23.04■■□□□ 1.28
SPNS3-206ENST00000576069 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
SPNS3-206ENST00000576069 ACER1Q8TDN7 264 aa23.04■■□□□ 1.28
SPNS3-206ENST00000576069 C12orf42Q96LP6 360 aa23.04■■□□□ 1.28
SPNS3-206ENST00000576069 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
SPNS3-206ENST00000576069 EMILIN3Q9NT22 766 aa23.04■■□□□ 1.28
SPNS3-206ENST00000576069 PRDM1O75626 825 aa23.03■■□□□ 1.28
SPNS3-206ENST00000576069 FGRP09769 529 aa23.03■■□□□ 1.28
SPNS3-206ENST00000576069 CTDSPL2Q05D32 466 aa23.03■■□□□ 1.28
SPNS3-206ENST00000576069 SIAH1Q8IUQ4 282 aa23.03■■□□□ 1.28
SPNS3-206ENST00000576069 FEZ1Q99689 392 aa23.03■■□□□ 1.28
SPNS3-206ENST00000576069 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP23.03■■□□□ 1.28
SPNS3-206ENST00000576069 IL25Q9H293 177 aa23.03■■□□□ 1.28
SPNS3-206ENST00000576069 PNMA3Q9UL41 463 aa23.03■■□□□ 1.28
SPNS3-206ENST00000576069 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP23.03■■□□□ 1.28
SPNS3-206ENST00000576069 A0A1W2PRG0 241 aa23.02■■□□□ 1.28
SPNS3-206ENST00000576069 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
SPNS3-206ENST00000576069 ICA1Q05084 483 aa23.02■■□□□ 1.28
SPNS3-206ENST00000576069 SH2D4AQ9H788 454 aa23.02■■□□□ 1.28
SPNS3-206ENST00000576069 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa23.02■■□□□ 1.28
SPNS3-206ENST00000576069 CTNNA3Q9UI47 895 aa23.02■■□□□ 1.28
SPNS3-206ENST00000576069 SGSM2O43147 1006 aa23.01■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 OSBPP22059 807 aa23.01■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 SP3Q02447 781 aa23.01■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 DGKZQ13574 1117 aa23.01■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 C17orf99Q6UX52 265 aa23.01■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 TMX2Q9Y320 296 aa23.01■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 PTPRFP10586 1907 aa23.01■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 ZNF213O14771 459 aa23■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 ORC4O43929 436 aa23■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 CYP2C8P10632 490 aa23■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 PCP11498 1178 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 NEDD1Q8NHV4 660 aa23■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 ADGRA2Q96PE1 1338 aa23■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.99■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 TSPY3P0CV98 308 aa22.99■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 TSPY8P0CW00 308 aa22.99■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 EEF2P13639 858 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 TFAP4Q01664 338 aa22.99■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 INCENPQ9NQS7 918 aa22.99■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 NYAP2Q9P242 653 aa22.99■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 HAND2P61296 217 aa22.98■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 AKNAD1Q5T1N1 836 aa22.98■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 MFSD6Q6ZSS7 791 aa22.98■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 CLEC10AQ8IUN9 316 aa22.98■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 LPAR1Q92633 364 aa22.98■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 ERO1AQ96HE7 468 aa22.98■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.98■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 LOC285556D6RIA3 1793 aa22.98■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 PLIN4Q96Q06 1357 aa22.98■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 MYH8P13535 1937 aa22.98■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 USP17L15C9J2P7 530 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 USP17L11C9JVI0 530 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 USP17L18D6R9N7 530 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 USP17L22D6RA61 530 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 USP17L19D6RCP7 530 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 USP17L20D6RJB6 530 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 NT5C2P49902 561 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 USP17L24Q0WX57 530 aa22.97■■□□□ 1.27
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SPNS3-206ENST00000576069 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 STAG1Q8WVM7 1258 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 VCPKMTQ9H867 229 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 CPA4Q9UI42 421 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 TSPY2A6NKD2 308 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 BCRP11274 1271 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 VCAM1P19320 739 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 ATP2B2Q01814 1243 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 MKL1Q969V6 931 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 NBPF3Q9H094 633 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS3-206ENST00000576069 PTH1RQ03431 593 aa22.95■■□□□ 1.26
SPNS3-206ENST00000576069 ARHGEF6Q15052 776 aa22.95■■□□□ 1.26
SPNS3-206ENST00000576069 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SPNS3-206ENST00000576069 CEP95Q96GE4 821 aa22.95■■□□□ 1.26
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